12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1863 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1863  DNA polymerase III, delta  100 
 
 		 329 aa  663    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3088  hypothetical protein  65.31 
 
 		 383 aa  449  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.625478 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2441  hypothetical protein  55.31 
 
 		 324 aa  343  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1624  DNA polymerase III delta  47.04 
 
 		 346 aa  297  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1427  DNA polymerase III delta  43.65 
 
 		 322 aa  251  1e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000845045  normal  0.101113 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0055  DNA polymerase III, delta  38.73 
 
 		 317 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000601887  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  23.84 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  23.04 
 
 		 344 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  21.72 
 
 		 334 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  20.36 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1119  DNA polymerase III subunit delta  32.2 
 
 		 345 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  24.07 
 
 		 348 aa  42.7  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>