29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1888 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1888  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  287  3e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278536  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3201  hypothetical protein  40 
 
 
149 aa  89.4  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2124  hypothetical protein  40 
 
 
133 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000178855  normal  0.0604216 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0460  hypothetical protein  41.51 
 
 
123 aa  76.6  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.836786  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3564  hypothetical protein  35.96 
 
 
118 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0631  hypothetical protein  32.74 
 
 
129 aa  67.4  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2737  protein of unknown function DUF1333  36.89 
 
 
131 aa  67  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000417049  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15270  hypothetical protein  35.85 
 
 
111 aa  64.3  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.01889e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0552  hypothetical protein  34.19 
 
 
115 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.919661  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3580  hypothetical protein  29.91 
 
 
124 aa  57.8  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000579298  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0778  hypothetical protein  29.27 
 
 
130 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00605117  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1887  hypothetical protein  31 
 
 
139 aa  50.8  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000365501  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0973  hypothetical protein  28.21 
 
 
126 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0767  hypothetical protein  29.46 
 
 
117 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0916  hypothetical protein  30.36 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000848961  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4422  hypothetical protein  30.36 
 
 
118 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000277472  normal  0.337498 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1268  hypothetical protein  24.14 
 
 
123 aa  46.2  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000770353  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0953  hypothetical protein  29.46 
 
 
118 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000903896  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0820  hypothetical protein  29.46 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000558445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0955  hypothetical protein  29.46 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1043  hypothetical protein  29.46 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000407188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0863  hypothetical protein  29.46 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000497885  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0761  hypothetical protein  29.46 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000533819  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0768  hypothetical protein  29.46 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.92086e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0810  protein of unknown function DUF964  29.63 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0358039  normal  0.78691 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0695  hypothetical protein  27.52 
 
 
117 aa  43.5  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.157649  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1698  hypothetical protein  28.23 
 
 
128 aa  40.8  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0206563  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1256  hypothetical protein  24.56 
 
 
117 aa  40.4  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000556613  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0330  protein of unknown function DUF964  23.81 
 
 
115 aa  40.4  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>