64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2258 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2258  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  100 
 
 
57 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00384223 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1410  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  51.79 
 
 
56 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000386178  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0224  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.55 
 
 
367 aa  48.9  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.581044  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0796  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.62 
 
 
368 aa  47.4  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.18226  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0532  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  48.21 
 
 
55 aa  47  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000183692  normal  0.0950225 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0472  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.64 
 
 
57 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1456  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  46.43 
 
 
57 aa  45.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.519464  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1334  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45 
 
 
368 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0262596 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02630  dissimilatory sulfite reductase (desulfoviridin), alpha/beta subunit  50 
 
 
57 aa  45.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.862545 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3119  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.86 
 
 
392 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000930886  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.58 
 
 
369 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.75783  normal  0.24962 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0272  adenylylsulfate reductase, beta subunit  33.87 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000000000553885  hitchhiker  0.000000190129 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2193  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.67 
 
 
60 aa  45.1  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2077  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.46 
 
 
368 aa  45.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.917974 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02950  putative PAS/PAC sensor protein  43.18 
 
 
877 aa  44.7  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2457  ferredoxin  48.28 
 
 
58 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193004  normal  0.0673531 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2390  dissimilatory sulfite reductase (desulfoviridin) alpha and beta subunits-like  39.58 
 
 
215 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000111443  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2019  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.64 
 
 
57 aa  43.9  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1641  aldo/keto reductase  37.04 
 
 
315 aa  43.9  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.316031  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04760  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  47.83 
 
 
149 aa  43.5  0.0009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000206587  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20700  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35 
 
 
370 aa  43.5  0.0009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.921643  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0889  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.23 
 
 
357 aa  43.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000133582  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0265  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  34.85 
 
 
427 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2467  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38 
 
 
371 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00514975  hitchhiker  0.000746109 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0911  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  44.23 
 
 
357 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000589755  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0222  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  37.25 
 
 
423 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1568  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  47.37 
 
 
58 aa  43.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0476  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40.82 
 
 
455 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0528  hypothetical protein  39.29 
 
 
57 aa  42.7  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.625132 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1538  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  41.18 
 
 
416 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1265  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.86 
 
 
58 aa  42.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.755601  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1086  NADH dehydrogenase (quinone)  38.89 
 
 
526 aa  42.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0456  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.73 
 
 
361 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0736  ferredoxin  46.55 
 
 
59 aa  41.6  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0724  NADH dehydrogenase (quinone)  46.3 
 
 
485 aa  42  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0565  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  43.75 
 
 
277 aa  42  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.572571  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0178  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  43.18 
 
 
443 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0085  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 
840 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3885  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  36.17 
 
 
759 aa  41.2  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0072  benzoyl-CoA oxygenase/reductase, BoxA protein  37.25 
 
 
439 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.860838  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1280  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.45 
 
 
249 aa  41.6  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0429552  normal  0.627114 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0559  NADH dehydrogenase (quinone)  49.06 
 
 
624 aa  41.6  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.382532  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14300  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  48.94 
 
 
331 aa  41.6  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.06573e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4220  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  43.9 
 
 
667 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0731  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  42.86 
 
 
652 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.272693  normal  0.130877 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1475  nitrite/sulfite reductase hemoprotein beta subunit  43.9 
 
 
301 aa  41.2  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0347931  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0618  pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase domain protein  36.36 
 
 
1186 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0149  NADH dehydrogenase (quinone)  48.08 
 
 
596 aa  40.8  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1322  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  47.92 
 
 
267 aa  40.8  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122015  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0081  ferredoxin hydrogenase  42.31 
 
 
421 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0781  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  71.43 
 
 
623 aa  40.8  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1630  benzoyl-CoA oxygenase, component A  35.29 
 
 
426 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170592  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0647  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.24 
 
 
374 aa  40.8  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1398  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.07 
 
 
57 aa  40.8  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0588445  normal  0.318627 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1713  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  40.91 
 
 
748 aa  40.8  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000552259  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2435  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  45.83 
 
 
267 aa  40.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000568216  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0375  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  41.51 
 
 
57 aa  40.4  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0310  ferredoxin hydrogenase  41.3 
 
 
462 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2122  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.33 
 
 
421 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00612142  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3684  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  42.86 
 
 
671 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3831  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  42.86 
 
 
671 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4219  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.66 
 
 
177 aa  40.4  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1215  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34 
 
 
368 aa  40  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0692  Fe-S cluster domain protein  37.78 
 
 
434 aa  40  0.01  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>