More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0863 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0863  phage integrase domain/SAM domain-containing protein  100 
 
 		 210 aa  437  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3102  integrase family protein  34.91 
 
 		 301 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000184896  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0924  phage integrase family protein  36.14 
 
 		 294 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.852644  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  32.08 
 
 		 283 aa  126  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0775  phage integrase family protein  32.28 
 
 		 286 aa  108  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0341069  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1846  integrase family protein  37.72 
 
 		 370 aa  99.4  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000018136  normal  0.604263 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  30.26 
 
 		 288 aa  97.8  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  30.15 
 
 		 285 aa  89.7  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2439  integrase family protein  27.46 
 
 		 283 aa  84.7  8e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000285613  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  26.76 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3916  integrase family protein  28.22 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0254607  normal  0.244131 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  28.22 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0582  integrase family protein  28.5 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.132855 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0564  tyrosine recombinase XerC subunit  28.1 
 
 		 328 aa  80.1  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  28.06 
 
 		 292 aa  79.7  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3587  integrase family protein  28.7 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  decreased coverage  0.00000000515843  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0902  integrase family protein  30.36 
 
 		 356 aa  79  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  29.65 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1585  site-specific recombinase XerD-like  26.64 
 
 		 332 aa  75.9  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.264485  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1820  phage integrase family protein  25.77 
 
 		 283 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.111306  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0722  phage integrase family protein  24.62 
 
 		 306 aa  75.1  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0599364 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  28.14 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  28.65 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3445  integrase family protein  27.78 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0688  integrase family protein  27.57 
 
 		 336 aa  72  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  23.79 
 
 		 304 aa  72  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  29.23 
 
 		 299 aa  72  0.000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  27.78 
 
 		 291 aa  72  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.11 
 
 		 328 aa  71.6  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.67 
 
 		 330 aa  71.6  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1127  phage integrase  24 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  27.55 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  27.41 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00203  tyrosine recombinase  28.86 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1885  phage integrase-like SAM-like  28.74 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.618174  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1366  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.94 
 
 		 450 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000415693  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  25.39 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  27.01 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  27.5 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  28.86 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0611  integrase family protein  26.97 
 
 		 337 aa  69.3  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  26.74 
 
 		 277 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1179  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.94 
 
 		 450 aa  68.9  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000142279  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0772  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.02 
 
 		 324 aa  68.9  0.00000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0497  tyrosine recombinase XerC  23.74 
 
 		 324 aa  68.2  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2347  phage integrase family protein  24.23 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.01871 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1762  phage/XerD family site-specific recombinase  24.54 
 
 		 338 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0517  integrase family protein  28.25 
 
 		 335 aa  67.4  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  27.32 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  29.41 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2593  integrase family protein  32.32 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5230  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.63 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0753  tyrosine recombinase XerD subunit  25.89 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000038176  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.23 
 
 		 330 aa  65.9  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5139  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.13 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  26.73 
 
 		 294 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  26.24 
 
 		 301 aa  65.5  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5218  integrase family protein  26.78 
 
 		 326 aa  65.5  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2344  phage integrase  26.61 
 
 		 322 aa  65.5  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0456613  normal  0.219342 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  28.79 
 
 		 304 aa  65.5  0.0000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2276  tyrosine recombinase XerD  25.52 
 
 		 301 aa  65.1  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235275  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  25.13 
 
 		 299 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.62 
 
 		 299 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.78 
 
 		 299 aa  65.1  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  30.11 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  27.65 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  25.64 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3569  phage integrase family protein  26.18 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121799  normal  0.0892176 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0684  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.98 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.631001  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0272  phage integrase family site specific recombinase  23.5 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0295  phage integrase family site specific recombinase  23.5 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  24.77 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0905  phage integrase family site specific recombinase  23.5 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0562  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.23 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.73 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4572  integrase family protein  24.29 
 
 		 373 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  24.5 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0037  integrase-recombinase protein  25.13 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.491877  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  23.76 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1455  integrase family protein  24.49 
 
 		 365 aa  63.2  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1624  phage/XerD family site-specific recombinase  26.37 
 
 		 341 aa  62.4  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.389199 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  25.62 
 
 		 308 aa  62.4  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.6 
 
 		 298 aa  62  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1647  integrase domain protein SAM domain protein  27.36 
 
 		 317 aa  62  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  24.1 
 
 		 297 aa  62  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4151  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.74 
 
 		 298 aa  62  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  25 
 
 		 314 aa  62  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  25.51 
 
 		 297 aa  62  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0736  integrase/recombinase  27.45 
 
 		 337 aa  62  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4550  integrase family protein  26.98 
 
 		 362 aa  61.6  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.798479 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1286  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.14 
 
 		 298 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0511461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2982  integrase family protein  26.42 
 
 		 336 aa  61.2  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4385  integrase family protein  26.42 
 
 		 336 aa  61.2  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5291  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.62 
 
 		 299 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1220  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.24 
 
 		 330 aa  61.2  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1217  integrase family protein  26.42 
 
 		 336 aa  61.2  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4359  integrase family protein  26.42 
 
 		 336 aa  61.2  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3835  tyrosine recombinase XerC  24.27 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.955587  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3442  phage integrase  24.38 
 
 		 337 aa  60.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  23.47 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>