More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1982 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1982  aldo/keto reductase family protein  100 
 
 		 360 aa  724    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.454617 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0712  aldo/keto reductase  50.89 
 
 		 380 aa  319  5e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000693877 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1528  aldo/keto reductase  41.64 
 
 		 339 aa  247  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.162616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0767  aldo/keto reductase  40.71 
 
 		 336 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1985  aldo/keto reductase family protein  41.64 
 
 		 480 aa  187  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.282882 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_42373  predicted protein  33.33 
 
 		 340 aa  173  3.9999999999999995e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.71632  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31589  predicted protein  40.71 
 
 		 239 aa  140  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231835  normal  0.784447 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08658  conserved hypothetical protein  29.74 
 
 		 463 aa  114  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0175824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1335  aldo/keto reductase  27.96 
 
 		 329 aa  97.1  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.546872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2653  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  30.5 
 
 		 332 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.481202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2200  aldo/keto reductase  26.51 
 
 		 314 aa  95.1  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154507  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0968  aldo/keto reductase  31.68 
 
 		 349 aa  92.8  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00511053 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3087  aldo/keto reductase  29.32 
 
 		 333 aa  90.1  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000843919  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3351  aldo/keto reductase  29.65 
 
 		 327 aa  89.7  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5425  aldo/keto reductase  26.25 
 
 		 330 aa  89.7  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00742012  normal  0.209016 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1519  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  27.84 
 
 		 344 aa  89.4  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.481251  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0948  aldo/keto reductase  29.91 
 
 		 333 aa  89.4  9e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00901952  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0148  aldo/keto reductase  29.9 
 
 		 352 aa  89  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.243266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4718  aldo/keto reductase  28 
 
 		 330 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.964047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0913  aldo/keto reductase  28.43 
 
 		 352 aa  88.6  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.287018 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1723  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  28.74 
 
 		 332 aa  88.6  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1278  aldo/keto reductase  29.5 
 
 		 332 aa  87.8  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1003  aldo/keto reductase  27.36 
 
 		 319 aa  87  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3100  aldo/keto reductase  28.08 
 
 		 319 aa  86.7  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.124867  normal  0.776601 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  29.67 
 
 		 350 aa  86.7  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4219  aldo/keto reductase  30.16 
 
 		 325 aa  86.3  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4295  aldo/keto reductase  27.16 
 
 		 327 aa  86.3  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895367  normal  0.198699 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  28.61 
 
 		 339 aa  85.9  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1414  aldo/keto reductase  28.44 
 
 		 332 aa  85.9  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.825593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  28.61 
 
 		 339 aa  85.9  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1283  aldo/keto reductase  26.01 
 
 		 306 aa  85.9  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1048  aldo/keto reductase  29.22 
 
 		 343 aa  85.9  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.035581  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3746  aldo/keto reductase  29.53 
 
 		 334 aa  85.9  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4156  aldo/keto reductase  27.73 
 
 		 335 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0249282  normal  0.138418 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3265  aldo/keto reductase  28.01 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3202  putative aldo-keto reductase  28.71 
 
 		 346 aa  83.6  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0252563  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1681  aldo/keto reductase  28.48 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1879  aldo/keto reductase  28.62 
 
 		 338 aa  83.2  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7726  aldo/keto reductase  29.26 
 
 		 347 aa  83.2  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1272  aldo/keto reductase  28.19 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.200155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6576  aldo/keto reductase  29.87 
 
 		 349 aa  83.2  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2023  aldo/keto reductase  28 
 
 		 337 aa  82.8  0.000000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0725313  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1857  aldo/keto reductase  30.9 
 
 		 333 aa  82.8  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3949  aldo/keto reductase  27.6 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2751  aldo/keto family dehydrogenase  26.98 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000178849 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0108  aldo/keto reductase  28.72 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00484238 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0460  aldo/keto reductase  27.13 
 
 		 349 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25860  Aldo/keto reductase protein  27.69 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3225  aldo/keto reductase  30.86 
 
 		 323 aa  80.5  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.779629  normal  0.443318 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2659  aldo/keto reductase  28.93 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0194115  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2987  aldo/keto reductase  29.34 
 
 		 336 aa  80.5  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3524  aldo/keto reductase  31.62 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4543  aldo/keto reductase  26.8 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.785787  normal  0.78245 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1185  aldo/keto reductase  27.39 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0397337 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1764  aldo/keto reductase  31.1 
 
 		 354 aa  79.7  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3193  aldo/keto reductase  30.97 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  0.13692 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1462  aldo/keto reductase  27.01 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2390  aldo/keto reductase  27.92 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000519885  hitchhiker  0.000458148 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1762  aldo/keto reductase  26.2 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0199  aldo/keto reductase family oxidoreductase TAS  26.22 
 
 		 352 aa  79.7  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4616  aldo/keto reductase  24.61 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0526321  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  28.22 
 
 		 370 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1641  aldo/keto reductase  31.46 
 
 		 325 aa  79.3  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000385668 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0899  putative aldo-keto reductase  27.42 
 
 		 346 aa  79.3  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0480243  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1322  aldo/keto reductase  26.58 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6431  aldo/keto reductase  28.83 
 
 		 324 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1155  aldo/keto reductase  26.14 
 
 		 311 aa  79.3  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2829  aldo/keto reductase  29.79 
 
 		 341 aa  79  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1649  aldo/keto reductase  26.18 
 
 		 350 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5935  aldo/keto reductase  28.57 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.431084  normal  0.0103117 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2624  putative oxidoreductase  26.06 
 
 		 347 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.7862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1360  aldo/keto reductase  28.3 
 
 		 328 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2446  aldo/keto reductase  25.86 
 
 		 342 aa  77.8  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1077  aldo/keto reductase  27.86 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000399165 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2762  aldo/keto reductase  30.45 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4278  aldo/keto reductase  26.76 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.768221 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1041  aldo/keto reductase  30.52 
 
 		 329 aa  77.8  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1526  aldo/keto reductase  25.61 
 
 		 347 aa  77.4  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.933901  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0505  aldo/keto reductase  27.04 
 
 		 349 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0236389 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2296  aldo/keto reductase  26.67 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.209933  decreased coverage  0.0000407872 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1541  aldo/keto reductase  25.57 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.941337  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2535  aldo/keto reductase  26.62 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00875609  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2949  aldo/keto reductase  29.5 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4632  aldo/keto reductase  26.63 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.962922 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15540  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  27.19 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3828  putative aldo-keto reductase  25.83 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0132972  normal  0.503981 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  28.22 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2595  aldo/keto reductase  27.22 
 
 		 325 aa  76.6  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1876  aldo/keto reductase  26.62 
 
 		 342 aa  76.3  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1004  K+ channel beta subunit  28.06 
 
 		 334 aa  76.3  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0098418  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1108  aldo/keto reductase  29.22 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3453  Aryl-alcohol dehydrogenase (NADP(+))  27.67 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.970161  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3155  aldo/keto reductase  28.1 
 
 		 353 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.107134 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20030  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  30.48 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2491  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  27.33 
 
 		 345 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10590  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  26.5 
 
 		 331 aa  75.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.244513 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0950  aldo/keto reductase  26.85 
 
 		 334 aa  75.5  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.493854  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004434  oxidoreductase Tas aldo/keto reductase family  25.43 
 
 		 344 aa  75.9  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0724585  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1549  aldo/keto reductase  27.76 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.886416  normal  0.340196 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3403  putative aldo-keto reductase  26.5 
 
 		 353 aa  74.7  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000401473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>