77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3245 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3245  putative proteasome-type protease  100 
 
 		 261 aa  536  1e-151  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.716596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2117  20S proteasome, A and B subunits  69.26 
 
 		 244 aa  354  8.999999999999999e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.434254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3527  20S proteasome A and B subunits  67.76 
 
 		 245 aa  352  4e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175971  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0009  20S proteasome, A and B subunits  63.79 
 
 		 243 aa  337  9.999999999999999e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.645692 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1812  20S proteasome, A and B subunits  64.05 
 
 		 243 aa  334  7.999999999999999e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2679  20S proteasome, A and B subunits  65.04 
 
 		 245 aa  334  1e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123152  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2772  20S proteasome, A and B subunits  63.64 
 
 		 254 aa  325  5e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0537  20S proteasome A and B subunits  50.41 
 
 		 242 aa  260  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1358  20S proteasome, A and B subunits  48.8 
 
 		 275 aa  252  5.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.445636  normal  0.0520687 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3577  20S proteasome A and B subunits  48.76 
 
 		 246 aa  249  4e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.852438  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3590  20S proteasome A and B subunits  46.83 
 
 		 279 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82671  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0361  20S proteasome A and B subunits  47.52 
 
 		 245 aa  240  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3874  20S proteasome A and B subunits  48.54 
 
 		 259 aa  240  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1155  20S proteasome, A and B subunits  48.33 
 
 		 275 aa  240  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.15814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1075  20S proteasome A and B subunits  48.33 
 
 		 275 aa  240  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0766  hypothetical protein  48.99 
 
 		 290 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.614419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4446  hypothetical protein  48.75 
 
 		 290 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3338  20S proteasome, A and B subunits  45.6 
 
 		 286 aa  234  9e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.425483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1564  20S proteasome, A and B subunits  47.7 
 
 		 241 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.268421  normal  0.265667 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1180  hypothetical protein  47.15 
 
 		 275 aa  233  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.545681 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3573  hypothetical protein  46.44 
 
 		 243 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3163  putative proteasome-type protease  46.12 
 
 		 269 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0527067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0401  20S proteasome, A and B subunits  46.67 
 
 		 242 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2843  hypothetical protein  46.03 
 
 		 275 aa  231  9e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3913  20S proteasome, A and B subunits  45.64 
 
 		 276 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.027535 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0826  20S proteasome, A and B subunits  48.16 
 
 		 252 aa  231  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.260877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1310  20S proteasome, A and B subunits  45.42 
 
 		 267 aa  231  1e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.415114  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2420  hypothetical protein  45.61 
 
 		 241 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3790  20S proteasome A and B subunits  46.69 
 
 		 256 aa  230  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.596089 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1081  20S proteasome, A and B subunits  45.61 
 
 		 241 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1943  20S proteasome A and B subunits  44.4 
 
 		 247 aa  229  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65129 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42130  hypothetical protein  45.42 
 
 		 243 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5276  hypothetical protein  45.45 
 
 		 252 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15873  normal  0.282799 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2273  proteasome-type protease-like protein  46.47 
 
 		 352 aa  227  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0927551 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2046  20S proteasome, A and B subunits  45.42 
 
 		 275 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2237  putative proteasome-type protease  45.04 
 
 		 248 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.345508 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1831  hypothetical protein  45.42 
 
 		 275 aa  226  3e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2468  20S proteasome A and B subunits  44.63 
 
 		 248 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0887682  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3219  putative proteasome-type protease  44.21 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.262147  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3068  proteasome-type protease-like protein  44.35 
 
 		 240 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.308657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1086  hypothetical protein  45.56 
 
 		 273 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1124  hypothetical protein  45.96 
 
 		 304 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal  0.236863 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4514  hypothetical protein  45.34 
 
 		 300 aa  219  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767293  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2685  hypothetical protein  43.93 
 
 		 240 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.292721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7514  putative proteasome-type protease  45.64 
 
 		 250 aa  219  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.183506  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3014  putative proteasome-type protease  45.69 
 
 		 244 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0967  hypothetical protein  45.53 
 
 		 300 aa  217  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0496453 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6767  putative proteasome-type protease  44.81 
 
 		 250 aa  216  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2172  20S proteasome A and B subunits  46.47 
 
 		 248 aa  217  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0581  putative proteasome-type protease  45.87 
 
 		 250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.124248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1063  hypothetical protein  45.53 
 
 		 300 aa  215  7e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.503202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2215  putative proteasome-type protease  46.47 
 
 		 248 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.026686  normal  0.29725 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1050  putative proteasome-type protease  44.35 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.663449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2491  putative proteasome-type protease  46.47 
 
 		 248 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.400547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1017  hypothetical protein  41.91 
 
 		 266 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3109  putative proteasome-type protease  43.93 
 
 		 240 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1430  hypothetical protein  45.83 
 
 		 292 aa  211  5.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1224  20S proteasome A and B subunits  41.91 
 
 		 275 aa  211  9e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.295708  normal  0.716192 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3432  20S proteasome A and B subunits  44.44 
 
 		 249 aa  209  5e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182468  normal  0.0168143 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1674  20S proteasome A and B subunits  41.91 
 
 		 281 aa  202  4e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0772  20S proteasome, A and B subunits  42.32 
 
 		 241 aa  201  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.546228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2903  hypothetical protein  40.25 
 
 		 256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2521  20S proteasome, A and B subunits  40.25 
 
 		 256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2055  hypothetical protein  37.14 
 
 		 254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0305  20S proteasome, A and B subunits  41.49 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2564  putative proteasome-type protease  38.17 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3542  hypothetical protein  38.17 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1255  20S proteasome A and B subunits  36.14 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3877  hypothetical protein  38.91 
 
 		 241 aa  179  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.119044 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1035  putative proteasome-type protease  37.9 
 
 		 264 aa  178  8e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.375974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1405  20S proteasome, A and B subunits  39.52 
 
 		 260 aa  174  9e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.372118 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2086  hypothetical protein  40.17 
 
 		 258 aa  174  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000418459  hitchhiker  0.00675376 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3460  proteasome-type protease  33.47 
 
 		 243 aa  132  6e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0153952 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0411  proteasome-type protease  31.73 
 
 		 240 aa  123  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.101447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2854  putative proteasome-type protease  29.55 
 
 		 245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0195772  normal  0.483271 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2600  proteasome-type protease  29.8 
 
 		 251 aa  110  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2008  proteasome endopeptidase complex  23.58 
 
 		 203 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.177612 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>