87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2282 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2282  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  100 
 
 
376 aa  748    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1434  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  59.63 
 
 
378 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0886  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  58.82 
 
 
378 aa  428  1e-118  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0996  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  56.66 
 
 
388 aa  421  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0944  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  57.49 
 
 
374 aa  419  1e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1608  methylmalonyl-CoA decarboxylase, beta subunit  58.42 
 
 
383 aa  406  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0917  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  53.76 
 
 
519 aa  376  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.507038 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0809  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  50.26 
 
 
516 aa  373  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.61044  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1492  glutaconyl-CoA decarboxylase beta subunit  52.72 
 
 
370 aa  372  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0159163 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1266  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  49.48 
 
 
516 aa  369  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3011  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  51.94 
 
 
376 aa  368  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1201  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  50.78 
 
 
516 aa  368  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.644428 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0047  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  51.63 
 
 
374 aa  363  2e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1850  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  48.92 
 
 
371 aa  364  2e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0047  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  51.9 
 
 
374 aa  363  4e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02840  oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  51.11 
 
 
376 aa  362  7.0000000000000005e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3375  oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  51.4 
 
 
376 aa  358  7e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1310  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  49.07 
 
 
383 aa  358  7e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1898  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  50.66 
 
 
378 aa  358  8e-98  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1666  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  50.67 
 
 
378 aa  358  9.999999999999999e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2892  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  50 
 
 
378 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0351319  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0086  oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  48.16 
 
 
376 aa  356  3.9999999999999996e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.923092  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1050  oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  50.55 
 
 
377 aa  355  5.999999999999999e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002526  oxaloacetate decarboxylase beta chain  48.67 
 
 
376 aa  353  2e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0640  oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  50.28 
 
 
376 aa  353  2e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0064  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  50.94 
 
 
458 aa  351  1e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000825924  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03490  oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  47.87 
 
 
376 aa  351  2e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2479  oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  53.8 
 
 
375 aa  346  3e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.231927  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1200  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  50.54 
 
 
376 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1067  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  50.8 
 
 
376 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3067  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  50.79 
 
 
376 aa  338  7e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.738311 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1031  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  51.6 
 
 
376 aa  338  8e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.634771  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2985  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  50.79 
 
 
376 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.733812 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1127  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  51.34 
 
 
376 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0605  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  50.69 
 
 
436 aa  336  2.9999999999999997e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3164  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  50.53 
 
 
376 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1026  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  51.34 
 
 
376 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3314  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  46.81 
 
 
416 aa  336  3.9999999999999995e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3265  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  51.34 
 
 
376 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1093  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  51.07 
 
 
376 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3622  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  48.46 
 
 
390 aa  333  2e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000349445  hitchhiker  0.000000446411 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1221  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  50.28 
 
 
377 aa  333  2e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.949455  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1053  oxaloacetate decarboxylase  48.93 
 
 
376 aa  334  2e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0294  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  50.99 
 
 
374 aa  333  4e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1741  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  48.66 
 
 
376 aa  332  5e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.353254 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3335  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  50.56 
 
 
376 aa  332  5e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000107525 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1322  glutaconyl-CoA decarboxylase  50.56 
 
 
376 aa  332  6e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0119077 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1258  pyruvate carboxylase/oxaloacetate decarboxylase biotin carboxyl carrier subunit alpha  49.59 
 
 
443 aa  329  4e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.913134  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3197  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  47.06 
 
 
379 aa  328  1.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107579  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3585  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  47.11 
 
 
379 aa  326  3e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.330233  normal  0.310791 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0509  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  46.78 
 
 
359 aa  323  4e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1366  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  48.49 
 
 
371 aa  322  8e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0970763  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1275  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  45.86 
 
 
376 aa  321  1.9999999999999998e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3692  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  44.54 
 
 
376 aa  312  6.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0136998 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2434  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  47.61 
 
 
360 aa  312  7.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.13524  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0204  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  51.33 
 
 
554 aa  311  1e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.928975 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0319  oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  43.59 
 
 
433 aa  309  4e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1307  oxaloacetate decarboxylase  45.87 
 
 
420 aa  309  5.9999999999999995e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0998305  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0953  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  44.26 
 
 
376 aa  305  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.126318 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0382  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  45.32 
 
 
385 aa  301  9e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.159911  normal  0.654104 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0241  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  44.86 
 
 
382 aa  298  1e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.140679  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1925  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  44.26 
 
 
380 aa  296  5e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1820  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  44.8 
 
 
376 aa  295  6e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3673  glutaconyl-CoA decarboxylase  46.59 
 
 
376 aa  295  8e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.523011  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3614  oxaloacetate decarboxylase beta chain  47.1 
 
 
433 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0694  oxaloacetate decarboxylase  51.56 
 
 
440 aa  294  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00230113  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0203  oxaloacetate decarboxylase beta subunit  46.21 
 
 
421 aa  293  3e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0895  oxaloacetate decarboxylase subunit beta  46.85 
 
 
433 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3542  oxaloacetate decarboxylase beta chain  46.1 
 
 
433 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.069232  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0832  oxaloacetate decarboxylase beta chain  46.1 
 
 
433 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0804  oxaloacetate decarboxylase beta chain  46.35 
 
 
433 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3649  oxaloacetate decarboxylase subunit beta  46.1 
 
 
433 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44208  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0061  oxaloacetate decarboxylase beta chain  46.35 
 
 
433 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0059  oxaloacetate decarboxylase beta chain  46.1 
 
 
433 aa  289  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.566525 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0972  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  52.05 
 
 
444 aa  288  9e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.377854  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0060  oxaloacetate decarboxylase beta chain  46.1 
 
 
433 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0059  oxaloacetate decarboxylase beta chain  46.6 
 
 
433 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.242955  normal  0.132607 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0058  oxaloacetate decarboxylase subunit beta  46.35 
 
 
433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0452958  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3711  oxaloacetate decarboxylase beta chain  46.35 
 
 
433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3543  oxaloacetate decarboxylase beta chain  46.1 
 
 
433 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0863  oxaloacetate decarboxylase beta chain  46.1 
 
 
433 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1756  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  35.97 
 
 
375 aa  228  1e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1055  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  32.08 
 
 
404 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3300  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  31.51 
 
 
404 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1320  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  29.7 
 
 
403 aa  144  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3311  sodium ion-translocating decarboxylase, beta subunit  32.65 
 
 
419 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.524718  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2305  pyruvate carboxyltransferase  57.53 
 
 
216 aa  82.4  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.160585  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>