More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0522 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1132  acriflavin resistance protein  53.46 
 
 
1034 aa  1136    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0522  acriflavin resistance protein  100 
 
 
1032 aa  2092    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.302221 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0572  acriflavin resistance protein  49.86 
 
 
1033 aa  1036    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000015454  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  33.33 
 
 
1051 aa  587  1e-166  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0304  acriflavin resistance protein  29.71 
 
 
1028 aa  464  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.99394  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2317  acriflavin resistance protein  30.88 
 
 
1029 aa  460  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.259725 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  28.15 
 
 
1011 aa  404  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  27.25 
 
 
1034 aa  404  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  26.37 
 
 
1050 aa  392  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  27.12 
 
 
1496 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  27.17 
 
 
1043 aa  381  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  27.26 
 
 
1043 aa  369  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  25.96 
 
 
1038 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  25.98 
 
 
1048 aa  365  2e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  26.15 
 
 
1044 aa  364  6e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  26.46 
 
 
1039 aa  364  6e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  26.53 
 
 
1058 aa  363  8e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  25.87 
 
 
1032 aa  363  8e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  26.79 
 
 
1470 aa  362  2e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.67 
 
 
1049 aa  361  5e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  27.92 
 
 
1034 aa  358  2.9999999999999997e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  26.64 
 
 
1036 aa  354  4e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  27.28 
 
 
1036 aa  353  7e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  26.46 
 
 
1031 aa  353  8e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  25.31 
 
 
1071 aa  353  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  26.18 
 
 
1041 aa  350  6e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  26.22 
 
 
1055 aa  350  9e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  25.68 
 
 
1095 aa  348  4e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  26.76 
 
 
1029 aa  346  1e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  25.37 
 
 
1034 aa  346  1e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  25.44 
 
 
1075 aa  344  5e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.55 
 
 
1024 aa  343  7e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  25.53 
 
 
1040 aa  341  2.9999999999999998e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  26.53 
 
 
1030 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1829  acriflavin resistance protein  26.24 
 
 
1086 aa  341  4e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0794172  normal  0.266022 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  24.79 
 
 
1070 aa  340  5.9999999999999996e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  25.44 
 
 
1044 aa  340  8e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  26.51 
 
 
1039 aa  339  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  26.58 
 
 
1042 aa  337  5.999999999999999e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  26.58 
 
 
1022 aa  337  7e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  24.11 
 
 
1069 aa  337  7.999999999999999e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  25.72 
 
 
1053 aa  336  1e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  26.03 
 
 
1034 aa  334  6e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  25.36 
 
 
1023 aa  333  1e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1924  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.26 
 
 
1091 aa  332  2e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  25.66 
 
 
1082 aa  332  2e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5161  acriflavin resistance protein  27.11 
 
 
1050 aa  332  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.938326  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0894  acriflavin resistance protein  26.43 
 
 
1060 aa  332  3e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1420  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.46 
 
 
1081 aa  332  3e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2033  acriflavin resistance protein  25.12 
 
 
1044 aa  331  4e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1703  acriflavin resistance protein  26.61 
 
 
1087 aa  331  4e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  25.48 
 
 
1050 aa  330  7e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1628  acriflavin resistance protein  26.52 
 
 
1087 aa  330  8e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0907  acriflavin resistance protein  25.12 
 
 
1043 aa  330  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.582716  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  25.55 
 
 
1031 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  25.55 
 
 
1031 aa  330  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1006  acriflavin resistance protein  26.5 
 
 
1058 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00411218  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  25.55 
 
 
1031 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  25.55 
 
 
1031 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2821  acriflavin resistance protein  25.97 
 
 
1087 aa  328  3e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000195255  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0806  acriflavin resistance protein  25.64 
 
 
1042 aa  328  3e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.326964 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  26.54 
 
 
1045 aa  328  3e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  25.22 
 
 
1046 aa  328  3e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1703  acriflavin resistance protein  26.3 
 
 
1087 aa  328  3e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1780  acriflavin resistance protein  26.58 
 
 
1102 aa  328  4.0000000000000003e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  24.08 
 
 
1065 aa  328  4.0000000000000003e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4318  acriflavin resistance protein  26.97 
 
 
1041 aa  327  6e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.329827 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  26.6 
 
 
1038 aa  327  6e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.62 
 
 
1031 aa  326  1e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  25.26 
 
 
1038 aa  326  1e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  25.62 
 
 
1031 aa  327  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  25.55 
 
 
1031 aa  327  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  25.62 
 
 
1031 aa  326  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1816  acriflavin resistance protein  26.1 
 
 
1023 aa  325  2e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.742902  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3031  acriflavin resistance protein  25.83 
 
 
1042 aa  325  3e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050113  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  24.61 
 
 
1068 aa  325  3e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  25.39 
 
 
1046 aa  325  3e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  25.85 
 
 
1028 aa  325  3e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  26.64 
 
 
1044 aa  325  4e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  25.24 
 
 
1066 aa  324  6e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1892  acriflavin resistance protein  25.54 
 
 
1031 aa  324  6e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3819  acriflavin resistance protein  26.12 
 
 
1068 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.847206  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  25.38 
 
 
1040 aa  322  1.9999999999999998e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4896  acriflavin resistance protein  26.12 
 
 
1068 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.428837 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  26.41 
 
 
1041 aa  322  1.9999999999999998e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4073  acriflavin resistance protein  25.68 
 
 
1055 aa  322  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435843  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4293  acriflavin resistance protein  25.68 
 
 
1055 aa  322  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630799  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3224  acriflavin resistance protein  25.59 
 
 
1055 aa  322  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.292287 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1876  acriflavin resistance protein  24.76 
 
 
1017 aa  322  3e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  26.07 
 
 
1059 aa  321  3.9999999999999996e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1338  acriflavin resistance protein  24.78 
 
 
1044 aa  321  5e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  25.86 
 
 
1006 aa  321  6e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  25.87 
 
 
1083 aa  321  6e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  25.36 
 
 
1031 aa  320  7e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4189  acriflavin resistance protein  25.33 
 
 
1055 aa  320  9e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431989  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  27 
 
 
1040 aa  320  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1726  acriflavin resistance protein  25.94 
 
 
1055 aa  318  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0296271  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2635  acriflavin resistance protein  26.64 
 
 
1085 aa  319  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1732  acriflavin resistance protein  26.5 
 
 
1027 aa  319  2e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4312  acriflavin resistance protein  25.35 
 
 
1055 aa  319  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0578922  normal  0.332205 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>