More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2566 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2566  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  100 
 
 
414 aa  816    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0465  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  63.81 
 
 
410 aa  491  9.999999999999999e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.870192  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0500  phosphate ABC transporter permease  60.29 
 
 
414 aa  467  9.999999999999999e-131  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0377  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  62.01 
 
 
413 aa  450  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.746204  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2680  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  60.14 
 
 
409 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.392493  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1858  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  54.36 
 
 
418 aa  437  1e-121  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1477  phosphate ABC transporter permease  54.11 
 
 
418 aa  432  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3317  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  59.69 
 
 
464 aa  377  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0599  phosphate ABC transporter permease  49.67 
 
 
465 aa  372  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.070485  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0395  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.56 
 
 
459 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1072  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  60.06 
 
 
459 aa  367  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.335242  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1539  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  60.95 
 
 
460 aa  365  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00102463  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0479  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  59.81 
 
 
566 aa  359  5e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.414974  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3628  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  59.37 
 
 
462 aa  355  5.999999999999999e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.560557  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3754  phosphate ABC transporter, permease protein  58.9 
 
 
465 aa  353  4e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.46452 
 
 
-
 
NC_004310  BR2139  phosphate ABC transporter, permease protein  55.45 
 
 
496 aa  351  1e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2054  phosphate ABC transporter, permease protein  55.45 
 
 
496 aa  351  1e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.186567  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2408  ABC phosphate transporter inner membrane protein, PstC-like protein  57.41 
 
 
468 aa  350  2e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0593357 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0770  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  55.52 
 
 
497 aa  349  7e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0798935  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1232  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.15 
 
 
462 aa  347  2e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.68269  normal  0.54486 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0169  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  56.42 
 
 
493 aa  345  7e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.516158 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0179  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  55.95 
 
 
493 aa  345  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.558643 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2277  phosphate ABC transporter permease  57.01 
 
 
460 aa  340  2e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0658317  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0120  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  56.8 
 
 
494 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.268456 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3120  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  55.17 
 
 
456 aa  340  4e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43315  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4550  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  54.85 
 
 
480 aa  338  9e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1534  phosphate transport system permease protein  54.98 
 
 
489 aa  336  5.999999999999999e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.718662  normal  0.490878 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1227  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  53.37 
 
 
486 aa  334  2e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.696312  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0825  phosphate ABC transporter permease  57.41 
 
 
458 aa  331  1e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0150658 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0493  phosphate ABC transporter permease protein  53.01 
 
 
495 aa  330  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.183402  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2290  phosphate ABC transporter permease  54.27 
 
 
483 aa  330  4e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1920  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  53.03 
 
 
480 aa  325  7e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.71778  normal  0.886394 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4329  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  55.77 
 
 
396 aa  325  8.000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0107359  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1261  phosphate ABC transporter permease  54.76 
 
 
492 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1261  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  54.31 
 
 
481 aa  320  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2603  ABC phosphate transporter, inner membrane subunit PstC  54.31 
 
 
481 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0717  phosphate ABC transporter, permease protein PstC, putative  49.34 
 
 
304 aa  303  3.0000000000000004e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0643  phosphate ABC transporter, permease protein PstC, putative  49.34 
 
 
304 aa  303  3.0000000000000004e-81  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0800  phosphate ABC transporter, permease protein  49.34 
 
 
304 aa  301  2e-80  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1055  putative phosphate ABC transporter, permease protein PstC  48.68 
 
 
304 aa  301  2e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3819  phosphate ABC transporter, permease component  49.68 
 
 
295 aa  294  2e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.37684 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0145  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  48.23 
 
 
374 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  decreased coverage  0.00254182  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0982  phosphate ABC transporter, permease protein  48.94 
 
 
374 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.72351  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0794  phosphate ABC transporter permease  45.28 
 
 
320 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2443  phosphate ABC transporter permease  45 
 
 
310 aa  258  2e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687312 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3636  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.38 
 
 
304 aa  256  4e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.301349  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0202  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  43.85 
 
 
302 aa  252  1e-65  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.211138  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1086  phosphate ABC transporter permease  43.57 
 
 
310 aa  252  1e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1828  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.97 
 
 
314 aa  250  3e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2103  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.45 
 
 
310 aa  250  4e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0379  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.71 
 
 
308 aa  248  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4124  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.63 
 
 
316 aa  247  4e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4387  phosphate ABC transporter, permease protein  40.97 
 
 
316 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.434868  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1655  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.83 
 
 
311 aa  246  6e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4404  phosphate ABC transporter, permease protein  41.19 
 
 
316 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0493  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.67 
 
 
307 aa  243  5e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0849  phosphate ABC transporter, permease protein  40.65 
 
 
316 aa  243  6e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.68749  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4351  phosphate ABC transporter, permease protein  40.57 
 
 
316 aa  241  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3998  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.03 
 
 
321 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0046  phosphate ABC transporter permease  43.71 
 
 
313 aa  240  4e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.640676  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1489  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.06 
 
 
343 aa  239  6.999999999999999e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111462  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1250  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.55 
 
 
306 aa  239  8e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.125763  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0588  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.2 
 
 
319 aa  238  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.175196 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4173  phosphate ABC transporter permease  39.35 
 
 
316 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4495  phosphate ABC transporter permease  39.35 
 
 
316 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4291  phosphate ABC transporter, permease protein  39.35 
 
 
316 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00236226 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2999  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43 
 
 
316 aa  237  3e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4011  phosphate ABC transporter, permease  39.35 
 
 
316 aa  237  4e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4021  phosphate ABC transporter, permease  39.03 
 
 
316 aa  236  4e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3563  phosphate ABC transporter permease  43.42 
 
 
311 aa  236  4e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1098  phosphate ABC transporter, permease protein  42.01 
 
 
325 aa  233  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4156  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  46.25 
 
 
319 aa  233  6e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.128753  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1052  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.99 
 
 
309 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.130457  hitchhiker  0.0000180725 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0287  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.07 
 
 
315 aa  232  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0473771  normal  0.154696 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1023  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.99 
 
 
309 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1449  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.88 
 
 
308 aa  230  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1478  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  45.88 
 
 
308 aa  230  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0682584  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4493  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.11 
 
 
320 aa  229  6e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.89646 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0331  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.86 
 
 
315 aa  227  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113685  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4581  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.75 
 
 
313 aa  228  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.235553  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0959  phosphate ABC transporter, permease protein  44.91 
 
 
308 aa  226  8e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0356  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  37.46 
 
 
350 aa  223  7e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0241985  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2479  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.83 
 
 
307 aa  219  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0204  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  41.78 
 
 
324 aa  211  1e-53  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00435822  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3955  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.1 
 
 
315 aa  210  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.189058  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1792  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.69 
 
 
310 aa  210  4e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0284255 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0503  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.43 
 
 
324 aa  204  3e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.482233  normal  0.348466 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3448  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  43.51 
 
 
324 aa  199  5e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2359  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.39 
 
 
358 aa  199  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0348  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.42 
 
 
291 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2887  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.5 
 
 
297 aa  186  5e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0488  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.09 
 
 
291 aa  186  9e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.456942  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0421  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.49 
 
 
290 aa  181  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2277  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.97 
 
 
646 aa  176  7e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1571  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.47 
 
 
291 aa  176  7e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1061  phosphate ABC transporter permease  37.07 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1779  phosphate ABC transporter, permease protein  33.96 
 
 
296 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0751  phosphate ABC transporter inner membrane protein  34.94 
 
 
297 aa  173  6.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108561  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.65 
 
 
292 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21615  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  33.01 
 
 
318 aa  172  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>