30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02653 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A3201  L-fucose isomerase  92.89 
 
 		 591 aa  1150    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2489  L-fucose isomerase  62.31 
 
 		 593 aa  776    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02614  hypothetical protein  100 
 
 		 586 aa  1227    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2073  L-fucose isomerase  61.86 
 
 		 604 aa  782    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09570  L-fucose isomerase  65.53 
 
 		 603 aa  821    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0410  L-fucose isomerase  62.37 
 
 		 606 aa  781    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.308786  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3213  L-fucose isomerase  65.99 
 
 		 596 aa  792    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0870  L-fucose isomerase  70.07 
 
 		 590 aa  875    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4066  L-fucose isomerase  99.49 
 
 		 591 aa  1224    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.456623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3301  L-fucose isomerase  92.89 
 
 		 591 aa  1150    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3121  L-fucose isomerase  92.89 
 
 		 591 aa  1150    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.413677  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3138  L-fucose isomerase  92.72 
 
 		 591 aa  1150    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3186  L-fucose isomerase  92.72 
 
 		 591 aa  1147    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.290864  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02653  L-fucose isomerase  100 
 
 		 591 aa  1236    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1832  L-fucose isomerase  67.29 
 
 		 592 aa  837    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.275484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2943  L-fucose isomerase  98.98 
 
 		 591 aa  1225    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.301551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0910  L-fucose isomerase  98.98 
 
 		 591 aa  1225    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3155  L-fucose isomerase  59.29 
 
 		 597 aa  740    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3107  L-fucose isomerase  98.98 
 
 		 591 aa  1225    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000142364  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2946  L-fucose isomerase  98.98 
 
 		 591 aa  1225    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355752  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1448  L-fucose isomerase  67.07 
 
 		 588 aa  848    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1048  L-fucose isomerase  59.12 
 
 		 597 aa  744    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0886  L-fucose isomerase  99.15 
 
 		 591 aa  1226    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3069  L-fucose isomerase  98.31 
 
 		 65 aa  126  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00585923  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1608  L-fucose isomerase-like protein  24.09 
 
 		 471 aa  102  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3126  L-fucose isomerase 2 domain-containing protein  24.53 
 
 		 470 aa  92.8  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0738965  normal  0.0115763 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0610  L-fucose isomerase N-terminal_2 domain-containing protein  23.4 
 
 		 473 aa  90.5  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.194613  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0624  L-fucose isomerase 1 domain-containing protein  23.4 
 
 		 473 aa  87.8  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3985  L-fucose isomerase _2 domain protein  22.93 
 
 		 471 aa  84.3  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.372603  normal  0.849599 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0832  L-fucose isomerase  22.93 
 
 		 477 aa  57.4  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0071314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>