More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2504 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2504  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  100 
 
 
285 aa  583  1e-166  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00024143  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1043  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  39.34 
 
 
280 aa  170  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000044291  hitchhiker  0.000000000393673 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1350  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.35 
 
 
284 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0890  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.33 
 
 
273 aa  165  9e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1193  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.89 
 
 
281 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2423  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.66 
 
 
282 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0252  molybdopterin and thiamine biosynthesis protein  37.65 
 
 
272 aa  159  7e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2935  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.55 
 
 
282 aa  156  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2082  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.7 
 
 
288 aa  152  8e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.880254 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1588  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.34 
 
 
259 aa  151  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.475165  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1702  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.23 
 
 
264 aa  143  4e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00338443  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1706  ThiF protein, putative  38.27 
 
 
272 aa  142  9e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0409  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.23 
 
 
294 aa  141  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.667354 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1720  molybdopterin and thiamine biosynthesis family protein  37.39 
 
 
272 aa  137  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000223945  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1383  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.32 
 
 
225 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24690  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  36.73 
 
 
232 aa  128  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1679  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.65 
 
 
226 aa  120  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0277  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.78 
 
 
243 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2316  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.93 
 
 
279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0149122 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2153  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.84 
 
 
267 aa  113  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.779112  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.38 
 
 
443 aa  112  6e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.47369 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0245  thiamine biosynthesis protein (HesA/MoeB/ThiF family protein)  30.45 
 
 
345 aa  110  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0589  hypothetical protein  32.46 
 
 
236 aa  109  5e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0970373  hitchhiker  0.000644128 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2127  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.79 
 
 
258 aa  108  7.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.17 
 
 
244 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0525  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  32.27 
 
 
248 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.449442 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2093  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37 
 
 
275 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.269505 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1231  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.09 
 
 
262 aa  107  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0421  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.32 
 
 
270 aa  105  6e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.130311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1238  4-methyl-5-(beta-hydroxyethyl)thiazole monophosphate synthesis protein ThiF  33.03 
 
 
247 aa  104  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17601  molybdopterin biosynthesis protein  32.06 
 
 
381 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.14 
 
 
237 aa  104  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  31.36 
 
 
380 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2835  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.59 
 
 
278 aa  102  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1953  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.32 
 
 
336 aa  102  9e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0383  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.59 
 
 
223 aa  102  9e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.351767  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3812  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.94 
 
 
278 aa  101  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1439  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.84 
 
 
239 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0188  hypothetical protein  36.36 
 
 
252 aa  99.8  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430925  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17561  molybdopterin biosynthesis protein  29.91 
 
 
382 aa  99.8  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0006  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  31.36 
 
 
260 aa  99.8  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.762533  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17761  molybdopterin biosynthesis protein  31.58 
 
 
381 aa  99.4  7e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.624505  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1620  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.32 
 
 
266 aa  98.6  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.407651 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1314  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.38 
 
 
231 aa  97.8  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.530207  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.13 
 
 
347 aa  97.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.816158  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1270  thiamine biosynthesis protein ThiF  31.86 
 
 
248 aa  96.7  4e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1727  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.55 
 
 
266 aa  96.7  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0112  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.9 
 
 
216 aa  96.3  5e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.157166  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1073  ThiF/MoeZ/MoeB domain/rhodanese-like domain-containing protein  28.9 
 
 
368 aa  95.9  7e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0004  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  30.64 
 
 
260 aa  95.9  7e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00436321  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0941  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  28.9 
 
 
368 aa  95.9  7e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.217219  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2183  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  31.86 
 
 
245 aa  95.5  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08540  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  40.4 
 
 
403 aa  95.5  9e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.151924  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0446  thiF protein  33.63 
 
 
235 aa  94.7  1e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0750126 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1985  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.31 
 
 
367 aa  95.5  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0085  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  38.16 
 
 
251 aa  95.5  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1847  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.77 
 
 
241 aa  94.4  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0823  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.26 
 
 
226 aa  94  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272432  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.07 
 
 
379 aa  94  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  30.45 
 
 
388 aa  94.7  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2002  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.67 
 
 
268 aa  94  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0004  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  30.21 
 
 
260 aa  94  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1867  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.32 
 
 
237 aa  94  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00010149  normal  0.587494 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1394  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.4 
 
 
278 aa  94  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0178  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.52 
 
 
243 aa  93.6  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1880  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 
282 aa  93.6  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1980  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.05 
 
 
270 aa  93.6  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.019523  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1970  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  30.88 
 
 
269 aa  93.2  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014844  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1822  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30 
 
 
256 aa  93.2  4e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0657406  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1858  thiF protein, putative  32.69 
 
 
250 aa  92.8  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1008  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.36 
 
 
244 aa  93.2  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0106797  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1940  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.99 
 
 
356 aa  92.4  7e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.124053  normal  0.423901 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07990  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  30.52 
 
 
398 aa  92.4  8e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000402237  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2240  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.05 
 
 
270 aa  92.4  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.590447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8385  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  31.36 
 
 
393 aa  92  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250903  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0522  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.98 
 
 
259 aa  92  9e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3268  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.33 
 
 
280 aa  92  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1661  rhodanese-like protein  29.47 
 
 
380 aa  91.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1499  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.11 
 
 
250 aa  91.7  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039426  normal  0.0112948 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2459  thiF protein, putative  36.16 
 
 
284 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.6505  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4639  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.4 
 
 
355 aa  90.9  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.04 
 
 
403 aa  90.9  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0279  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.95 
 
 
273 aa  90.1  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266697  normal  0.0271151 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1567  thiamine biosynthesis protein ThiF  29.73 
 
 
247 aa  90.5  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0683473 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0214  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.48 
 
 
361 aa  90.1  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  30.45 
 
 
480 aa  90.1  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2230  hypothetical protein  30.68 
 
 
679 aa  89.7  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000280585  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0357  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.23 
 
 
239 aa  89.7  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.120454  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1940  rhodanese-like protein  28.83 
 
 
388 aa  89.4  6e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.865805  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20151  molybdopterin biosynthesis protein  32.21 
 
 
381 aa  89  8e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.28602  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3716  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.72 
 
 
354 aa  89  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01140  URM1 activating enzyme, putative  34.67 
 
 
415 aa  88.6  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.45 
 
 
393 aa  88.2  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0544  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.81 
 
 
246 aa  88.6  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000353659  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0383  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  30 
 
 
393 aa  88.6  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3860  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.87 
 
 
251 aa  88.2  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.810636 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1141  rhodanese-like  31.73 
 
 
381 aa  87.8  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2855  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  31.48 
 
 
248 aa  87.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000693391  hitchhiker  0.000000536113 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4592  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.45 
 
 
392 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.418799  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2139  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.76 
 
 
386 aa  87  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000312689  normal  0.0185629 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>