More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0892 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1459  glutamate dehydrogenase  88.37 
 
 
447 aa  832    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01730  glutamate dehydrogenase  69.3 
 
 
447 aa  647    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00719623  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1881  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  69.3 
 
 
447 aa  647    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.53168  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1393  glutamate dehydrogenase  69.75 
 
 
447 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221099  normal  0.113397 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5140  glutamate dehydrogenase  86.13 
 
 
447 aa  805    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.299774  normal  0.273528 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0675  glutamate dehydrogenase  68.47 
 
 
449 aa  649    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4692  glutamate dehydrogenase  70.05 
 
 
444 aa  655    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4200  glutamate dehydrogenase  70.65 
 
 
447 aa  661    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0707  glutamate dehydrogenase  68.47 
 
 
446 aa  648    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.469869  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1429  glutamate dehydrogenase  69.53 
 
 
447 aa  649    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00746713  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1845  glutamate dehydrogenase  69.3 
 
 
447 aa  647    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0654574  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3724  glutamate dehydrogenase  72.71 
 
 
447 aa  681    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2481  glutamate dehydrogenase  69.75 
 
 
447 aa  650    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.231621  normal  0.944687 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0527  glutamate dehydrogenase  68.78 
 
 
447 aa  635    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000736482  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2447  glutamate dehydrogenase  77.63 
 
 
447 aa  744    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1685  glutamate dehydrogenase  69.14 
 
 
447 aa  645    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1286  glutamate dehydrogenase  76.73 
 
 
447 aa  726    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000501948  hitchhiker  0.000436028 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0119  glutamate dehydrogenase  69.75 
 
 
447 aa  647    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0706  glutamate dehydrogenase  68.47 
 
 
446 aa  649    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1871  glutamate dehydrogenase  69.3 
 
 
447 aa  647    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.598381  hitchhiker  0.000134113 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5114  glutamate dehydrogenase  70.5 
 
 
462 aa  668    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0629233  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4089  glutamate dehydrogenase  69.53 
 
 
447 aa  644    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2014  glutamate dehydrogenase  69.75 
 
 
447 aa  649    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60710  glutamate dehydrogenase  67.79 
 
 
445 aa  637    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0452  glutamate dehydrogenase  81.21 
 
 
447 aa  771    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0892  glutamate dehydrogenase  100 
 
 
447 aa  926    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01718  hypothetical protein  69.3 
 
 
447 aa  647    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00971306  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0977  glutamate dehydrogenase  99.55 
 
 
447 aa  922    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0965022  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4509  glutamate dehydrogenase  68.24 
 
 
446 aa  646    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4483  glutamate dehydrogenase  71.33 
 
 
447 aa  662    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1426  glutamate dehydrogenase  69.75 
 
 
447 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.91122 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4036  glutamate dehydrogenase  69.75 
 
 
447 aa  647    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1984  glutamate dehydrogenase  69.75 
 
 
447 aa  649    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000158842  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1410  glutamate dehydrogenase  69.3 
 
 
447 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666126  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1876  glutamate dehydrogenase  69.75 
 
 
447 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0272489  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2047  glutamate dehydrogenase  69.75 
 
 
447 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5228  glutamate dehydrogenase  67.57 
 
 
445 aa  634  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1339  glutamate dehydrogenase  68.17 
 
 
449 aa  628  1e-179  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.852226  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4874  glutamate dehydrogenase  65.99 
 
 
445 aa  625  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.443754  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1771  glutamate dehydrogenase  67.04 
 
 
445 aa  625  1e-178  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.89155  normal  0.439156 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02515  glutamate dehydrogenase  64.35 
 
 
447 aa  614  1e-175  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2214  glutamate dehydrogenase  64.6 
 
 
438 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.171409  normal  0.223248 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0818  glutamate dehydrogenase  63 
 
 
447 aa  587  1e-166  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.274961 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1556  glutamate dehydrogenase  61.99 
 
 
445 aa  580  1e-164  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.240563  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1647  glutamate dehydrogenase  62.72 
 
 
451 aa  581  1e-164  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1212  glutamate dehydrogenase  61.76 
 
 
446 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3443  glutamate dehydrogenase  61.97 
 
 
450 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0942  glutamate dehydrogenase  60.58 
 
 
466 aa  560  1e-158  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.156047 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0708  glutamate dehydrogenase  59.87 
 
 
447 aa  556  1e-157  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1770  glutamate dehydrogenase  60.8 
 
 
448 aa  557  1e-157  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1499  glutamate dehydrogenase  60.13 
 
 
448 aa  553  1e-156  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.981406  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1801  glutamate dehydrogenase  61.4 
 
 
443 aa  554  1e-156  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.250235  normal  0.676275 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07080  glutamate dehydrogenase  61.28 
 
 
443 aa  550  1e-155  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.813 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1330  glutamate dehydrogenase  60.71 
 
 
453 aa  550  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.40508 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2051  glutamate dehydrogenase  59.5 
 
 
451 aa  545  1e-154  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.553496 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0109  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  60.59 
 
 
453 aa  543  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1272  glutamate dehydrogenase  60.99 
 
 
451 aa  533  1e-150  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2771  glutamate dehydrogenase  59.42 
 
 
451 aa  532  1e-150  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1371  glutamate dehydrogenase  58.6 
 
 
452 aa  529  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.209216  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0374  glutamate dehydrogenase  60.36 
 
 
444 aa  528  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000129016  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1427  glutamate dehydrogenase  58.67 
 
 
448 aa  526  1e-148  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2359  glutamate dehydrogenase  60.45 
 
 
444 aa  526  1e-148  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394461  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34200  glutamate dehydrogenase (NADP)  60.45 
 
 
446 aa  523  1e-147  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.255605 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0726  glutamate dehydrogenase  58.65 
 
 
446 aa  522  1e-147  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.830079  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0610  glutamate dehydrogenase  58.54 
 
 
443 aa  523  1e-147  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0929396 
 
 
-
 
NC_002950  PG1232  glutamate dehydrogenase  57.11 
 
 
445 aa  520  1e-146  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1457  glutamate dehydrogenase  53.76 
 
 
448 aa  519  1e-146  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0346  glutamate dehydrogenase  59.95 
 
 
445 aa  518  1e-146  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4267  glutamate dehydrogenase  56.92 
 
 
448 aa  518  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292709  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2296  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  59.45 
 
 
445 aa  518  1e-146  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4353  glutamate dehydrogenase  56.92 
 
 
448 aa  518  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal  0.0129009 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0527  glutamate dehydrogenase  56.03 
 
 
450 aa  518  1e-146  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000275062  normal  0.153307 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16151  glutamate dehydrogenase  57.3 
 
 
451 aa  518  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.241979 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4646  glutamate dehydrogenase  56.92 
 
 
448 aa  518  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2911  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  59.91 
 
 
445 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.755434 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3505  glutamate dehydrogenase  59.45 
 
 
445 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0418  glutamate dehydrogenase  59.28 
 
 
449 aa  511  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549997  normal  0.391683 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10490  glutamate dehydrogenase  56.63 
 
 
451 aa  508  1e-143  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000302045 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3577  glutamate dehydrogenase  59.23 
 
 
445 aa  511  1e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30790  glutamate dehydrogenase  58.64 
 
 
447 aa  505  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2782  Glu/Leu/Phe/Val dehydrogenase  57.63 
 
 
446 aa  506  9.999999999999999e-143  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000238369  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1813  glutamate dehydrogenase  54.61 
 
 
454 aa  506  9.999999999999999e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0467  glutamate dehydrogenase  58.28 
 
 
450 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000753679  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1658  glutamate dehydrogenase  58.17 
 
 
458 aa  507  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1186  glutamate dehydrogenase  57.18 
 
 
450 aa  503  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4852  glutamate dehydrogenase  57.66 
 
 
444 aa  503  1e-141  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0826  glutamate dehydrogenase  55.53 
 
 
444 aa  499  1e-140  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0743965  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5321  glutamate dehydrogenase  57.6 
 
 
449 aa  498  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0761219 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3497  glutamate dehydrogenase  55.81 
 
 
451 aa  498  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4804  glutamate dehydrogenase  58.64 
 
 
449 aa  501  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323984  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0396  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  56.07 
 
 
447 aa  498  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2044  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  58.48 
 
 
456 aa  496  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.859407  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1929  glutamate dehydrogenase  55.8 
 
 
449 aa  495  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2125  glutamate dehydrogenase  54.67 
 
 
447 aa  496  1e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0411981  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5524  Glutamate dehydrogenase (NADP(+))  56 
 
 
447 aa  495  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0148438  normal  0.115697 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1305  glutamate dehydrogenase  55.58 
 
 
450 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3219  glutamate dehydrogenase  55.35 
 
 
449 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0175  glutamate dehydrogenase  54.93 
 
 
449 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000304056 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3118  glutamate dehydrogenase  55.35 
 
 
449 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.690861  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0193  glutamate dehydrogenase  55.16 
 
 
449 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>