101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1216 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2592  ABC-type transport system ipermease component  100 
 
 		 269 aa  529  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.338315  normal  0.186973 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1216  protein of unknown function DUF140  100 
 
 		 269 aa  529  1e-149  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1817  ABC-type transport system ipermease component  78.6 
 
 		 266 aa  389  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.677101  normal  0.663369 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0554  ABC-type transport system ipermease component  75.29 
 
 		 287 aa  366  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2917  ABC-type transport system ipermease component  66.92 
 
 		 267 aa  334  7.999999999999999e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.68083  normal  0.345232 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1789  ABC-type transport system ipermease component  61.19 
 
 		 267 aa  301  7.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.047158 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2659  ABC-type transport system ipermease component  65.08 
 
 		 267 aa  291  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0263164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0012  ABC-type transport system ipermease component  55.2 
 
 		 249 aa  234  9e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000582511 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1224  ABC-type transport system ipermease component  51.32 
 
 		 266 aa  222  4e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0980  ABC-type transport system ipermease component  38.96 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0674411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2769  hypothetical protein  30.67 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3393  hypothetical protein  29.13 
 
 		 259 aa  52.8  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1899  hypothetical protein  29.81 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3513  ABC transporter, inner membrane subunit  31.33 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1014  hypothetical protein  33.56 
 
 		 260 aa  50.4  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0394  hypothetical protein  31.33 
 
 		 255 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0333  hypothetical protein  30.67 
 
 		 255 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0342  hypothetical protein  30.67 
 
 		 255 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610119 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2692  hypothetical protein  30.67 
 
 		 255 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327255  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0415  hypothetical protein  30.67 
 
 		 255 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177362  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0318  hypothetical protein  30.67 
 
 		 255 aa  49.7  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.256439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5535  hypothetical protein  33.56 
 
 		 260 aa  48.9  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1322  protein of unknown function DUF140  24.69 
 
 		 382 aa  48.9  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.619547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4933  hypothetical protein  24.57 
 
 		 394 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0419987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3388  protein of unknown function DUF140  22.58 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.159467 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1155  protein of unknown function DUF140  30.05 
 
 		 260 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  28.19 
 
 		 328 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2961  hypothetical protein  29.61 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.597784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0037  hypothetical protein  26.15 
 
 		 382 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151467  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0447  ABC-type toluene export protein  30.23 
 
 		 269 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256221  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3121  hypothetical protein  29.25 
 
 		 258 aa  46.6  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3239  protein of unknown function DUF140  30.67 
 
 		 255 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2892  protein of unknown function DUF140  30.67 
 
 		 255 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3100  hypothetical protein  29.37 
 
 		 260 aa  46.2  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.496882 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1965  protein of unknown function DUF140  30.07 
 
 		 270 aa  46.6  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2785  hypothetical protein  26.16 
 
 		 260 aa  46.2  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00892683  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1612  hypothetical protein  26.73 
 
 		 384 aa  46.2  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  26.67 
 
 		 375 aa  45.8  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4535  hypothetical protein  29.09 
 
 		 258 aa  45.8  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2119  hypothetical protein  29.93 
 
 		 258 aa  45.8  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0096  protein of unknown function DUF140  29.33 
 
 		 262 aa  45.8  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000150492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3017  hypothetical protein  26.94 
 
 		 362 aa  45.8  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.558408  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1358  protein of unknown function DUF140  29.89 
 
 		 413 aa  45.4  0.0009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4446  hypothetical protein  27.81 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4140  hypothetical protein  27.81 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0388  ABC transporter inner membrane protein  31.33 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2219  hypothetical protein  30.07 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57870  ABC transporter permease  27.65 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0749  hypothetical protein  31.47 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5027  ABC transporter permease  27.65 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3500  hypothetical protein  27.54 
 
 		 376 aa  44.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3570  protein of unknown function DUF140  30.67 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392913  hitchhiker  0.0000192838 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1871  protein of unknown function DUF140  31.71 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106887 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0717  protein of unknown function DUF140  31.47 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1528  hypothetical protein  26.97 
 
 		 373 aa  44.3  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0794  hypothetical protein  28.87 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.213597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2342  hypothetical protein  25.39 
 
 		 406 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.95036  hitchhiker  0.00549832 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0097  hypothetical protein  28.67 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.180124  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0877  hypothetical protein  27.65 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.544199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2742  hypothetical protein  25.15 
 
 		 365 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803519 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0738  protein of unknown function DUF140  29.1 
 
 		 260 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3649  protein of unknown function DUF140  26.74 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1968  hypothetical protein  31.48 
 
 		 263 aa  43.5  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2725  ABC transporter, permease protein  32.67 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0904  hypothetical protein  29.6 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0873  hypothetical protein  29.6 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3703  ABC transporter, permease protein  32.67 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0864  hypothetical protein  27.22 
 
 		 265 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3003  ABC transporter, permease protein  32.67 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3258  hypothetical protein  27.89 
 
 		 258 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0481  hypothetical protein  29.66 
 
 		 368 aa  43.9  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.248573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2708  hypothetical protein  32.95 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3229  ABC transporter, permease protein  32.67 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387894  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2398  hypothetical protein  40.74 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1778  ABC transporter, permease protein  32.67 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3676  toluene tolerance ABC transporter, permease protein  32.67 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0296584  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3734  toluene tolerance ABC transporter, permease protein  32.67 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2775  ABC transporter, permease protein  32.67 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1030  hypothetical protein  25.56 
 
 		 229 aa  43.5  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0378  protein of unknown function DUF140  30.28 
 
 		 370 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1373  hypothetical protein  24.85 
 
 		 378 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  32.35 
 
 		 377 aa  43.1  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04780  ABC transporter protein  23.9 
 
 		 382 aa  43.1  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0570805  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0247  ABC transport system permease protein  24.87 
 
 		 364 aa  42.7  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0980  hypothetical protein  27.56 
 
 		 261 aa  42.7  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0238  hypothetical protein  28.67 
 
 		 263 aa  42.7  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.871926 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1353  hypothetical protein  24.85 
 
 		 378 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  28.74 
 
 		 258 aa  42.7  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0741  ABC transporter permease protein  23.03 
 
 		 377 aa  42.4  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1224  ABC transporter, permease protein  23.03 
 
 		 377 aa  42.4  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5085  hypothetical protein  24.75 
 
 		 377 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.100412 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03185  putative transport protein (ABC superfamily, membrane)  29.25 
 
 		 258 aa  42.4  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  28.31 
 
 		 251 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  28.31 
 
 		 251 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1553  protein of unknown function DUF140  25.59 
 
 		 245 aa  42.7  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00323252  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1921  hypothetical protein  26 
 
 		 388 aa  42.4  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1197  hypothetical protein  26.53 
 
 		 382 aa  42.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.924507  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0282  hypothetical protein  28.77 
 
 		 260 aa  42.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03210  toluene tolerance protein  30 
 
 		 249 aa  42.4  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  28 
 
 		 264 aa  42  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>