More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0624 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0624  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
353 aa  718    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.341166  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0645  alcohol dehydrogenase  99.15 
 
 
353 aa  715    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4802  alcohol dehydrogenase  83.09 
 
 
349 aa  596  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5840  alcohol dehydrogenase  85.63 
 
 
349 aa  588  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.967435 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3742  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  83 
 
 
349 aa  578  1e-164  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1857  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  81.61 
 
 
353 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.298153  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35470  Zinc-containing alcohol dehydrogenase  81.32 
 
 
349 aa  572  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00280  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  78.8 
 
 
349 aa  560  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3281  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  78.51 
 
 
349 aa  558  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0633  alcohol dehydrogenase  80.17 
 
 
349 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.731757  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00284  hypothetical protein  78.8 
 
 
349 aa  560  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0349  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  78.8 
 
 
349 aa  557  1e-158  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3298  alcohol dehydrogenase  78.8 
 
 
349 aa  560  1e-158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.128048  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3610  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  79.6 
 
 
349 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1553  alcohol dehydrogenase  77.87 
 
 
349 aa  554  1e-157  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0390  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  78.51 
 
 
349 aa  556  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0356  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  78.51 
 
 
349 aa  556  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.799512  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1492  alcohol dehydrogenase  78.16 
 
 
349 aa  556  1e-157  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0396  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  78.51 
 
 
349 aa  557  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0202  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  69.6 
 
 
352 aa  482  1e-135  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.558128 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2697  oxidoreductase, zinc-binding protein  69.71 
 
 
358 aa  481  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00378305  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2431  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  69.43 
 
 
374 aa  477  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046126 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03296  alcohol dehydrogenase  69.21 
 
 
352 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0972  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  67.53 
 
 
349 aa  464  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.119955 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0846  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  67.53 
 
 
349 aa  464  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2206  zinc-binding alcohol dehydrogenase  64.94 
 
 
352 aa  457  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00134118  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3101  alcohol dehydrogenase  66.86 
 
 
350 aa  442  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3120  alcohol dehydrogenase  66.19 
 
 
350 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.895638 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2490  zinc-binding alcohol dehydrogenase  66.19 
 
 
350 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3104  alcohol dehydrogenase  66.19 
 
 
350 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6455  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  65.99 
 
 
350 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3159  alcohol dehydrogenase  66 
 
 
350 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.146066  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4441  alcohol dehydrogenase  65.51 
 
 
350 aa  440  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.760934  normal  0.282889 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3042  alcohol dehydrogenase  65.9 
 
 
350 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3325  alcohol dehydrogenase  63.79 
 
 
350 aa  434  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  64.86 
 
 
354 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442865  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0177  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  65.99 
 
 
354 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154502  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3240  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  65.99 
 
 
354 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2188  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  65.99 
 
 
354 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0372  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  65.71 
 
 
354 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0152  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  66.28 
 
 
354 aa  431  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0187  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  65.71 
 
 
354 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3447  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  65.99 
 
 
354 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2898  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  65.99 
 
 
354 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.915177  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1754  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  66.96 
 
 
350 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0138485  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2121  alcohol dehydrogenase  63.58 
 
 
359 aa  426  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5962  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4928  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  65.77 
 
 
350 aa  425  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125922  normal  0.144923 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0772  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  65.88 
 
 
351 aa  422  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2303  alcohol dehydrogenase  62.39 
 
 
348 aa  409  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2951  alcohol dehydrogenase  60.34 
 
 
349 aa  404  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3208  alcohol dehydrogenase  61.78 
 
 
352 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5513  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.06 
 
 
351 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  56.36 
 
 
351 aa  391  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4893  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  58.17 
 
 
351 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10033  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  57.06 
 
 
349 aa  389  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.763939  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0360  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  56.03 
 
 
347 aa  384  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912483  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3293  alcohol dehydrogenase  53.74 
 
 
352 aa  385  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.566343  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1575  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  60.45 
 
 
355 aa  383  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.847733  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4586  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  55.2 
 
 
347 aa  383  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0208069  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1946  zinc-binding alcohol dehydrogenase  58.91 
 
 
351 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.101054  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2018  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  56.16 
 
 
348 aa  383  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3848  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.44 
 
 
350 aa  383  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3348  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  54.05 
 
 
348 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.596659  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2965  putative alcohol dehydrogenase  57.67 
 
 
353 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3355  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.17 
 
 
347 aa  377  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.050298 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3166  zinc-binding alcohol dehydrogenase  61.1 
 
 
352 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3396  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  54.44 
 
 
352 aa  372  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.214835 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35150  putative alcohol dehydrogenase (Zn-dependent)  57.1 
 
 
353 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3283  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.81 
 
 
352 aa  368  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0400  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  55.75 
 
 
352 aa  368  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.654367 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3357  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  60.81 
 
 
352 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19290  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  54.89 
 
 
348 aa  369  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0401  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  56.03 
 
 
352 aa  366  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.189509  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6150  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.01 
 
 
351 aa  368  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3605  alcohol dehydrogenase  53.76 
 
 
348 aa  363  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2974  alcohol dehydrogenase  55.56 
 
 
350 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2575  alcohol dehydrogenase  53.04 
 
 
347 aa  363  3e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  0.37434 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3125  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  57.53 
 
 
352 aa  359  4e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0345  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.87 
 
 
347 aa  357  9.999999999999999e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253238  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1375  alcohol dehydrogenase  55.87 
 
 
351 aa  356  2.9999999999999997e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.61676  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0663  hypothetical protein  57.73 
 
 
348 aa  356  3.9999999999999996e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0647  hypothetical protein  57.43 
 
 
348 aa  356  3.9999999999999996e-97  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5515  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  50.29 
 
 
353 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.174034 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3071  alcohol dehydrogenase  54.89 
 
 
350 aa  355  5e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.989548  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1689  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  53.31 
 
 
349 aa  355  5.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.458756  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2634  alcohol dehydrogenase  58.33 
 
 
387 aa  355  6.999999999999999e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00621728  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2756  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.87 
 
 
348 aa  354  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.706145 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2499  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  50.87 
 
 
348 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0546184  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2071  alcohol dehydrogenase  54.89 
 
 
350 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2439  zinc-binding alcohol dehydrogenase  55.11 
 
 
353 aa  353  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2158  Zn-binding alcohol dehydrogenase  53.91 
 
 
367 aa  354  2e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0255  alcohol dehydrogenase  52.72 
 
 
347 aa  353  2.9999999999999997e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2666  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  52.44 
 
 
347 aa  351  1e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.435861  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2709  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  51.01 
 
 
348 aa  349  4e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3048  alcohol dehydrogenase  50 
 
 
348 aa  348  6e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2426  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  54.31 
 
 
350 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.280173  normal  0.967284 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2182  oxidoreductase, zinc-binding protein  53.89 
 
 
350 aa  346  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.312998  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1694  alcohol dehydrogenase  50.58 
 
 
348 aa  346  3e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4279  alcohol dehydrogenase  51.86 
 
 
348 aa  346  4e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371426  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13061  NADP-dependent alcohol dehydrogenase adhC  52.16 
 
 
346 aa  345  5e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0701661 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>