75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3253 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_3253  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  100 
 
 
141 aa  270  3e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2959  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  48.12 
 
 
138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.569087  normal  0.151047 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1325  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  53.78 
 
 
139 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2606  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  48.53 
 
 
139 aa  124  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.690909  hitchhiker  0.000478924 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2986  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  53.04 
 
 
139 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4192  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  50.38 
 
 
140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2116  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  36.59 
 
 
138 aa  75.1  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.447547 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1948  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  34.38 
 
 
314 aa  63.5  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.68378  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5511  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  38.37 
 
 
355 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0835333  normal  0.915712 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0262  lateral flagellar P-ring addition protein LfgA  36.19 
 
 
245 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3845  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  29.32 
 
 
246 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0020675 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3761  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  29.84 
 
 
246 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.417921  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0523  SAF domain-containing protein  33.82 
 
 
262 aa  55.1  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3788  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  36.47 
 
 
358 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.09068  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3280  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  32.81 
 
 
243 aa  53.9  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2844  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.53 
 
 
360 aa  53.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2925  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  33.98 
 
 
242 aa  53.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2560  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.82 
 
 
326 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.443953 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3955  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.05 
 
 
250 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1460  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.05 
 
 
250 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4394  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.05 
 
 
225 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1682  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.37 
 
 
366 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0494541 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2216  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like  29.2 
 
 
243 aa  52.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1175  SAF domain-containing protein  35.11 
 
 
235 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3735  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.16 
 
 
250 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410468  normal  0.976708 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1505  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.94 
 
 
370 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.563767 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000741  flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  31.62 
 
 
265 aa  50.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3475  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.48 
 
 
326 aa  49.7  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455996  normal  0.226708 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3372  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  33.33 
 
 
245 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1430  flagellar basal body P-ring formation protein FlgA  28.57 
 
 
247 aa  48.9  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3450  SAF domain-containing protein  28.35 
 
 
238 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4105  SAF domain-containing protein  29.13 
 
 
238 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1621  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  37.96 
 
 
225 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.99379  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4424  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  32.91 
 
 
342 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0940  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.59 
 
 
233 aa  48.1  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0970  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.59 
 
 
233 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1120  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.4 
 
 
380 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1926  flagellar protein, putative  26.67 
 
 
248 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210434  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1780  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28 
 
 
232 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498263  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2427  FlgA family protein  39.06 
 
 
324 aa  47  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.487675 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3487  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.67 
 
 
252 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0824  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  35.14 
 
 
379 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.806088  normal  0.019726 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2683  flageller protein FlgA  30.99 
 
 
235 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04908  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.77 
 
 
265 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1382  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.27 
 
 
373 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3244  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  32.81 
 
 
348 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3050  flagella basal body P-ring formation protein flgA, putative  25.74 
 
 
248 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4208  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.75 
 
 
160 aa  44.3  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0923  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  28.89 
 
 
244 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1477  flageller protein FlgA  27.14 
 
 
245 aa  43.9  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20740  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27.2 
 
 
232 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1337  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  35.29 
 
 
257 aa  43.5  0.0009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.477846  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0432  flageller protein FlgA  27.21 
 
 
236 aa  43.5  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1540  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  27.82 
 
 
255 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4711  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  32.94 
 
 
343 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0269631  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0139  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.93 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.126341  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3270  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  33.72 
 
 
348 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.132076  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3046  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  33.72 
 
 
348 aa  41.6  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4254  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.98 
 
 
232 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0890  flageller protein FlgA  33.08 
 
 
238 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.111285  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0183  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  32.77 
 
 
257 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1908  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.71 
 
 
218 aa  41.2  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.669338  normal  0.182462 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2341  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.46 
 
 
248 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0393  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  26.83 
 
 
416 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0718  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.23 
 
 
272 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1155  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein  29.73 
 
 
240 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0638  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.23 
 
 
272 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0228  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  28.23 
 
 
282 aa  41.6  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.531559 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2936  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.98 
 
 
418 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.451433 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1795  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  31.46 
 
 
255 aa  41.2  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1667  SAF domain-containing protein  33 
 
 
220 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0285706  normal  0.0223533 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0205  SAF domain-containing protein  27.07 
 
 
281 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.620643 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0036  flagellar basal-body P-ring formation protein FlgA  33 
 
 
222 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.22865  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4196  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  31.71 
 
 
347 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6372  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  33.98 
 
 
320 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.682175  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>