27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3707 on replicon NC_009955
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009955  Dshi_3707  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 69 aa  140  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0097  transposase, IS4 family protein  46.77 
 
 		 325 aa  62.4  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3502  transposase, IS4 family protein  45.16 
 
 		 448 aa  55.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2227  transposase, IS4 family protein  45.16 
 
 		 448 aa  55.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0636  transposase IS4 family protein  45.1 
 
 		 435 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0983  transposase, IS4 family protein  42.37 
 
 		 433 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0019  transposase, IS4 family protein  37.04 
 
 		 468 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.148263  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2437  transposase IS4 family protein  37.04 
 
 		 468 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2157  transposase IS4 family protein  37.04 
 
 		 468 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2153  transposase IS4 family protein  37.04 
 
 		 468 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2110  transposase IS4 family protein  37.04 
 
 		 468 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0566508 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1579  transposase IS4 family protein  37.04 
 
 		 468 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1453  transposase IS4 family protein  37.04 
 
 		 468 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.243782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1258  transposase IS4 family protein  37.04 
 
 		 468 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000986472 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1019  transposase IS4 family protein  37.04 
 
 		 468 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.865831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0956  transposase IS4 family protein  37.04 
 
 		 468 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0821634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0352  transposase, IS4 family protein  37.04 
 
 		 468 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0269  transposase, IS4 family protein  37.04 
 
 		 468 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0262  transposase, IS4 family protein  37.04 
 
 		 468 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0017  transposase, IS4 family protein  37.04 
 
 		 468 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0632  transposase, IS4 family protein  40.68 
 
 		 433 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1082  transposase IS4 family protein  37.04 
 
 		 456 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105958  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0435  transposase, IS4 family protein  40.68 
 
 		 433 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.967999  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0163  transposase, IS4 family protein  40.68 
 
 		 433 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4092  transposase, IS4 family protein  40.68 
 
 		 433 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.819916  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1627  transposase, IS4  42.37 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2431  transposase IS1380 family protein  30 
 
 		 494 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>