23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0394 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0394  protein of unknown function DUF1653  100 
 
 		 122 aa  249  1e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.25684 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1378  hypothetical protein  55.17 
 
 		 90 aa  102  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0448  hypothetical protein  47.62 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2259  hypothetical protein  38.46 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00120  Protein of unknown function (DUF1653)  52.17 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1611  hypothetical protein  43.75 
 
 		 160 aa  47.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000553331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1755  hypothetical protein  44.64 
 
 		 72 aa  47.4  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1719  protein of unknown function DUF1653  45.9 
 
 		 79 aa  45.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000198179 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2232  hypothetical protein  42.62 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.333234  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0057  hypothetical protein  44.44 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.26698  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1170  hypothetical protein  42.62 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.453785  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0989  hypothetical protein  42.62 
 
 		 239 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.502431  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1582  hypothetical protein  42.19 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.334945 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2498  protein of unknown function DUF1653  42.62 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4875  hypothetical protein  37.93 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5411  hypothetical protein  37.93 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.94574 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3491  hypothetical protein  37.93 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0176003  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0846  hypothetical protein  37.93 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0847935 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3027  protein of unknown function DUF1653  37.68 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000561092  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3435  hypothetical protein  38.57 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3731  hypothetical protein  36.84 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.787713  normal  0.411943 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2268  hypothetical protein  35.94 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210465 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25100  hypothetical protein  36.92 
 
 		 124 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>