30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02300 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02300  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  216  8.999999999999998e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1267  conserved hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  216  8.999999999999998e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.389303  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02261  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  216  8.999999999999998e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3622  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  216  8.999999999999998e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.669652  normal  0.697764 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2759  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  216  8.999999999999998e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1279  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  216  8.999999999999998e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.887196  normal  0.128459 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2542  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  216  8.999999999999998e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234991  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2681  hypothetical protein  98.15 
 
 
108 aa  212  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146587  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2925  hypothetical protein  85 
 
 
115 aa  173  7e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2771  hypothetical protein  91.67 
 
 
108 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.466623  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2550  hypothetical protein  91.67 
 
 
108 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.539184  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2641  hypothetical protein  91.67 
 
 
108 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2665  hypothetical protein  91.67 
 
 
108 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2599  hypothetical protein  91.67 
 
 
108 aa  164  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3650  hypothetical protein  61.54 
 
 
98 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00005  hypothetical protein  61.54 
 
 
98 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00005  hypothetical protein  61.54 
 
 
98 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3591  conserved hypothetical protein  61.54 
 
 
98 aa  90.9  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0006  hypothetical protein  60 
 
 
98 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0736332  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0567  hypothetical protein  46.32 
 
 
98 aa  86.7  9e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1440  hypothetical protein  43.2 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.591275  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1328  hypothetical protein  43.2 
 
 
137 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0457315  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3425  hypothetical protein  36.78 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.199084  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3583  Protein of unknown function DUF2502  37.93 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000921365  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3414  hypothetical protein  37.93 
 
 
133 aa  55.5  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.824951  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0781  hypothetical protein  45.76 
 
 
121 aa  46.2  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0042632  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1827  hypothetical protein  31.46 
 
 
152 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2617  hypothetical protein  31.46 
 
 
152 aa  44.7  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.597605  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1719  hypothetical protein  31.46 
 
 
152 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00113382  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2733  hypothetical protein  66.67 
 
 
96 aa  44.7  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.504136  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>