More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1966 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_2610  pyruvate dehydrogenase complex E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  60.65 
 
 		 589 aa  682    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3520  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.27 
 
 		 602 aa  670    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.501053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6299  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.94 
 
 		 625 aa  659    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0179219 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0571  dihydrolipoyl dehydrogenase, E3 component of pyruvate dehydrogenases complex  68.94 
 
 		 474 aa  642    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1944  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.49 
 
 		 593 aa  658    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0868874  hitchhiker  0.000336212 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2589  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.54 
 
 		 600 aa  683    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.835737  decreased coverage  0.000383256 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1719  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  60.48 
 
 		 589 aa  677    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0148218  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2045  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.68 
 
 		 592 aa  676    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3092  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  60.48 
 
 		 589 aa  677    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0122251  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0440  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.43 
 
 		 591 aa  637    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.46872  normal  0.0861409 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1306  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.64 
 
 		 593 aa  635    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03103  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.47 
 
 		 607 aa  682    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1911  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.06 
 
 		 603 aa  642    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00687521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2743  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  60.48 
 
 		 589 aa  676    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7193  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.15 
 
 		 619 aa  729    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1966  dihydrolipoyl dehydrogenase  100 
 
 		 580 aa  1155    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258169  normal  0.0783557 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1241  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.64 
 
 		 599 aa  723    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5441  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.26 
 
 		 588 aa  672    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2153  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.37 
 
 		 590 aa  671    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0291933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1003  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.58 
 
 		 594 aa  721    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.851611  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.03 
 
 		 626 aa  710    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1500  pyruvate dehydrogenase complex E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  60.48 
 
 		 589 aa  677    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.628337  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1866  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  61.16 
 
 		 589 aa  679    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2165  dihydrolipoamide dehydrogenase  57 
 
 		 610 aa  636    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.327793  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1981  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.23 
 
 		 603 aa  639    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.01171  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1616  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.81 
 
 		 593 aa  656    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00163952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1554  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.79 
 
 		 589 aa  640    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2076  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.73 
 
 		 588 aa  724    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1543  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.23 
 
 		 603 aa  687    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.110052  normal  0.0211512 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1035  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.66 
 
 		 593 aa  642    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.356313  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2665  pyruvate dehydrogenase complex E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  60.48 
 
 		 589 aa  677    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1086  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.86 
 
 		 587 aa  669    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0812203  normal  0.813461 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2454  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.98 
 
 		 579 aa  694    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.12 
 
 		 594 aa  689    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.308322 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4916  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.56 
 
 		 595 aa  676    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5942  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.09 
 
 		 588 aa  680    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00253524  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2965  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.82 
 
 		 680 aa  719    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155449  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5336  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.53 
 
 		 590 aa  645    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.110925  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0271  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.19 
 
 		 593 aa  640    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.146735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1135  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.33 
 
 		 589 aa  682    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.373004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2172  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.58 
 
 		 588 aa  684    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6503  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.54 
 
 		 592 aa  676    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.120205  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1612  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.94 
 
 		 474 aa  643    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1468  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.45 
 
 		 685 aa  712    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0186247  normal  0.515746 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2228  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  60.48 
 
 		 589 aa  677    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.467573  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0736  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.69 
 
 		 594 aa  665    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.871473  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2135  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.09 
 
 		 588 aa  680    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3247  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.56 
 
 		 595 aa  676    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.639352 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1603  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.53 
 
 		 594 aa  630  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00100727  normal  0.394901 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3197  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.57 
 
 		 605 aa  631  1e-179  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.46 
 
 		 607 aa  626  1e-178  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.459857 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1199  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.42 
 
 		 592 aa  625  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000025561  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3352  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.54 
 
 		 474 aa  622  1e-177  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000157637  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2214  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.51 
 
 		 619 aa  620  1e-176  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.630644  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2096  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.01 
 
 		 616 aa  621  1e-176  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2669  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.49 
 
 		 614 aa  618  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1784  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.68 
 
 		 621 aa  620  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00978401 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1459  lipoamide dehydrogenase  66.53 
 
 		 474 aa  617  1e-175  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1524  lipoamide dehydrogenase  66.53 
 
 		 474 aa  617  1e-175  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2126  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.78 
 
 		 595 aa  617  1e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0676  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.69 
 
 		 474 aa  613  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0168  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.06 
 
 		 474 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.928694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0173  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.06 
 
 		 474 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0167  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.06 
 
 		 474 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4009  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.85 
 
 		 474 aa  605  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0176  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.06 
 
 		 475 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3429  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.48 
 
 		 475 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0358795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1988  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.48 
 
 		 475 aa  605  9.999999999999999e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0167  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.06 
 
 		 474 aa  605  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0636  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.06 
 
 		 474 aa  606  9.999999999999999e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00115  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.06 
 
 		 474 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3486  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.06 
 
 		 474 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0428  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.14 
 
 		 475 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00251394  normal  0.166632 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3489  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.42 
 
 		 474 aa  604  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.71639  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3566  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.63 
 
 		 474 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0426  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.92 
 
 		 475 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0120  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.06 
 
 		 474 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0447957  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3360  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.42 
 
 		 474 aa  604  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3415  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.92 
 
 		 475 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000233503  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3543  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.85 
 
 		 474 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.399649  normal  0.262226 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0118  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.06 
 
 		 474 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00709642  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3381  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.35 
 
 		 476 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000696126  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1031  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.42 
 
 		 475 aa  604  1.0000000000000001e-171  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03223  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.4 
 
 		 473 aa  603  1.0000000000000001e-171  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.416876  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3911  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.92 
 
 		 475 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000450783  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0123  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.06 
 
 		 495 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0126  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.06 
 
 		 495 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0109  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.06 
 
 		 474 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.809196  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0430  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.92 
 
 		 475 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3597  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.14 
 
 		 475 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000546829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3752  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.42 
 
 		 474 aa  601  1e-170  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.361486  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3854  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.71 
 
 		 475 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.075768  hitchhiker  0.000000345632 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0377  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.68 
 
 		 476 aa  601  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349282 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4052  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.71 
 
 		 475 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00676379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0662  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.85 
 
 		 474 aa  599  1e-170  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.42488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3932  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.5 
 
 		 475 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000133391  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2623  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.58 
 
 		 475 aa  600  1e-170  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.798797  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3002  pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  65.82 
 
 		 473 aa  596  1e-169  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1659  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.22 
 
 		 619 aa  597  1e-169  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.349969  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0433  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.57 
 
 		 475 aa  598  1e-169  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000206937 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>