299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_R0038 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_R0038  tRNA-Glu  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0222693  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0002  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.9841800000000004e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0004  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 78 bp  95.6  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.0060400000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00679153  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0043  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  7.66398e-18  hitchhiker  0.000611065 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0053  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.646689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0045  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000328054  normal  0.0346347 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0055  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.380229  normal  0.600027 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2128  tRNA-Glu  90 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.223155  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt26  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt27  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt26  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt27  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0032  tRNA-Glu  90 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.362082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0022  tRNA-Glu  89.66 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150409  hitchhiker  0.00052092 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0077  tRNA-Glu  90 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0052  tRNA-Glu  88.52 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0030  tRNA-Glu  91.84 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0076  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011411  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0084  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000274947  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14011  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.08359e-33  hitchhiker  0.00000339353 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0074  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000020686  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0083  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00174717  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0073  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000261854  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.270372  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2828  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000743233  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2829  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2830  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000136674  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2831  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000125741  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2832  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.000126927  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2833  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000102319  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t065  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t066  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t067  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t068  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t069  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t071  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0046  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118448  normal  0.0335348 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0049  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000939786  normal  0.015549 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0016  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000647027  hitchhiker  0.00000106632 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0095  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000187463  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0097  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00001173  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0098  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00699861  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0099  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0236458  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0100  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0345698  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0101  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0318597  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0053  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000330135  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0054  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000364712  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0055  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000000537124  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0063  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000754963  normal  0.0219255 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0065  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126201  normal  0.0214958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0066  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122545  normal  0.0214958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0067  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000119712  normal  0.0214958 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0068  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000101886  normal  0.0219255 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0069  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000616599  normal  0.0122631 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0070  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000026178  normal  0.0123268 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0063  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000852764  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0065  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000829998  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0066  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000483266  normal  0.663718 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0067  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000412805  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0068  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000457267  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0069  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000472024  normal  0.658468 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0070  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000548592  normal  0.634145 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0045  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0333401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0106  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000169546  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0107  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000079121  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0108  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000317177  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0109  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000956258  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0110  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000963161  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0061  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0063  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000126718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0064  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000354559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0065  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0066  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000460024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0067  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000450413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0068  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000473191  normal  0.85687 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0088  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00276432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0090  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00102507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0092  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000105241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0094  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000925295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0095  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000290046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0096  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0097  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000012419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0074  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0152418  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0075  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0139677  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0076  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00648413  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0078  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00140572  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0080  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000593448  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0081  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000080757  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0041  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000000984885  normal  0.888378 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0042  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000260023  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0043  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000364581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0044  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000161143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0045  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000152021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0046  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000603782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0047  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000519759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0069  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0164971  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0070  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00169817  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0071  tRNA-Glu  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000687617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>