129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2283 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2283  NifU domain-containing protein  100 
 
 
45 aa  89  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000158739  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2284  NifU domain-containing protein  73.33 
 
 
74 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000278833  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  68.89 
 
 
72 aa  63.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3614  nitrogen-fixing NifU domain protein  68.89 
 
 
73 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187737  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1060  NifU domain-containing protein  68.89 
 
 
43 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000236153  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  68.89 
 
 
73 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  71.11 
 
 
73 aa  60.1  0.000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  66.67 
 
 
74 aa  58.2  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  64.44 
 
 
103 aa  57.8  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  64.44 
 
 
78 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  64.44 
 
 
78 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4659  NifU domain-containing protein  64.44 
 
 
78 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4678  NifU domain-containing protein  64.44 
 
 
78 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  64.44 
 
 
78 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4771  NifU domain-containing protein  64.44 
 
 
78 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5094  nifU domain protein  64.44 
 
 
78 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  64.44 
 
 
78 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0148  nifU domain protein  64.44 
 
 
78 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5056  nifU domain protein  64.44 
 
 
78 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  62.22 
 
 
74 aa  57  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3554  NifU domain-containing protein  62.22 
 
 
78 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0997  nitrogen-fixing NifU domain protein  62.22 
 
 
77 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997138 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3037  nitrogen-fixing NifU domain protein  60 
 
 
78 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2893  nitrogen-fixing NifU domain protein  57.78 
 
 
78 aa  55.1  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  57.78 
 
 
73 aa  55.1  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0260  NifU domain-containing protein  51.11 
 
 
74 aa  55.1  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1421  NifU domain-containing protein  62.22 
 
 
72 aa  54.7  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238769  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  62.22 
 
 
72 aa  54.3  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000210342  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2861  nitrogen-fixing NifU-like protein  55.56 
 
 
80 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0076  nitrogen-fixing NifU domain protein  60 
 
 
73 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1414  nitrogen-fixing NifU domain protein  63.64 
 
 
73 aa  51.6  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68572e-21 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  65.91 
 
 
74 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  61.36 
 
 
79 aa  52  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2796  nitrogen-fixing NifU domain protein  63.64 
 
 
73 aa  51.6  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000131696  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0480  NifU-like domain-containing protein  65.91 
 
 
74 aa  50.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0522  NifU domain-containing protein  56.82 
 
 
80 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0695  NifU domain-containing protein  55.56 
 
 
75 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.219318 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0936  NifU domain-containing protein  54.55 
 
 
80 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00633324  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0955  NifU domain-containing protein  54.55 
 
 
80 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  64.44 
 
 
74 aa  50.4  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000601792  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0464  NifU domain-containing protein  55.56 
 
 
75 aa  50.4  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.046891  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1653  NifU protein, putative  55.56 
 
 
84 aa  50.4  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.421868  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0939  NifU domain-containing protein  63.64 
 
 
73 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.388562  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0398  NifU protein, putative  55.56 
 
 
89 aa  50.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.939749  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0723  NifU domain-containing protein  51.11 
 
 
76 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.603746 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2015  NifU domain-containing protein  55.56 
 
 
86 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213209  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1782  NifU family protein  53.49 
 
 
88 aa  50.1  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0419  nitrogen-fixing NifU domain protein  55.56 
 
 
86 aa  49.7  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0336152  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2018  nitrogen-fixing NifU domain protein  55.56 
 
 
86 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.700022  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1815  nitrogen-fixing NifU domain protein  55.56 
 
 
86 aa  50.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0183632  normal  0.633859 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15130  thioredoxin-like protein  56.82 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.206063 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0962  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.38 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16946  predicted protein  55.81 
 
 
213 aa  48.5  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1492  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.84 
 
 
109 aa  48.9  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0512001  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1043  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.89 
 
 
79 aa  48.1  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  55.81 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00755  NifU protein, putative  53.33 
 
 
80 aa  47.8  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0945933  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  50 
 
 
81 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2358  nitrogen-fixing NifU domain protein  53.33 
 
 
86 aa  47.8  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  51.16 
 
 
81 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  50 
 
 
81 aa  47.4  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02790  NifU C-terminal domain-containing protein, VnfU  56.1 
 
 
96 aa  47.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.197123  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0796  NifU-like protein  53.49 
 
 
81 aa  47  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.077695  normal  0.023151 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0925  hypothetical protein  52.27 
 
 
86 aa  47  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0198354 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1752  NifU-like protein  51.16 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.354649  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1585  NifU-like protein  51.16 
 
 
81 aa  46.2  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.716402  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0414  NifU-like protein  50 
 
 
81 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04691  NifU-like protein  50 
 
 
81 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04711  NifU-like protein  51.16 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.265709  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04381  NifU-like protein  50 
 
 
81 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.725479  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1070  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.67 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4477  HesB/YadR/YfhF  44 
 
 
206 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0747916  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0980  nitrogen-fixing NifU-like protein  58.54 
 
 
333 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04791  NifU-like protein  50 
 
 
81 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1326  NifU domain-containing protein  46.51 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2542  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.89 
 
 
306 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.364829 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0139  NifU domain-containing protein  48.89 
 
 
75 aa  45.4  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.820437  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_9865  predicted protein  54.76 
 
 
73 aa  45.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.07223  normal  0.100166 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0450  putative NifU-like protein  51.16 
 
 
81 aa  44.7  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3441  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  48.84 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1107  nitrogen-fixing NifU domain protein  54.55 
 
 
77 aa  45.1  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162394  hitchhiker  0.0000000000000133842 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  56.1 
 
 
329 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.28 
 
 
344 aa  44.7  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2324  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.45 
 
 
96 aa  44.7  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.575512  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5090  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.66 
 
 
328 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  54.76 
 
 
312 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12230  thioredoxin-like protein  59.09 
 
 
75 aa  43.9  0.0008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000175361  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.51 
 
 
79 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.51 
 
 
79 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  54.76 
 
 
298 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  48.84 
 
 
76 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3815  hypothetical protein  55.81 
 
 
186 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473897  normal  0.0339082 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4882  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.18 
 
 
198 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436115  normal  0.113106 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0299  nitrogen-fixing NifU domain protein  53.66 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120808 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16693  predicted protein  45.24 
 
 
195 aa  43.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0128  NifU domain protein  53.66 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.202734  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00447  NifU-related protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04680)  50 
 
 
326 aa  42.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215741  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4936  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.78 
 
 
85 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.336138  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1084  nitrogen-fixing NifU-like  51.22 
 
 
331 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3360  nitrogen-fixing NifU-like  55 
 
 
173 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.595792  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>