15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2806 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2806  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  373  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1691  Protein of unknown function DUF2148  43.09 
 
 
174 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0970  ferredoxin domain-containing protein  43.02 
 
 
171 aa  143  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1023  hypothetical protein  44.57 
 
 
174 aa  140  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00017517  unclonable  0.00000000437518 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1449  Fe-S cluster domain-containing protein  37.63 
 
 
186 aa  132  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0158204  normal  0.046981 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2606  hypothetical protein  40.78 
 
 
192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0714657  normal  0.552575 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0098  hypothetical protein  38.12 
 
 
181 aa  122  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1825  hypothetical protein  41.48 
 
 
186 aa  121  5e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.66938 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1081  hypothetical protein  37.78 
 
 
183 aa  114  6e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.15427  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0095  hypothetical protein  55.14 
 
 
113 aa  107  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.00000777984 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0931  hypothetical protein  35.36 
 
 
195 aa  106  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.148155  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2500  hypothetical protein  37.43 
 
 
185 aa  103  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.120376  normal  0.416305 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1130  hypothetical protein  34.44 
 
 
185 aa  99  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136033  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1498  ferredoxin domain-containing protein  34.29 
 
 
161 aa  90.9  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.69084e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2899  conserved ferredoxin domain protein  37.29 
 
 
177 aa  89.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>