14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0082 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0082    100 
 
 		 342 bp  678    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  95.32 
 
 		 789 bp  551  1e-155  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  87.29 
 
 		 789 bp  291  6e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2124  enoyl-CoA hydratase  85.92 
 
 		 930 bp  61.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.381981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  94.29 
 
 		 777 bp  54  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  92.11 
 
 		 810 bp  52  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0151  enoyl-CoA hydratase  96.43 
 
 		 783 bp  48.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1573  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 780 bp  48.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0661339  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1292  enoyl-CoA hydratase/isomerase  96.43 
 
 		 792 bp  48.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000700088 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3623  short chain enoyl-CoA hydratase  96.3 
 
 		 834 bp  46.1  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0009  enoyl-CoA hydratase/isomerase  93.55 
 
 		 777 bp  46.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2014  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  91.43 
 
 		 780 bp  46.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162316  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2933  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  96.3 
 
 		 780 bp  46.1  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.143661  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3664  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  82.67 
 
 		 795 bp  46.1  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>