More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0279 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0279  carbohydrate kinase, YjeF related protein  100 
 
 		 581 aa  1120    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.253469 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1702  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.18 
 
 		 516 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.214184  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1850  carbohydrate kinase, YjeF related protein  43.78 
 
 		 518 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.114808  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2045  hypothetical protein  47.88 
 
 		 548 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1254  carbohydrate kinase, YjeF related protein  57 
 
 		 574 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.954739 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1143  carbohydrate kinase, YjeF related protein  44.89 
 
 		 553 aa  363  3e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0775  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.01 
 
 		 533 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00360184  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1884  hypothetical protein  33.7 
 
 		 517 aa  239  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1341  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.2 
 
 		 521 aa  237  6e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3771  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.7 
 
 		 519 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0302209  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3022  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.09 
 
 		 520 aa  233  8.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2168  hypothetical protein  36.18 
 
 		 530 aa  229  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00013257  decreased coverage  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2696  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.6 
 
 		 515 aa  229  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590974  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2168  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.12 
 
 		 521 aa  224  4e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0962  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.86 
 
 		 510 aa  223  9e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2321  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.29 
 
 		 521 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000017421  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2259  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.55 
 
 		 525 aa  219  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997976  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3605  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.96 
 
 		 533 aa  215  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329001  hitchhiker  0.000690649 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4947  YjeF-related protein  38.03 
 
 		 496 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01670  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.04 
 
 		 513 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1261  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.1 
 
 		 514 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169741  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1802  YjeF family protein  36 
 
 		 519 aa  213  9e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0891524  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0630  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.19 
 
 		 499 aa  212  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.522163 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2867  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.03 
 
 		 517 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0283  carbohydrate kinase family protein  28.94 
 
 		 499 aa  209  9e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0288  carbohydrate kinase family protein  28.57 
 
 		 499 aa  209  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2927  carbohydrate kinase, YjeF related protein  30.57 
 
 		 516 aa  208  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.449906  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00644  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.01 
 
 		 499 aa  207  4e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1954  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.65 
 
 		 509 aa  206  7e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0698225  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0350  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.9 
 
 		 524 aa  203  5e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3823  carbohydrate kinase, YjeF related protein  28.14 
 
 		 492 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0530  hypothetical protein  36.5 
 
 		 503 aa  201  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0814299  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1759  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.15 
 
 		 530 aa  200  6e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1883  hypothetical protein  37.97 
 
 		 514 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00817146  hitchhiker  0.000000287535 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0567  hypothetical protein  38.63 
 
 		 496 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1229  putative carbohydrate kinase  36.28 
 
 		 488 aa  198  3e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1886  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.36 
 
 		 513 aa  197  6e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794004  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2528  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.28 
 
 		 524 aa  196  7e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0697576  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0471  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.22 
 
 		 532 aa  196  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65390  hypothetical protein  39.79 
 
 		 502 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0500  carbohydrate kinase, YjeF related protein  29.81 
 
 		 524 aa  194  3e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4716  hypothetical protein  36.8 
 
 		 514 aa  194  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0539354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4773  hypothetical protein  36.8 
 
 		 514 aa  193  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0676995 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4633  hypothetical protein  36.8 
 
 		 514 aa  193  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000149389  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0518  hypothetical protein  38.58 
 
 		 499 aa  193  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1191  sugar kinase  36.28 
 
 		 486 aa  193  8e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4623  hypothetical protein  36.8 
 
 		 514 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0320  YjeF family protein  31.13 
 
 		 524 aa  192  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4752  hypothetical protein  36.58 
 
 		 514 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3243  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.4 
 
 		 502 aa  189  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1387  hypothetical protein  40.59 
 
 		 526 aa  188  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3545  carbohydrate kinase, YjeF related protein  34.38 
 
 		 492 aa  188  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0976  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.73 
 
 		 512 aa  187  3e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000105274  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3804  hypothetical protein  33.05 
 
 		 504 aa  187  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026757  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3658  hypothetical protein  33.05 
 
 		 504 aa  187  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233957  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0704  hypothetical protein  32.83 
 
 		 504 aa  186  8e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000056197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1401  carbohydrate kinase, YjeF related protein  36.23 
 
 		 507 aa  186  9e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.324731  normal  0.9044 
 
 
-
 
NC_002936  DET0427  carbohydrate kinase family protein  37.31 
 
 		 512 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00841365  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3973  carbohydrate kinase, YjeF related protein  31.86 
 
 		 504 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0561  sugar kinase domain-containing protein  31.15 
 
 		 524 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000100236  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1720  hypothetical protein  39.43 
 
 		 531 aa  184  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.240927 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06226  sugar kinase  31.83 
 
 		 512 aa  183  6e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000472  YjeF protein  31.57 
 
 		 513 aa  183  8.000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.44 
 
 		 500 aa  182  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3282  hypothetical protein  32.71 
 
 		 522 aa  183  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.172995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0005  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.22 
 
 		 498 aa  182  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0892  carbohydrate kinase, YjeF related protein  39.25 
 
 		 490 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.177662  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2331  carbohydrate kinase, YjeF related protein  40.22 
 
 		 511 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0339  hypothetical protein  32.82 
 
 		 498 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00480998  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1084  hypothetical protein  34.55 
 
 		 494 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0561  carbohydrate kinase, YjeF-related protein  34.51 
 
 		 492 aa  181  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0026662  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4638  hypothetical protein  32.9 
 
 		 510 aa  180  5.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000291773  normal  0.0355337 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5678  hypothetical protein  39.74 
 
 		 502 aa  180  7e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3307  carbohydrate kinase, YjeF related protein  35.28 
 
 		 519 aa  180  8e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11168  putative YjeF-related sugar kinase  29.49 
 
 		 511 aa  179  9e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.291128  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0426  hypothetical protein  34.48 
 
 		 462 aa  179  9e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000379244  hitchhiker  0.000000929429 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5683  hypothetical protein  32.31 
 
 		 510 aa  179  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000899207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3846  hypothetical protein  32.31 
 
 		 510 aa  179  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000624619  hitchhiker  0.00000292473 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1520  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.08 
 
 		 501 aa  179  1e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000211008 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04034  predicted carbohydrate kinase  32.31 
 
 		 515 aa  178  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00166005  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3826  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.12 
 
 		 515 aa  179  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000026579  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03996  hypothetical protein  32.31 
 
 		 515 aa  178  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000718963  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2333  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.68 
 
 		 506 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4724  hypothetical protein  32.31 
 
 		 515 aa  178  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000041383  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1915  carbohydrate kinase, YjeF related protein  37.28 
 
 		 529 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.513601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0461  carbohydrate kinase, YjeF related protein  38.72 
 
 		 528 aa  178  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.729395  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4698  hypothetical protein  32.1 
 
 		 515 aa  177  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000112402  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1817  hypothetical protein  32.62 
 
 		 490 aa  177  3e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4408  hypothetical protein  32.31 
 
 		 515 aa  177  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000123487  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07490  YjeF-related, C-terminal carbohydrate kinase domain-containing protein  40.69 
 
 		 500 aa  178  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3285  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.73 
 
 		 499 aa  178  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00260957  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0598  yjeF protein  32.81 
 
 		 499 aa  177  5e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3030  YjeF protein  33.48 
 
 		 496 aa  177  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0592  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.67 
 
 		 499 aa  177  6e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000415893 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0593  carbohydrate kinase, YjeF related protein  32.38 
 
 		 499 aa  177  7e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.320661  hitchhiker  0.00000405423 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1793  carbohydrate kinase, YjeF related protein  25.75 
 
 		 501 aa  176  9e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1301  YjeF-related protein  36.61 
 
 		 436 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_369  carbohydrate kinase  32.38 
 
 		 512 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136231  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3437  carbohydrate kinase, YjeF related protein  33.11 
 
 		 499 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.446111  normal  0.221498 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0350  hypothetical protein  33.84 
 
 		 508 aa  175  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00103587  hitchhiker  0.0000473112 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>