More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3086 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_3086  diguanylate cyclase  100 
 
 		 593 aa  1196    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3979  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.17 
 
 		 567 aa  365  2e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000058301  hitchhiker  0.000000371669 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2083  diguanylate cyclase  37.55 
 
 		 568 aa  320  3e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.17301  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0461  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.32 
 
 		 590 aa  216  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2312  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.5 
 
 		 597 aa  198  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0822  diguanylate cyclase  23.92 
 
 		 554 aa  159  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00155452  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1870  GGDEF domain-containing protein  29.08 
 
 		 342 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0319  diguanylate cyclase  29.76 
 
 		 732 aa  136  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1298  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.84 
 
 		 353 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000090214  hitchhiker  0.00354722 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2258  diguanylate cyclase  27.22 
 
 		 353 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000122425  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2106  diguanylate cyclase  25.36 
 
 		 720 aa  134  6e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1202  diguanylate cyclase  27.65 
 
 		 356 aa  128  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3072  diguanylate cyclase  27.35 
 
 		 356 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000986718 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2721  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.22 
 
 		 686 aa  124  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.53529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1713  diguanylate cyclase  25.58 
 
 		 462 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1450  diguanylate cyclase  32.02 
 
 		 1774 aa  122  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4128  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  30.49 
 
 		 663 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1282  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.84 
 
 		 550 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101268  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2169  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.3 
 
 		 713 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2048  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.08 
 
 		 704 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2287  diguanylate cyclase  28.45 
 
 		 764 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2375  diguanylate cyclase  28.45 
 
 		 764 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2240  diguanylate cyclase  28.12 
 
 		 758 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.365812 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21320  diguanylate cyclase  26.62 
 
 		 510 aa  118  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2704  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.26 
 
 		 494 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0570321  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3523  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  30.4 
 
 		 1079 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1738  diguanylate cyclase  25.06 
 
 		 462 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0895  GAF domain/GGDEF domain-containing protein  26.61 
 
 		 688 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0310961  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14870  diguanylate cyclase  24.85 
 
 		 462 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.024895  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1576  diguanylate cyclase  27.86 
 
 		 764 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2497  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.03 
 
 		 355 aa  114  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000595067  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1191  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.41 
 
 		 841 aa  114  6e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2470  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.85 
 
 		 756 aa  114  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.578353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0019  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.97 
 
 		 668 aa  114  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0021  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.97 
 
 		 668 aa  113  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1511  diguanylate cyclase with GAF sensor  28 
 
 		 557 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00005186  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1162  GGDEF domain protein  29.41 
 
 		 836 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.359678  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0283  hypothetical protein  24.93 
 
 		 709 aa  112  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2842  diguanylate cyclase  25.57 
 
 		 785 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1844  diguanylate cyclase with GAF sensor  26.27 
 
 		 356 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2477  hypothetical protein  30.09 
 
 		 273 aa  111  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3659  diguanylate cyclase with GAF sensor  26.89 
 
 		 362 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3745  diguanylate cyclase  25.63 
 
 		 681 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0125  GGDEF domain-containing protein  28.9 
 
 		 371 aa  110  9.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  22.49 
 
 		 1073 aa  110  9.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1381  GGDEF domain/HD domain-containing protein  29.41 
 
 		 792 aa  109  1e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2890  diguanylate cyclase  30.68 
 
 		 494 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00707629  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2797  diguanylate cyclase  30.68 
 
 		 494 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.129294  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2333  hypothetical protein  24.93 
 
 		 565 aa  109  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2535  diguanylate cyclase  26.12 
 
 		 1099 aa  109  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.12937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2626  diguanylate cyclase  32.34 
 
 		 591 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.138484  normal  0.0100044 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0817  diguanylate cyclase  31.43 
 
 		 1826 aa  108  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1719  diguanylate cyclase with GAF sensor  24.12 
 
 		 563 aa  108  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0299  hypothetical protein  24.35 
 
 		 609 aa  107  8e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0109  diguanylate cyclase  28.87 
 
 		 461 aa  105  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1811  GGDEF/HD domain-containing protein  29.69 
 
 		 563 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.63619  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1530  GGDEF/HD domain-containing protein  29.17 
 
 		 564 aa  105  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.890216  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0798  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.13 
 
 		 622 aa  104  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.131749 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0532  GGDEF domain-containing protein  33.14 
 
 		 321 aa  104  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0716  diguanylate cyclase  30.04 
 
 		 619 aa  104  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0069  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.55 
 
 		 314 aa  103  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.840661 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4523  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.31 
 
 		 499 aa  103  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.967133  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2740  diguanylate cyclase  27.37 
 
 		 555 aa  103  8e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4329  diguanylate cyclase  30.81 
 
 		 320 aa  103  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.406414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1977  membrane associated GGDEF protein  26.92 
 
 		 583 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  27.01 
 
 		 1644 aa  103  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0620  diguanylate cyclase  30.26 
 
 		 517 aa  103  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0089586 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0743  diguanylate cyclase  24.93 
 
 		 680 aa  103  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2723  diguanylate cyclase  29.09 
 
 		 627 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000220491  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4604  diguanylate cyclase  34.32 
 
 		 489 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2731  diguanylate cyclase  33.14 
 
 		 714 aa  103  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0349  diguanylate cyclase  35.71 
 
 		 523 aa  103  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.291431  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0195  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.58 
 
 		 309 aa  102  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0106599  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4051  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.06 
 
 		 360 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.255257  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0142  metal dependent phosphohydrolase  27.93 
 
 		 545 aa  102  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000694732  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0995  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.83 
 
 		 792 aa  102  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.37011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  28.39 
 
 		 1643 aa  101  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3816  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.69 
 
 		 797 aa  101  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.250791  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2227  diguanylate cyclase  36.09 
 
 		 342 aa  101  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4457  GGDEF domain-containing protein  34.07 
 
 		 485 aa  101  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1298  diguanylate cyclase  28.81 
 
 		 576 aa  100  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.135306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2189  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.2 
 
 		 415 aa  100  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0096  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.96 
 
 		 407 aa  100  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.758352  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28880  diguanylate cyclase (GGDEF) domain-containing protein  36.26 
 
 		 409 aa  99.8  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.46801 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3308  diguanylate cyclase  33.15 
 
 		 603 aa  100  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000660005  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1170  hypothetical protein  31.03 
 
 		 768 aa  99.8  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1176  hypothetical protein  31.03 
 
 		 768 aa  99.8  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4411  diguanylate cyclase  34.29 
 
 		 485 aa  99.8  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.244707 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0223  diguanylate cyclase  32.2 
 
 		 357 aa  99.8  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.133267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1471  diguanylate cyclase  27.03 
 
 		 439 aa  99.8  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1339  diguanylate cyclase  28.37 
 
 		 436 aa  100  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0241  diguanylate cyclase  30.98 
 
 		 640 aa  99.8  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1155  diguanylate cyclase  34.6 
 
 		 605 aa  99.8  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.290971  normal  0.125636 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3334  GGDEF family protein  31.55 
 
 		 574 aa  99.4  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1741  diguanylate cyclase  24.51 
 
 		 374 aa  99.4  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.564976  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3430  diguanylate cyclase  29.54 
 
 		 513 aa  99.4  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1476  diguanylate cyclase  30.6 
 
 		 414 aa  99.4  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.64785  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1281  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.82 
 
 		 586 aa  99.4  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3512  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 318 aa  99  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01741  Putative CHASE3/GGDEF domain-containing signal protein  30.9 
 
 		 563 aa  99.4  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>