39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_03487 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03487  kinase that phosphorylates core heptose of lipopolysaccharide  100 
 
 		 268 aa  553  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03439  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  546  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4131  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  99.62 
 
 		 265 aa  546  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00183874  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5000  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  99.25 
 
 		 265 aa  543  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.120387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4055  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  99.25 
 
 		 265 aa  543  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0081  lipopolysaccharide kinase  99.62 
 
 		 265 aa  546  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382008  hitchhiker  0.000743328 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3839  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  99.25 
 
 		 265 aa  545  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000421355  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3965  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  98.87 
 
 		 265 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0509856  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0075  lipopolysaccharide kinase  84.15 
 
 		 265 aa  473  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4046  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  81.51 
 
 		 265 aa  464  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.710683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  81.89 
 
 		 265 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00922523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4108  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  81.89 
 
 		 265 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.184564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3938  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  81.13 
 
 		 265 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3920  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaP  81.13 
 
 		 265 aa  461  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.773448  hitchhiker  0.00444896 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44830  Lipopolysaccharide kinase  56.7 
 
 		 271 aa  315  3e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.83472  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0369  lipopolysaccharide kinase  58.3 
 
 		 268 aa  315  4e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0344  lipopolysaccharide kinase  58.3 
 
 		 268 aa  315  5e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.048106  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0468  lipopolysaccharide kinase  58.3 
 
 		 268 aa  311  4.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0372  lipopolysaccharide kinase  57.53 
 
 		 268 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.982942  normal  0.29184 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66220  lipopolysaccharide kinase WaaP  56.37 
 
 		 268 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4859  lipopolysaccharide kinase  56.37 
 
 		 268 aa  305  7e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.59895 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5744  lipopolysaccharide kinase WaaP  56.37 
 
 		 268 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.867323  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0582  lipopolysaccharide kinase  55.98 
 
 		 265 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0422457 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5000  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaP  55.21 
 
 		 268 aa  298  9e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0523  lipopolysaccharide kinase  55.6 
 
 		 268 aa  296  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2794  lipopolysaccharide kinase  44.49 
 
 		 286 aa  208  7e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.329017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0318  lipopolysaccharide kinase  42.86 
 
 		 287 aa  203  3e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0755  lipopolysaccharide kinase  40.66 
 
 		 278 aa  203  3e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0921452 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1275  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  40.62 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1265  putative LPS biosynthesis enzyme  30.6 
 
 		 277 aa  94.7  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0901  lipopolysaccharide kinase  28.24 
 
 		 268 aa  82  0.000000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2388  hypothetical protein  29.01 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3371  hypothetical protein  29.01 
 
 		 216 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1414  hypothetical protein  29.01 
 
 		 216 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.886745  normal  0.188189 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1422  lipopolysaccharide kinase  27.48 
 
 		 216 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.814711  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02122  hypothetical protein  27.48 
 
 		 216 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02163  hypothetical protein  27.48 
 
 		 216 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2534  hypothetical protein  27.48 
 
 		 216 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2377  hypothetical protein  27.48 
 
 		 216 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>