More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3306 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_5262  peptidase M24  80.13 
 
 
464 aa  768    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3306  peptidase M24B X-Pro dipeptidase/aminopeptidase domain protein  100 
 
 
463 aa  941    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.305614  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0086  peptidase M24  75.7 
 
 
469 aa  713    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.875137  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0925  peptidase M24  84.5 
 
 
460 aa  781    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0195  peptidase M24  79.3 
 
 
466 aa  699    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.108193 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4582  aminopeptidase P  83.98 
 
 
463 aa  744    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3957  aminopeptidase P  99.35 
 
 
721 aa  938    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4829  aminopeptidase P  67.24 
 
 
462 aa  625  1e-178  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.839316  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4058  peptidase M24  66.45 
 
 
473 aa  624  1e-177  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0400  peptidase M24  61.29 
 
 
462 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.429272 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0509  XAA-Pro aminopeptidase  62.39 
 
 
458 aa  528  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.13437 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0385  peptidase M24  61.34 
 
 
459 aa  528  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0254  putative Xaa-Pro aminopeptidase (aminopeptidase P II) protein  63.04 
 
 
454 aa  520  1e-146  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.26967 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1873  peptidase M24  56.24 
 
 
458 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0432  aminopeptidase P  60.13 
 
 
465 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386273  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0614  peptidase M24  58.75 
 
 
464 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.178264 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0492  aminopeptidase P  59.65 
 
 
474 aa  504  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476859  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3399  aminopeptidase P  61.99 
 
 
642 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.612294  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3394  xaa-pro aminopeptidase  61.99 
 
 
469 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2540  Xaa-Pro aminopeptidase  61.77 
 
 
481 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0274  Xaa-Pro aminopeptidase  61.77 
 
 
481 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2360  Xaa-Pro aminopeptidase  61.77 
 
 
468 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1135  Xaa-Pro aminopeptidase  61.77 
 
 
481 aa  500  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3337  peptidase M24  58.51 
 
 
499 aa  499  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.106603 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0588  peptidase M24  58.53 
 
 
464 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3358  xaa-pro aminopeptidase  61.56 
 
 
469 aa  498  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1254  Xaa-Pro aminopeptidase  61.34 
 
 
611 aa  495  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0623  aminopeptidase P  59.49 
 
 
468 aa  495  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.920846  normal  0.361918 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3781  aminopeptidase P  58.53 
 
 
461 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2549  peptidase M24  57.05 
 
 
514 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2689  peptidase M24  57.54 
 
 
461 aa  486  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0662  peptidase M24  57.97 
 
 
461 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0211  peptidase M24  57.76 
 
 
461 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0695  peptidase M24  57.76 
 
 
461 aa  482  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1577  peptidase M24  54.56 
 
 
455 aa  468  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0128  peptidase M24  50.75 
 
 
440 aa  441  9.999999999999999e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1451  peptidase M24  55.93 
 
 
447 aa  435  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.582435  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0325  peptidase M24  49.78 
 
 
444 aa  420  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2334  putative XAA-Pro aminopeptidase  50 
 
 
433 aa  418  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69000  aminopeptidase P  48.17 
 
 
444 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5967  aminopeptidase P  47.74 
 
 
444 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3427  peptidase M24  47.1 
 
 
439 aa  403  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47330  Aminopeptidase P  48.27 
 
 
444 aa  399  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2146  aminopeptidase P  47.49 
 
 
439 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5434  aminopeptidase P  47.4 
 
 
444 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0260977 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5200  peptidase M24  48.6 
 
 
444 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322511  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2770  xaa-pro aminopeptidase  49.04 
 
 
436 aa  394  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5107  peptidase M24  48.6 
 
 
444 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.132845  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5223  Xaa-Pro aminopeptidase  48.05 
 
 
444 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5260  peptidase M24  48.6 
 
 
444 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0321  peptidase M24:peptidase M24B, X-Pro dipeptidase/aminopeptidase N-terminal  47.74 
 
 
444 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5025  peptidase M24  48.16 
 
 
444 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.252533  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2579  peptidase M24  46.84 
 
 
443 aa  389  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3513  aminopeptidase P  45.16 
 
 
439 aa  390  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135159  normal  0.871047 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2764  peptidase M24  47.82 
 
 
454 aa  386  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3662  aminopeptidase P  47.26 
 
 
432 aa  369  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1821  peptidase M24  45.97 
 
 
454 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0438992  hitchhiker  0.0000000354037 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2815  Xaa-Pro aminopeptidase  44.73 
 
 
446 aa  360  3e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2438  peptidase M24  44.73 
 
 
446 aa  360  3e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000518121  hitchhiker  0.000000118983 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0682  aminopeptidase P  42.55 
 
 
439 aa  355  1e-96  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0390702  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0079  hypothetical protein  42.92 
 
 
436 aa  354  2e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0091  hypothetical protein  42.7 
 
 
436 aa  352  5e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3757  peptidase M24  43.51 
 
 
435 aa  347  3e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.390253 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3502  peptidase M24  42.92 
 
 
443 aa  346  6e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2542  aminopeptidase P  46.97 
 
 
437 aa  342  7e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158286  normal  0.0283016 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0541  proline aminopeptidase P II  42.79 
 
 
441 aa  340  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3919  proline aminopeptidase P II  42.79 
 
 
437 aa  339  8e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000043495  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1559  peptidase M24  41.59 
 
 
443 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3327  proline aminopeptidase P II  42.58 
 
 
437 aa  337  3.9999999999999995e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0020606  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0134  peptidase M24  41.52 
 
 
439 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3396  proline aminopeptidase P II  42.76 
 
 
438 aa  336  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00011206  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0801  proline aminopeptidase P II  42.14 
 
 
441 aa  336  5e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000590411  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0966  aminopeptidase P  45.83 
 
 
442 aa  335  7e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.309482  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3042  proline aminopeptidase P II  42.14 
 
 
441 aa  335  7.999999999999999e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000751227  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00849  proline aminopeptidase P II  41.18 
 
 
437 aa  335  9e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3236  proline aminopeptidase P II  42.14 
 
 
441 aa  335  1e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000420398  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3229  proline aminopeptidase P II  42.55 
 
 
438 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000552442  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02740  proline aminopeptidase P II  42.14 
 
 
441 aa  335  1e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000920962  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0784  peptidase M24  42.14 
 
 
441 aa  335  1e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264237  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3294  proline aminopeptidase P II  42.55 
 
 
438 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0229287  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3067  proline aminopeptidase P II  42.14 
 
 
441 aa  335  1e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000106171  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02703  hypothetical protein  42.14 
 
 
441 aa  335  1e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000102485  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0024  aminopeptidase P  45.51 
 
 
445 aa  335  1e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.407188  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2399  peptidase M24  42.52 
 
 
435 aa  335  1e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.320532  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3329  proline aminopeptidase P II  41.92 
 
 
441 aa  334  2e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000100618  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4201  proline aminopeptidase P II  41.92 
 
 
441 aa  334  2e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000052463  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0444  proline aminopeptidase P II  42.14 
 
 
441 aa  334  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3217  proline aminopeptidase P II  42.33 
 
 
438 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00100894  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3291  proline aminopeptidase P II  42.33 
 
 
438 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133072  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2777  aminopeptidase P  42.3 
 
 
436 aa  333  3e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1271  Xaa-Pro aminopeptidase  40.65 
 
 
461 aa  333  4e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0131  peptidase M24  41.3 
 
 
439 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.366962  decreased coverage  0.000000108006 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0848  peptidase M24B X-Pro dipeptidase/aminopeptidase domain-containing protein  45.61 
 
 
442 aa  329  7e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.283134  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0860  proline aminopeptidase P II  42.58 
 
 
437 aa  328  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000995662  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3475  proline aminopeptidase P II  42.58 
 
 
441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4599  aminopeptidase P  40.56 
 
 
436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0863  proline aminopeptidase P II  42.36 
 
 
437 aa  327  3e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00955422  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3827  proline aminopeptidase P II  42.36 
 
 
437 aa  326  5e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000338921  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0606  peptidase M24  39.61 
 
 
439 aa  323  3e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3594  proline aminopeptidase P II  42.7 
 
 
442 aa  323  3e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>