10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3088 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_3088  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  757    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.625478 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1863  DNA polymerase III, delta  65.31 
 
 		 329 aa  428  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2441  hypothetical protein  54.09 
 
 		 324 aa  356  5e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1624  DNA polymerase III delta  47.16 
 
 		 346 aa  298  8e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1427  DNA polymerase III delta  42.03 
 
 		 322 aa  257  3e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000845045  normal  0.101113 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0055  DNA polymerase III, delta  35.91 
 
 		 317 aa  207  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000601887  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  26.01 
 
 		 332 aa  50.1  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0179  DNA polymerase III, delta subunit  25.56 
 
 		 331 aa  49.7  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  24.18 
 
 		 337 aa  45.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  20.27 
 
 		 331 aa  42.7  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>