More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2093 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2093  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  100 
 
 
275 aa  537  9.999999999999999e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.269505 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1350  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.33 
 
 
284 aa  170  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2423  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.15 
 
 
282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1043  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  40.39 
 
 
280 aa  166  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000044291  hitchhiker  0.000000000393673 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1193  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.69 
 
 
281 aa  161  9e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0252  molybdopterin and thiamine biosynthesis protein  38.62 
 
 
272 aa  159  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2935  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.18 
 
 
282 aa  156  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0890  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.09 
 
 
273 aa  154  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1720  molybdopterin and thiamine biosynthesis family protein  41.27 
 
 
272 aa  149  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000223945  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1953  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.7 
 
 
336 aa  149  6e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1679  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.28 
 
 
226 aa  149  6e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1706  ThiF protein, putative  39.71 
 
 
272 aa  144  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1702  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.86 
 
 
264 aa  142  5e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00338443  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1588  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.22 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.475165  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0409  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.82 
 
 
294 aa  137  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.667354 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2316  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.71 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0149122 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2504  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37 
 
 
285 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00024143  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2153  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.8 
 
 
267 aa  131  9e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.779112  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1383  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.36 
 
 
225 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2835  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.21 
 
 
278 aa  130  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2459  thiF protein, putative  42.45 
 
 
284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.6505  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24690  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  37.55 
 
 
232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2082  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.29 
 
 
288 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.880254 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0589  hypothetical protein  33.33 
 
 
236 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0970373  hitchhiker  0.000644128 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.6 
 
 
443 aa  112  6e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.47369 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.58 
 
 
244 aa  112  9e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0421  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.93 
 
 
270 aa  105  8e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.130311 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1822  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.19 
 
 
256 aa  103  4e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0657406  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0823  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.58 
 
 
226 aa  99  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272432  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2358  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.35 
 
 
248 aa  97.4  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.79 
 
 
379 aa  97.1  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2264  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.26 
 
 
258 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.927293  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0047  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  30.26 
 
 
255 aa  94  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2183  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  30.2 
 
 
245 aa  94.7  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1238  4-methyl-5-(beta-hydroxyethyl)thiazole monophosphate synthesis protein ThiF  29.67 
 
 
247 aa  93.6  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0112  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.86 
 
 
216 aa  93.6  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.157166  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.48 
 
 
237 aa  93.2  4e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1439  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.51 
 
 
239 aa  92.8  5e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0383  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.16 
 
 
223 aa  92.8  6e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.351767  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0806  dinucleotide-utilizing enzyme  30.87 
 
 
269 aa  92.4  8e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0887502  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  36.24 
 
 
480 aa  92.4  8e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3226  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.36 
 
 
246 aa  92  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000441041  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1275  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.51 
 
 
291 aa  91.7  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30 
 
 
393 aa  91.3  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0130  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  28.03 
 
 
252 aa  92  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0188  hypothetical protein  30.29 
 
 
252 aa  91.3  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430925  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4639  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30 
 
 
355 aa  91.7  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0522  HesA/MoeB/ThiF family protein  39.46 
 
 
267 aa  91.3  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0560  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  30.57 
 
 
254 aa  91.3  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0522  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.2 
 
 
259 aa  91.3  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30 
 
 
392 aa  91.3  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4592  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.57 
 
 
392 aa  90.5  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.418799  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3176  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.62 
 
 
257 aa  90.5  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8385  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  30.87 
 
 
393 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250903  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0096  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  29.82 
 
 
256 aa  90.5  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1777  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  30.77 
 
 
396 aa  90.5  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1465  normal  0.131801 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4642  adenylyltransferase ThiF  31.12 
 
 
249 aa  90.1  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.144035  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0885  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  28.26 
 
 
260 aa  89.7  4e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0130  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  28.51 
 
 
255 aa  90.1  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0135  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  28.95 
 
 
255 aa  89.7  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4878  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.05 
 
 
249 aa  89.4  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3717  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.43 
 
 
249 aa  89.4  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.184185  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19960  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  31.84 
 
 
233 aa  89  8e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4247  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.13 
 
 
386 aa  89  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.020881  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  30.9 
 
 
380 aa  88.2  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4224  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  27.95 
 
 
255 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0454  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  30.87 
 
 
393 aa  87.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427252  decreased coverage  0.00000325534 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1283  thiamine biosynthesis protein ThiF family protein  30.66 
 
 
243 aa  87.8  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0277  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.47 
 
 
243 aa  87.8  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  30 
 
 
386 aa  87.8  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1880  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.96 
 
 
282 aa  87.8  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0390  rhodanese-like protein  32.88 
 
 
378 aa  87.4  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.734  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  31.65 
 
 
388 aa  87.4  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1695  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.59 
 
 
393 aa  87.4  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.294225  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  30.43 
 
 
390 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  32.19 
 
 
390 aa  87.8  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0728  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.7 
 
 
247 aa  87.8  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0134  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  28.07 
 
 
255 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1693  HesA/MoeB/ThiF family protein  36.64 
 
 
249 aa  86.7  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.658136 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1118  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  29.87 
 
 
250 aa  87  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1047  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.17 
 
 
253 aa  87  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4670  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  31.33 
 
 
392 aa  87  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.794416  normal  0.136136 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  30 
 
 
390 aa  87  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06750  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  31.2 
 
 
398 aa  86.7  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1931  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  29.05 
 
 
249 aa  86.7  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.477198  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0178  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.94 
 
 
243 aa  86.7  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0660  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  29 
 
 
252 aa  86.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0383  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  30 
 
 
393 aa  86.3  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0214  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.14 
 
 
361 aa  86.3  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22891  molybdopterin biosynthesis protein  31.66 
 
 
409 aa  85.9  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16891  molybdopterin biosynthesis protein  29.36 
 
 
379 aa  85.9  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1409  HesA/MoeB/ThiF family protein  29 
 
 
252 aa  85.9  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3210  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  29 
 
 
252 aa  85.9  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0495  HesA/MoeB/ThiF family protein  29 
 
 
252 aa  85.9  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2836  HesA/MoeB/ThiF family protein  29 
 
 
252 aa  85.9  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0476  HesA/MoeB/ThiF family protein  29 
 
 
252 aa  85.9  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1623  hypothetical protein  42.07 
 
 
295 aa  85.9  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.240534  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0183  HesA/MoeB/ThiF family protein  29 
 
 
252 aa  85.9  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.91 
 
 
383 aa  85.5  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3812  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.57 
 
 
278 aa  85.5  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>