67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2549 on replicon NC_013224
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013224  Dret_2549  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  100 
 
 
252 aa  523  1e-147  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3532  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.77 
 
 
267 aa  54.7  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.440443  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9800  replication protein A  28.26 
 
 
409 aa  52.8  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2752  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.23 
 
 
262 aa  50.4  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4519  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.23 
 
 
313 aa  49.7  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.187325  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.77 
 
 
254 aa  49.7  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.92 
 
 
253 aa  48.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1413  capsular exopolysaccharide family  28.44 
 
 
735 aa  47.8  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.44637  normal  0.40956 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  30.25 
 
 
257 aa  47.8  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  30.71 
 
 
253 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25 
 
 
407 aa  47  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4571  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.91 
 
 
404 aa  47  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.77 
 
 
253 aa  46.6  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2566  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 
282 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.773766  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  29.92 
 
 
253 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  29.92 
 
 
253 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0241  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.58 
 
 
300 aa  45.8  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.811562  normal  0.0256625 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.77 
 
 
253 aa  46.2  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  29.92 
 
 
253 aa  45.8  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  29.92 
 
 
253 aa  45.8  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  29.92 
 
 
253 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  29.92 
 
 
253 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  29.92 
 
 
253 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  29.92 
 
 
253 aa  45.8  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.28 
 
 
404 aa  45.8  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.58 
 
 
262 aa  45.8  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1576  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.46 
 
 
257 aa  45.4  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332666  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4104  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.56 
 
 
397 aa  44.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324179  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5239  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  21.74 
 
 
259 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000091984  hitchhiker  0.0000000000884158 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9501  replication protein A  30 
 
 
405 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222629  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1217  ParA family protein  27.07 
 
 
280 aa  44.7  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.46 
 
 
253 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4177  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.68 
 
 
387 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6501  plasmid partitioning protein RepA  23.19 
 
 
404 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.13 
 
 
253 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3736  plasmid partitioning protein RepA  24.09 
 
 
408 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9001  replication protein A  24.44 
 
 
399 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4191  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.74 
 
 
420 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901272  normal  0.680764 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5555  plasmid partitioning protein RepA  25.55 
 
 
405 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.661673 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6317  plasmid partitioning protein RepA  25.62 
 
 
405 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1176  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  20.77 
 
 
254 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291287  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.82 
 
 
252 aa  44.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.284037  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5000  replication protein A  25.36 
 
 
420 aa  43.5  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4186  RepA partitioning protein/ATPase, ParA type  25.56 
 
 
394 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.04151  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2197  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.75 
 
 
242 aa  43.5  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000739548  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5873  plasmid partitioning protein RepA  23.13 
 
 
405 aa  43.9  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128849  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7789  plasmid partitioning protein RepA  25.9 
 
 
405 aa  43.9  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.45198  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6162  plasmid partitioning protein RepA  25.36 
 
 
404 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.49965  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4689  plasmid partitioning protein RepA  24.44 
 
 
402 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10454  normal  0.803552 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0575  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.28 
 
 
277 aa  43.9  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  24.81 
 
 
258 aa  43.1  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5615  plasmid partitioning protein RepA  23.08 
 
 
408 aa  43.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.199114 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.12 
 
 
400 aa  43.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0079  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25 
 
 
256 aa  43.5  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5377  plasmid partitioning protein RepA  23.13 
 
 
405 aa  43.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408708  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4789  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.12 
 
 
387 aa  42.7  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.076168  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  27.37 
 
 
260 aa  42.7  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.46 
 
 
273 aa  42.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.488481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5789  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.33 
 
 
278 aa  42.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3561  plasmid partitioning protein RepA  25 
 
 
405 aa  42.7  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0765  hypothetical protein  25.47 
 
 
304 aa  42.4  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5337  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.14 
 
 
401 aa  42.7  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684044  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4230  chromosome segregation ATPase  23.08 
 
 
266 aa  42.4  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.096777  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  27.2 
 
 
249 aa  42.4  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  23.39 
 
 
259 aa  42  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0479  putative sporulation initiation inhibitor protein Soj  28.91 
 
 
279 aa  42  0.009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4517  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.74 
 
 
401 aa  42  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>