22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1177 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1177  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2132  hypothetical protein  56.91 
 
 
181 aa  229  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.713165  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2514  hypothetical protein  59.67 
 
 
184 aa  227  7e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.235466  normal  0.0113167 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1389  Protein of unknown function DUF1867  48.62 
 
 
181 aa  193  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000416753  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1252  hypothetical protein  45.9 
 
 
185 aa  178  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.086966 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0042  hypothetical protein  45.05 
 
 
185 aa  160  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00261676  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0042  hypothetical protein  44.51 
 
 
185 aa  157  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.175316  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0726  hypothetical protein  41.4 
 
 
198 aa  152  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.655013  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0016  hypothetical protein  40.22 
 
 
189 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0712  hypothetical protein  40.74 
 
 
196 aa  145  5e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1750  hypothetical protein  40.21 
 
 
192 aa  143  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0152  hypothetical protein  39.68 
 
 
192 aa  140  9e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.488575  normal  0.0139746 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0927  hypothetical protein  37.7 
 
 
197 aa  139  3e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1576  hypothetical protein  38.17 
 
 
196 aa  123  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0708  hypothetical protein  35.64 
 
 
195 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.117137  normal  0.791979 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1087  hypothetical protein  36.32 
 
 
195 aa  111  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2622  hypothetical protein  32.26 
 
 
196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1128  hypothetical protein  35.68 
 
 
194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0266635  normal  0.906143 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1724  hypothetical protein  34.95 
 
 
196 aa  107  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1542  hypothetical protein  34.83 
 
 
255 aa  101  6e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0888  putative cytoplasmic protein  34.43 
 
 
196 aa  94.7  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125846 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2076  Protein of unknown function DUF1867  37.27 
 
 
196 aa  90.9  8e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.829732 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>