14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1637 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1637  Dissimilatory sulfite reductase D  100 
 
 
72 aa  147  4e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0246  Dissimilatory sulfite reductase D  60 
 
 
79 aa  86.3  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.696801  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0281  Dissimilatory sulfite reductase D  62.07 
 
 
78 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.202517  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2671  dissimilatory sulfite reductase D  55.71 
 
 
82 aa  72  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1555  Dissimilatory sulfite reductase D  54.41 
 
 
77 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.669867 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2530  dissimilatory sulfite reductase B  54.41 
 
 
78 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.652855  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2293  Dissimilatory sulfite reductase D  49.25 
 
 
78 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0528824  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4041  hypothetical protein  50 
 
 
78 aa  65.5  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1599  dissimilatory sulfite reductase B  56.9 
 
 
77 aa  62.4  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000458387  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0528  dissimilatory sulfite reductase B  56.25 
 
 
76 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0919  Dissimilatory sulfite reductase D  51.85 
 
 
76 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2199  dissimilatory sulfite reductase B  46.43 
 
 
77 aa  50.8  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0081  Dissimilatory sulfite reductase D  44.83 
 
 
77 aa  50.1  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310625  hitchhiker  0.00257513 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2092  Dissimilatory sulfite reductase D  42.11 
 
 
82 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>