15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_03294 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A3642  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  323  7e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0992552  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3922  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  323  7e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03294  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  323  8.000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000905809  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03247  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  259  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000940234  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0272  hypothetical protein  97.71 
 
 		 138 aa  257  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0551  hypothetical protein  28.57 
 
 		 157 aa  48.5  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.128591  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0612  hypothetical protein  28.57 
 
 		 157 aa  48.5  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2726  hypothetical protein  23.31 
 
 		 162 aa  45.4  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.263494  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1480  hypothetical protein  23.31 
 
 		 162 aa  45.4  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0502709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0550  hypothetical protein  28.46 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.332653  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0611  hypothetical protein  28.46 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0308  hypothetical protein  24.27 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.435851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0384  hypothetical protein  26.53 
 
 		 158 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000343113  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1213  hypothetical protein  26.53 
 
 		 158 aa  40.4  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000203609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0451  hypothetical protein  26.53 
 
 		 158 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0456583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>