26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0513 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0513  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 421 aa  861    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0162145 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1612  hypothetical protein  50.37 
 
 		 483 aa  402  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0922  hypothetical protein  27.19 
 
 		 434 aa  171  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.159018  normal  0.919673 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3145  hypothetical protein  26.15 
 
 		 435 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000246792  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1718  hypothetical protein  27.6 
 
 		 394 aa  101  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.61 
 
 		 1465 aa  63.9  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1673  sensory box protein  25.24 
 
 		 1346 aa  60.1  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.338574  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2184  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  32.73 
 
 		 832 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.425647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2727  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 576 aa  54.7  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 		 1177 aa  54.3  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1659  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  32.71 
 
 		 833 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0467119  normal  0.0611646 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.47 
 
 		 1267 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.14 
 
 		 1113 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2487  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  28.04 
 
 		 1535 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.162467  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0030  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.64 
 
 		 833 aa  50.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6450  signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 635 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.41 
 
 		 1108 aa  49.7  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2814  putative PAS/PAC sensor protein  34.92 
 
 		 1335 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3102  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.56 
 
 		 1418 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09680  putative two-component sensor  30.71 
 
 		 758 aa  47  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0280017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2975  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.95 
 
 		 1084 aa  46.6  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 527 aa  46.6  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6856  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 1000 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4608  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 1645 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.284957  normal  0.407853 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.52 
 
 		 647 aa  43.9  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2187  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.62 
 
 		 705 aa  44.3  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>