48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02117 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_1470  protein of unknown function DUF1414  100 
 
 
75 aa  152  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000754403  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02076  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  152  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0804802  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3326  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  152  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0793311  normal  0.734351 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0770  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  152  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.246584  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1460  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  152  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0962949  normal  0.661728 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02117  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  152  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0476905  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2326  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  152  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0610812  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2337  hypothetical protein  98.67 
 
 
75 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0450206  normal  0.121896 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2486  hypothetical protein  98.67 
 
 
75 aa  149  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0690382  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3256  hypothetical protein  81.33 
 
 
86 aa  129  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000436018  normal  0.750578 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2722  hypothetical protein  80 
 
 
75 aa  127  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0242582  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2797  hypothetical protein  80 
 
 
75 aa  127  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000489425  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1485  hypothetical protein  80 
 
 
75 aa  127  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0286043  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2783  hypothetical protein  82.67 
 
 
75 aa  127  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.222088  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1904  hypothetical protein  80.26 
 
 
76 aa  123  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1633  hypothetical protein  80.26 
 
 
76 aa  123  7e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.596198  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2466  hypothetical protein  90.67 
 
 
75 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.299137  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2464  hypothetical protein  90.67 
 
 
75 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000800068 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2376  hypothetical protein  90.67 
 
 
75 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00669693  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2578  hypothetical protein  90.67 
 
 
75 aa  122  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.157197  normal  0.0308345 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2421  hypothetical protein  89.33 
 
 
75 aa  121  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.190242 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2360  hypothetical protein  69.33 
 
 
75 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2446  hypothetical protein  72.37 
 
 
76 aa  110  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0032449  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002923  hypothetical protein  53.33 
 
 
75 aa  86.7  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2535  hypothetical protein  60.61 
 
 
72 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0122735  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2650  hypothetical protein  60.61 
 
 
85 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0015514  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1816  hypothetical protein  60.61 
 
 
85 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00186023  normal  0.0721744 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2528  hypothetical protein  60.61 
 
 
85 aa  84.3  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0530649  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03027  hypothetical protein  53.33 
 
 
75 aa  84  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2218  hypothetical protein  57.35 
 
 
72 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0580421  normal  0.335834 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2176  hypothetical protein  57.35 
 
 
72 aa  82  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2294  hypothetical protein  57.35 
 
 
72 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00528693  normal  0.921286 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2427  hypothetical protein  57.35 
 
 
72 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00221266  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1058  hypothetical protein  50.7 
 
 
75 aa  82  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2289  hypothetical protein  57.35 
 
 
72 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000159442  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0229  hypothetical protein  50.68 
 
 
73 aa  81.3  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1556  hypothetical protein  55.22 
 
 
72 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000000138593  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1625  hypothetical protein  55.07 
 
 
71 aa  79  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000679982  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2336  hypothetical protein  56.06 
 
 
70 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000721777  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2492  hypothetical protein  54.55 
 
 
70 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00401591  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1764  hypothetical protein  53.03 
 
 
71 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1471  hypothetical protein  53.03 
 
 
71 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000313396  normal  0.895437 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01910  hypothetical protein  49.28 
 
 
72 aa  72.4  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.225922  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2786  hypothetical protein  50 
 
 
71 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000152883  normal  0.960019 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1809  hypothetical protein  50 
 
 
71 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0011331  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3379  hypothetical protein  45.71 
 
 
72 aa  68.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2268  hypothetical protein  44.29 
 
 
76 aa  67.4  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0782406  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2611  hypothetical protein  43.48 
 
 
68 aa  65.1  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.193007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>