23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_4134 on replicon NC_009958
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009958  Dshi_4134  glycosyltransferase family 28 protein  100 
 
 		 158 aa  316  6e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3223  Glycosyltransferase 28 domain protein  47.13 
 
 		 158 aa  130  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.260535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2975  Glycosyltransferase 28 domain  44.23 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0959  glycosyltransferase family 28 protein  39.72 
 
 		 159 aa  103  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0925107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4577  Glycosyltransferase 28 domain protein  34.38 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5300  D-glucuronyl C5-epimerase domain protein  37.33 
 
 		 489 aa  69.3  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2690  Glycosyltransferase 28 domain protein  33.56 
 
 		 169 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.64917  normal  0.15136 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1169  glycosyl transferase CpsG(V)  29.87 
 
 		 163 aa  60.5  0.000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1359  glycosyltransferase 28-like protein  29.92 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5095  glycosyltransferase family 28 protein  37.93 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1151  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000695436  hitchhiker  0.0000000000708662 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0732  Glycosyltransferase 28 domain protein  35.96 
 
 		 332 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0289106  hitchhiker  0.0000892169 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1840  glycosyltransferase family 28 protein  36.89 
 
 		 222 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1064  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1831  glycosyltransferase family 28 protein  43.94 
 
 		 213 aa  48.9  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.627696  hitchhiker  0.00418899 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1203  glycosyltransferase family 28 protein  27.88 
 
 		 169 aa  47.4  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3668  Glycosyltransferase 28 domain  33.64 
 
 		 313 aa  47.4  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.290399 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2159  glycosyltransferase family 28 protein  29.2 
 
 		 377 aa  43.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.188732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5182  Glycosyltransferase 28 domain protein  30.3 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2976  hypothetical protein  27.56 
 
 		 150 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.919934 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9427  udp-n-acetylglucosamine transferase subunit alg13  30.77 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.819364  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61591  syntenic homolog of ALG13_YEAST UDP-N-acetylglucosamine transferase subunit ALG13 (Asparagine linked glycosylation protein 13)  25.23 
 
 		 214 aa  41.2  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.835119  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3973  glycosyl transferase family 2  52.5 
 
 		 525 aa  40.4  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0772213  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>