47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0958 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0958  protein of unknown function DUF1121  100 
 
 
213 aa  436  9.999999999999999e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155501  decreased coverage  0.000000000358592 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2335  hypothetical protein  50.96 
 
 
227 aa  214  8e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0478428  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2126  protein of unknown function DUF1121  49.01 
 
 
216 aa  211  4.9999999999999996e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.901834 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1094  hypothetical protein  48.08 
 
 
217 aa  204  7e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1232  hypothetical protein  48.08 
 
 
217 aa  202  4e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0025  protein of unknown function DUF1121  47.6 
 
 
228 aa  199  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0228107 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0236  hypothetical protein  47.39 
 
 
217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000188385  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2929  hypothetical protein  38.94 
 
 
213 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2612  hypothetical protein  38.94 
 
 
213 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1287  protein of unknown function DUF1121  43.54 
 
 
210 aa  159  2e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1542  protein of unknown function DUF1121  36.54 
 
 
213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0096  protein of unknown function DUF1121  39.81 
 
 
205 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13570  Protein of unknown function (DUF1121)  35.27 
 
 
213 aa  142  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3856  protein of unknown function DUF1121  38.76 
 
 
217 aa  142  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00447083 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1837  protein of unknown function DUF1121  38.86 
 
 
219 aa  141  9e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3772  protein of unknown function DUF1121  38.94 
 
 
217 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.602543  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1905  hypothetical protein  36.23 
 
 
213 aa  139  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0446817  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2935  protein of unknown function DUF1121  37.02 
 
 
217 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1893  protein of unknown function DUF1121  36.54 
 
 
213 aa  138  7e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1212  hypothetical protein  32.86 
 
 
213 aa  137  1e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0125  hypothetical protein  39.61 
 
 
217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.776517  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4126  hypothetical protein  37.02 
 
 
217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296501  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1208  hypothetical protein  37.62 
 
 
213 aa  133  3e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0796  hypothetical protein  37.26 
 
 
215 aa  132  5e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.160214  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1422  hypothetical protein  31.92 
 
 
213 aa  132  5e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0835369  normal  0.792436 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0773  hypothetical protein  37.26 
 
 
215 aa  132  6e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00386698  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0486  hypothetical protein  31.46 
 
 
213 aa  131  9e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.239169  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2470  protein of unknown function DUF1121  37.72 
 
 
212 aa  131  9e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2382  protein of unknown function DUF1121  34.11 
 
 
212 aa  131  9e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2921  protein of unknown function DUF1121  38.94 
 
 
216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.257573 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2993  protein of unknown function DUF1121  34.86 
 
 
224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.665625  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0911  hypothetical protein  34.62 
 
 
213 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.849271  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1410  hypothetical protein  32.21 
 
 
213 aa  128  6e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.836587  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3334  hypothetical protein  37.5 
 
 
217 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0598  protein of unknown function DUF1121  39.32 
 
 
214 aa  124  8.000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3273  hypothetical protein  37.56 
 
 
212 aa  121  8e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000862286  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0762  hypothetical protein  33.33 
 
 
217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0215583  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21950  Protein of unknown function (DUF1121)  35.93 
 
 
211 aa  111  9e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1305  protein of unknown function DUF1121  32.08 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0424  hypothetical protein  36.04 
 
 
213 aa  104  8e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1793  protein of unknown function DUF1121  28.16 
 
 
210 aa  99  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1347  hypothetical protein  30.62 
 
 
200 aa  93.6  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0720312  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0753  protein of unknown function DUF1121  31.39 
 
 
198 aa  88.2  8e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3138  protein of unknown function DUF1121  28.43 
 
 
209 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2663  protein of unknown function DUF1121  28.84 
 
 
218 aa  70.5  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2285  hypothetical protein  30.67 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4815  hypothetical protein  23.46 
 
 
209 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.640334  normal  0.0869756 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>