44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0503 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0503  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  302  1.0000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.980853  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0492  hypothetical protein  98.05 
 
 
154 aa  296  8e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.702213  normal  0.0712002 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1239  hypothetical protein  51.74 
 
 
161 aa  150  8.999999999999999e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1845  hypothetical protein  52.17 
 
 
158 aa  82.8  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0489  P-18 protein  38.89 
 
 
160 aa  81.6  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2600  hypothetical protein  36.36 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.716222  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4956  hypothetical protein  37.09 
 
 
153 aa  77  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0252301  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4863  hypothetical protein  37.09 
 
 
153 aa  77  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4950  hypothetical protein  37.09 
 
 
153 aa  77  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4897  hypothetical protein  37.09 
 
 
153 aa  77  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166509  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2736  hypothetical protein  37.69 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.915643  normal  0.816191 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0994  hypothetical protein  36.24 
 
 
161 aa  75.5  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4796  hypothetical protein  41.03 
 
 
163 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.608299 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4953  hypothetical protein  30.91 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000310111  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4592  hypothetical protein  30.91 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000005798  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3695  hypothetical protein  30.91 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000118901  hitchhiker  0.00917885 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4900  hypothetical protein  30.91 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000460742  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04203  hypothetical protein  30.91 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00223356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04237  hypothetical protein  30.91 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00255693  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3637  conserved hypothetical protein  30.91 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000262647  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5873  hypothetical protein  30.3 
 
 
165 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.002117  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0515  hypothetical protein  34.78 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00553167 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3527  hypothetical protein  36.17 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0864  hypothetical protein  36.17 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3656  hypothetical protein  36.17 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2754  P-18 protein  38.71 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4905  hypothetical protein  29.3 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000354937  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14380  hypothetical protein  42.05 
 
 
172 aa  62.8  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0723712  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6319  hypothetical protein  40.66 
 
 
162 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1760  hypothetical protein  40.66 
 
 
162 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1501  hypothetical protein  42.22 
 
 
158 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.787419  normal  0.0723582 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0651  hypothetical protein  38.2 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5057  hypothetical protein  40 
 
 
159 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0281  hypothetical protein  35.96 
 
 
157 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0982  hypothetical protein  35.96 
 
 
157 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2680  hypothetical protein  35.96 
 
 
157 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2396  hypothetical protein  35.96 
 
 
157 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.344878  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0819  hypothetical protein  35.96 
 
 
157 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0009  hypothetical protein  35.96 
 
 
157 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4315  hypothetical protein  36.36 
 
 
158 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.581556  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1916  hypothetical protein  35.79 
 
 
151 aa  53.9  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.274823 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0823  hypothetical protein  34.83 
 
 
157 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.253243  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6280  hypothetical protein  35.48 
 
 
149 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1773  hypothetical protein  35.95 
 
 
162 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>