12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0374 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0374  phage portal protein, SPP1  100 
 
 		 440 aa  894    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2128  phage portal protein, SPP1  98.64 
 
 		 440 aa  886    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1309  hypothetical protein  60.64 
 
 		 441 aa  565  1e-160  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.370467  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1293  phage portal protein SPP1  47.32 
 
 		 466 aa  405  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3726  hypothetical protein  46.85 
 
 		 468 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2828  portal protein SPP1  43.79 
 
 		 454 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1228  portal protein SPP1  44.73 
 
 		 437 aa  362  7.0000000000000005e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000589045 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2108  hypothetical protein  22.82 
 
 		 502 aa  74.3  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1427  portal protein SPP1  21.76 
 
 		 483 aa  56.6  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0835  phage portal protein, SPP1 family  21.96 
 
 		 489 aa  49.7  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.367487  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_293  phage domain protein  20.64 
 
 		 454 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000155702  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2475  SPP1 family phage portal protein  27.62 
 
 		 477 aa  44.3  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>