More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4149 on replicon NC_009958
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009958  Dshi_4149  hexapaptide repeat-containing transferase  100 
 
 
243 aa  505  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.277696 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1575  hexapaptide repeat-containing transferase  43.84 
 
 
239 aa  179  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1121  acetyl transferase  38.34 
 
 
268 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1334  putative acetyltransferase  40.62 
 
 
257 aa  116  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2783  hexapaptide repeat-containing transferase  38.34 
 
 
268 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.290398 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0142  acetyltransferase  37.72 
 
 
208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0147  capsular polysaccharide synthesis enzyme O-acetyl transferase Cap5H, putative  37.72 
 
 
208 aa  112  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0933  hexapeptide repeat-containing transferase  41.4 
 
 
209 aa  112  8.000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.201434  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0420  putative acetyltransferase  38.5 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.857208  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1258  transferase  37.29 
 
 
229 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14160  putative acetyltransferase  37.5 
 
 
229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.223669  normal  0.0980452 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3901  hexapaptide repeat-containing transferase  44.14 
 
 
196 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0602656 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4944  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  36.14 
 
 
174 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1536  putative chloramphenicol acetyltransferase  42.14 
 
 
208 aa  104  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000290239  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1155  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.03 
 
 
219 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0378081  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2793  putative chloramphenicol acetyltransferase  43.06 
 
 
210 aa  103  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3563  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  43.07 
 
 
185 aa  102  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000342506  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3248  chloramphenicol acetyltransferase  42.34 
 
 
185 aa  101  9e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000882178  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1162  acetyltransferase  34.08 
 
 
202 aa  101  9e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00728294  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2049  VatB  35.86 
 
 
211 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3559  acetyltransferase  42.34 
 
 
185 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00169424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3339  acetyltransferase  42.03 
 
 
185 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00224861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3600  acetyltransferase  42.03 
 
 
185 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000293004  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2073  VatB  35.86 
 
 
211 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0183643  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1181  antibiotic acetyltransferase  41.78 
 
 
240 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0246811  normal  0.254871 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1664  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  42.34 
 
 
185 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000881874  hitchhiker  1.93873e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3653  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  42.34 
 
 
185 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00019277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3304  acetyltransferase  42.03 
 
 
185 aa  99.4  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000354114  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3254  acetyltransferase  42.03 
 
 
185 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00705468  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1762  hexapaptide repeat-containing transferase  36.31 
 
 
210 aa  99.4  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0913  chloramphenicol acetyltransferase  35.23 
 
 
212 aa  97.4  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1998  chloramphenicol acetyltransferase  38.41 
 
 
213 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.427174  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4432  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  36.46 
 
 
205 aa  96.3  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.649079  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2756  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  39.47 
 
 
220 aa  95.9  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.801902  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3561  hexapaptide repeat-containing transferase  43.88 
 
 
211 aa  95.9  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.367656  normal  0.425944 
 
 
-
 
NC_004310  BR1415  antibiotic acetyltransferase  38.67 
 
 
229 aa  94.7  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.241418  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2593  streptogramin A acetyl transferase  39.42 
 
 
224 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0587  acetyltransferase  34.32 
 
 
219 aa  94  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.307892  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2692  streptogramin A acetyl transferase  39.42 
 
 
224 aa  93.2  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0600  hexapaptide repeat-containing transferase  35.85 
 
 
226 aa  92.8  5e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.152008  normal  0.590208 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2526  streptogramin A acetyl transferase  38.69 
 
 
167 aa  92.4  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1763  streptogramin A acetyl transferase  40.15 
 
 
225 aa  92.4  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1991  antibiotic acetyltransferase  36.25 
 
 
207 aa  92.4  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2289  hexapaptide repeat-containing transferase  38.51 
 
 
216 aa  92  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1569  hexapaptide repeat-containing transferase  37.96 
 
 
218 aa  92  8e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1563  hexapaptide repeat-containing transferase  39.13 
 
 
218 aa  91.7  9e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.856623  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1600  hexapaptide repeat-containing transferase  37.23 
 
 
218 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000573546  normal  0.406168 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5726  Chloramphenicol acetyltransferase  41.06 
 
 
241 aa  91.3  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4118  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  36.88 
 
 
205 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4048  acetyltransferase  37.24 
 
 
209 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.638 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0223  hexapaptide repeat-containing transferase  36.24 
 
 
226 aa  90.9  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0821  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  35.48 
 
 
201 aa  90.5  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.468594  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2780  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.32 
 
 
218 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737809  normal  0.0617249 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000997  acetyltransferase  34.48 
 
 
219 aa  89.7  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125177  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5875  chloramphenicol acetyltransferase  33.85 
 
 
200 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.0086312  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1494  chloramphenicol O-acetyltransferase  41.3 
 
 
218 aa  90.1  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00845499  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0994  acetyltransferase  37.24 
 
 
210 aa  89.7  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1461  hexapaptide repeat-containing transferase  39.42 
 
 
218 aa  89.7  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1388  hexapaptide repeat-containing transferase  36.99 
 
 
211 aa  89.4  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.220754  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1384  streptogramin A acetyl transferase  39.29 
 
 
226 aa  89.4  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0253879 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1706  putative acetyltransferase  43.48 
 
 
214 aa  89  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.558833  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3692  acetyltransferase  38.67 
 
 
250 aa  89  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4496  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  32.71 
 
 
212 aa  89  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0072  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  38 
 
 
209 aa  88.6  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0332  putative acetyltransferase  44.53 
 
 
214 aa  89  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130953  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0346  putative acetyltransferase  44.53 
 
 
214 aa  89  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.735095 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3819  putative acetyltransferase (virginiamycin, streptogramin A, chloramphenicol)  33.12 
 
 
258 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0731893  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2950  chloramphenicol O-acetyltransferase  33.11 
 
 
210 aa  88.2  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359614  normal  0.149612 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  33.96 
 
 
226 aa  87.8  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.476323  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0391  streptogramin A acetyl transferase  38.57 
 
 
216 aa  87.8  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4229  hexapaptide repeat-containing transferase  35.19 
 
 
204 aa  87  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4433  putative acetyltransferase (virginiamycin, streptogramin A, chloramphenicol)  34.87 
 
 
226 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4299  chloramphenicol acetyltransferase  32.7 
 
 
210 aa  87  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07054  acetyltransferase  36.3 
 
 
217 aa  86.7  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0769  phosphonate metabolim protein, transferase hexapeptide repeat family  33.55 
 
 
225 aa  86.3  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0738  hexapaptide repeat-containing transferase  40.29 
 
 
217 aa  86.3  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12843  normal  0.0447634 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0665  hexapaptide repeat-containing transferase  35.92 
 
 
226 aa  86.3  4e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3259  putative acetyltransferase  37.14 
 
 
206 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3169  streptogramin A acetyl transferase  35.98 
 
 
213 aa  85.9  5e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.210498  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0377  hexapaptide repeat-containing transferase  39.29 
 
 
212 aa  85.9  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.208373  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4083  hexapaptide repeat-containing transferase  36.84 
 
 
221 aa  85.5  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.636222  normal  0.0737735 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0116  hexapaptide repeat-containing transferase  35.44 
 
 
211 aa  85.5  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.278258  hitchhiker  0.00730231 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0155  hexapaptide repeat-containing transferase  36.05 
 
 
212 aa  84.3  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479916 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1678  hypothetical protein  37.96 
 
 
211 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2233  Chloramphenicol O-acetyltransferase  34.01 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0104377  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2450  acetyltransferase  32.75 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.602654  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2629  acetyltransferase  32.75 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2536  hypothetical protein  34.29 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107266  normal  0.384648 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2412  virginiamycin A acetyltransferase  35.77 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00117387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2375  virginiamycin A acetyltransferase  35.77 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.462397  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2653  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  35.04 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04620  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  33.51 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.503837 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0704  chloramphenicol O-acetyltransferase  36.43 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.191265  normal  0.790707 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2671  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  35.04 
 
 
210 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0117743 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3705  hexapaptide repeat-containing transferase  36.5 
 
 
204 aa  81.6  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.308201 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2921  hexapeptide repeat-containing phosphonate metabolisn transferase  37.69 
 
 
205 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0799  putative acetyltransferase  48.61 
 
 
105 aa  80.5  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2647  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  35.04 
 
 
210 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000095527 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2698  acetyltransferase, CYSE/LACA/LPXA/NODL family  34.31 
 
 
209 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.832761  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2320  chloramphenicol O-acetyltransferase  35.05 
 
 
213 aa  80.5  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>