119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0975 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0975  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  551  1e-156  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000600657 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3433  hypothetical protein  39.64 
 
 
295 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302271  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4022  hypothetical protein  41.88 
 
 
297 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46700  hypothetical protein  41.52 
 
 
297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.022597  decreased coverage  0.000000235263 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2637  hypothetical protein  40.52 
 
 
320 aa  183  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000608588  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2875  threonine and homoserine efflux system  38.91 
 
 
293 aa  180  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00290146  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3085  hypothetical protein  43.88 
 
 
295 aa  179  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0753098  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2514  hypothetical protein  44.49 
 
 
283 aa  177  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292339  normal  0.385218 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1861  hypothetical protein  41.99 
 
 
297 aa  177  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.654734  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0883  threonine and homoserine efflux system  40.15 
 
 
295 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000921417  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2830  threonine and homoserine efflux system  40.15 
 
 
295 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0962  threonine and homoserine efflux system  40.15 
 
 
299 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0232509  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00780  threonine and homoserine efflux system  40.15 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2829  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.15 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0520778  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0870  threonine and homoserine efflux system  40.15 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096225  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2535  threonine and homoserine efflux system  40.15 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000316984  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00797  hypothetical protein  40.15 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01032  Transporter involved in threonine and homoserine efflux  39.78 
 
 
290 aa  172  5e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.614417  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1964  hypothetical protein  44.49 
 
 
314 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0837  threonine and homoserine efflux system  39.78 
 
 
295 aa  171  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0124814  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1587  threonine and homoserine efflux system  39.35 
 
 
295 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00642491  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1768  threonine and homoserine efflux system  38.38 
 
 
293 aa  169  5e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000270946  normal  0.0166943 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1605  threonine and homoserine efflux system  38.38 
 
 
295 aa  169  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140132  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3217  hypothetical protein  38.93 
 
 
295 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00240946  normal  0.367781 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3904  hypothetical protein  38.21 
 
 
295 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544421  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1300  threonine and homoserine efflux system  38.6 
 
 
295 aa  168  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.332206  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0929  hypothetical protein  40.91 
 
 
292 aa  167  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3499  hypothetical protein  40.07 
 
 
295 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135558  normal  0.669558 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1500  threonine and homoserine efflux system  38.03 
 
 
295 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.6519e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2239  EamA family protein  40.07 
 
 
295 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0001908  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1863  hypothetical protein  39.7 
 
 
295 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000217515  normal  0.404567 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2390  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.79 
 
 
288 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0068  hypothetical protein  43.94 
 
 
289 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2634  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.18 
 
 
280 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2802  hypothetical protein  42.44 
 
 
278 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10684  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0961  threonine and homoserine efflux system  40.96 
 
 
295 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0982  threonine and homoserine efflux system  40.96 
 
 
295 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8572  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.41 
 
 
305 aa  165  9e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257363  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0646  hypothetical protein  44.64 
 
 
296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.140309 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0898  threonine and homoserine efflux system  40.96 
 
 
295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0870  threonine and homoserine efflux system  40.96 
 
 
295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4738  hypothetical protein  38.89 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0657  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.37 
 
 
296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4814  threonine and homoserine efflux system  38.61 
 
 
288 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.369871  normal  0.894599 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.5 
 
 
293 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.232417  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0196  hypothetical protein  39.34 
 
 
305 aa  161  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.389436  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2617  hypothetical protein  44.91 
 
 
289 aa  159  6e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3044  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.18 
 
 
285 aa  159  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4855  hypothetical protein  37.68 
 
 
285 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2766  hypothetical protein  38.43 
 
 
281 aa  158  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.830467  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1483  threonine and homoserine efflux system  40.22 
 
 
295 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3407  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.81 
 
 
291 aa  156  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.615579 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.82 
 
 
282 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317569  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1197  hypothetical protein  43.89 
 
 
295 aa  152  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.514706 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0928  threonine and homoserine efflux system  39.71 
 
 
286 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2840  hypothetical protein  38.34 
 
 
300 aa  149  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316251  normal  0.316711 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0625  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.06 
 
 
296 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378272  normal  0.900274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5994  hypothetical protein  38.95 
 
 
305 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0942193  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3181  hypothetical protein  37.45 
 
 
281 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.547943  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3168  hypothetical protein  43.15 
 
 
290 aa  135  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.302712  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3928  hypothetical protein  41.9 
 
 
301 aa  135  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.501221  normal  0.176255 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0094  hypothetical protein  36.8 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.73224  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2969  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.45 
 
 
315 aa  132  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1976  hypothetical protein  39.1 
 
 
298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.487154 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5800  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.04 
 
 
322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3425  hypothetical protein  38.81 
 
 
292 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17200  predicted permease, DMT superfamily  34.78 
 
 
358 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0071959  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1578  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.24 
 
 
301 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2958  hypothetical protein  39.86 
 
 
303 aa  119  7e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.395284  normal  0.675669 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1994  putative integral membrane protein  41.81 
 
 
300 aa  117  3e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2507  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.72 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2218  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.85 
 
 
305 aa  105  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000223898  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01360  predicted permease, DMT superfamily  30.85 
 
 
301 aa  99  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.554543  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0130  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.16 
 
 
325 aa  99  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0233351  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4262  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.14 
 
 
297 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2658  hypothetical protein  32.32 
 
 
297 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2703  hypothetical protein  32.32 
 
 
297 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.75974  normal  0.0221892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2688  hypothetical protein  32.32 
 
 
297 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2981  DMT family permease  31.1 
 
 
296 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190114  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2172  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.74 
 
 
314 aa  94  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.03 
 
 
288 aa  94  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13040  predicted permease, DMT superfamily  38.22 
 
 
293 aa  92.4  8e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0141388  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2543  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.62 
 
 
308 aa  91.3  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  normal  0.409771 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1557  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.82 
 
 
319 aa  90.9  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7811  hypothetical protein  32.64 
 
 
306 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2072  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.95 
 
 
327 aa  90.1  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3392  hypothetical protein  36.29 
 
 
277 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529802  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1460  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.74 
 
 
296 aa  89.7  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4527  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.18 
 
 
303 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0952883 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3133  hypothetical protein  37.45 
 
 
288 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.786366  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1846  hypothetical protein  33.47 
 
 
298 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000284209 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02390  predicted permease, DMT superfamily  36.92 
 
 
294 aa  82.4  0.000000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.857756  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3333  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.97 
 
 
293 aa  81.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222315  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3478  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.51 
 
 
295 aa  81.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.89326 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0100  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.55 
 
 
330 aa  79  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4267  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.42 
 
 
327 aa  75.5  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0357814  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34860  predicted permease, DMT superfamily  32.41 
 
 
288 aa  72.8  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1687  threonine/homoserine efflux transporter  29.55 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1425  putative integral membrane protein  33.59 
 
 
330 aa  68.9  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3179  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.62 
 
 
288 aa  65.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.047355 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>