More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2160 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2160  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 
417 aa  847    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000311819  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3852  acetyl-CoA acetyltransferase  47.96 
 
 
391 aa  375  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.647198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3780  acetyl-CoA acetyltransferase  47.96 
 
 
391 aa  377  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.514238  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1109  acetyl-CoA acetyltransferase  47.96 
 
 
391 aa  376  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228356  normal  0.198631 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2722  acetyl-CoA acetyltransferase  47.72 
 
 
391 aa  376  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121124  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4150  acetyl-CoA acetyltransferase  47.72 
 
 
391 aa  375  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0127373  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4076  acetyl-CoA acetyltransferase  47.72 
 
 
391 aa  375  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0498749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3932  acetyl-CoA acetyltransferase  47.72 
 
 
391 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.650395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3765  acetyl-CoA acetyltransferase  47.72 
 
 
391 aa  375  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4240  acetyl-CoA acetyltransferase  47.72 
 
 
391 aa  375  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.749727  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4129  acetyl-CoA acetyltransferase  47.72 
 
 
391 aa  373  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00256645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4043  acetyl-CoA acetyltransferase  47.72 
 
 
391 aa  375  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  47.6 
 
 
393 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.689247  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1351  acetyl-CoA acetyltransferase  45.78 
 
 
393 aa  350  4e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.428024  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1908  acetyl-CoA acetyltransferase  45.78 
 
 
392 aa  347  2e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0609  acetyl-CoA acetyltransferase  46.63 
 
 
392 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  46.38 
 
 
394 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1934  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  44.52 
 
 
396 aa  336  3.9999999999999995e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.519061  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2051  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  44.52 
 
 
396 aa  334  2e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  45.54 
 
 
392 aa  332  6e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  45.54 
 
 
392 aa  332  9e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0225  acetyl-CoA acetyltransferase  43.61 
 
 
395 aa  330  2e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.204015  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1165  acetyl-CoA acetyltransferase  45.32 
 
 
393 aa  325  8.000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000755496  normal  0.122862 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1875  acetyl-CoA acetyltransferase  43.65 
 
 
391 aa  325  1e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1378  acetyl-CoA acetyltransferase  44.02 
 
 
392 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.778276  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0427  acetyl-CoA acetyltransferase  43.1 
 
 
391 aa  321  1.9999999999999998e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1632  acetyl-CoA acetyltransferase  43.86 
 
 
393 aa  318  7.999999999999999e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871042  normal  0.67085 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  42.89 
 
 
393 aa  317  4e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2857  acetyl-CoA acetyltransferase  45.67 
 
 
392 aa  315  7e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1434  acetyl-CoA acetyltransferase  43.2 
 
 
398 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.732779  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2058  thiolase  42.82 
 
 
399 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.35513  normal  0.039203 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  42.65 
 
 
393 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  42.65 
 
 
393 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  42.65 
 
 
393 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3597  acetyl-CoA acetyltransferase  43.57 
 
 
393 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.840519 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  42.89 
 
 
393 aa  311  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  42.89 
 
 
393 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  43.81 
 
 
393 aa  311  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.495494 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  43.8 
 
 
393 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1357  acetyl-CoA acetyltransferase  44.82 
 
 
393 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  43.13 
 
 
393 aa  311  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5091  acetyl-CoA acetyltransferase  43.37 
 
 
393 aa  310  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1260  acetyl-CoA acetyltransferase  43.61 
 
 
393 aa  311  2e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000197316 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1491  acetyl-CoA acetyltransferase  43.37 
 
 
393 aa  310  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1246  acetyl-CoA acetyltransferase  43.37 
 
 
390 aa  310  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  43.37 
 
 
393 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  43.55 
 
 
393 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2820  acetyl-CoA acetyltransferase  42.48 
 
 
398 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1814  acetyl-CoA acetyltransferase  43.37 
 
 
393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.390128 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6102  acetyl-CoA acetyltransferase  43.37 
 
 
393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0543  acetyl-CoA acetyltransferase  43.13 
 
 
393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2158  acetyl-CoA acetyltransferase  43.37 
 
 
393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6289  acetyl-CoA acetyltransferase  43.37 
 
 
393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1790  acetyl-CoA acetyltransferase  43.37 
 
 
393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2772  acetyl-CoA acetyltransferase  43.37 
 
 
393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0086  acetyl-CoA acetyltransferase  42.41 
 
 
393 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1321  acetyl-CoA acetyltransferase  42.41 
 
 
393 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3667  acetyl-CoA acetyltransferase  42.27 
 
 
394 aa  310  4e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.208035  normal  0.356669 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1810  acetyl-CoA acetyltransferase  42.41 
 
 
393 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0254268  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1081  acetyl-CoA acetyltransferase  42.41 
 
 
393 aa  310  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.201222  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  44.34 
 
 
392 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2498  acetyl-CoA acetyltransferase  44.58 
 
 
389 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2058  acetyl-CoA acetyltransferase  43.54 
 
 
395 aa  309  6.999999999999999e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1844  acetyl-CoA acetyltransferase  42.89 
 
 
393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980991  normal  0.0817271 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1910  beta-ketothiolase  40.91 
 
 
394 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.614831  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1581  beta-ketothiolase  40.91 
 
 
394 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.328438  normal  0.0356466 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  42.65 
 
 
392 aa  308  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1707  acetyl-CoA acetyltransferase  42.51 
 
 
394 aa  307  3e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0221511  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2284  acetyl-CoA acetyltransferase  41.59 
 
 
392 aa  306  3e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3777  acetyl-CoA acetyltransferase  42.03 
 
 
394 aa  307  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3469  acetyl-CoA acetyltransferase  42.03 
 
 
394 aa  307  3e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.753408 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3162  acetyl-CoA acetyltransferase  43.13 
 
 
392 aa  306  4.0000000000000004e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1348  acetyl-CoA acetyltransferase  44.58 
 
 
393 aa  306  6e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1362  beta-ketothiolase  42.07 
 
 
394 aa  306  6e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5280  acetyl-CoA acetyltransferase  42.51 
 
 
398 aa  305  7e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.131402 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0142  acetyl-CoA acetyltransferase  41.9 
 
 
402 aa  306  7e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.771451  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1772  acetyl-CoA acetyltransferase  42.27 
 
 
394 aa  305  8.000000000000001e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.499723  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3820  acetyl-CoA acetyltransferase  43.13 
 
 
392 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0816  acetyl-CoA acetyltransferase  42.79 
 
 
398 aa  304  2.0000000000000002e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3319  acetyl-CoA acetyltransferase  43.06 
 
 
393 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.370073  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0192  acetyl-CoA acetyltransferase  41.19 
 
 
402 aa  303  3.0000000000000004e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5118  acetyl-CoA acetyltransferase  42.27 
 
 
394 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.583102 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1728  acetyl-CoA acetyltransferase  43.13 
 
 
393 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2691  acetyl-CoA acetyltransferase  43.13 
 
 
393 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0402057  normal  0.140925 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1353  beta-ketothiolase  41.39 
 
 
394 aa  302  7.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0124  acetyl-CoA acetyltransferase  41.67 
 
 
402 aa  302  8.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.226626  normal  0.905367 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4515  acetyl-CoA acetyltransferase  42.21 
 
 
391 aa  301  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.657914 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  42.89 
 
 
393 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6898  acetyl-CoA acetyltransferase  43.1 
 
 
398 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2266  acetyl-CoA acetyltransferase  42.82 
 
 
390 aa  301  1e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00024775 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1778  acetyl-CoA acetyltransferase  43.88 
 
 
405 aa  301  2e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3068  acetyl-CoA acetyltransferase  44.58 
 
 
393 aa  301  2e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.362583  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3108  acetyl-CoA acetyltransferase  42.96 
 
 
392 aa  300  4e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3041  acetyl-CoA acetyltransferase  41.15 
 
 
392 aa  300  4e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3545  acetyl-CoA acetyltransferase  43.33 
 
 
393 aa  299  5e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2824  acetyl-CoA acetyltransferase  42.89 
 
 
393 aa  299  6e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0314  acetyl-CoA acetyltransferase  42.49 
 
 
400 aa  299  7e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0364767  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0789  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  44.55 
 
 
403 aa  299  7e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0824  acetyl-CoA acetyltransferase  42.65 
 
 
392 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.122225  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1130  acetyl-CoA acetyltransferase  41.3 
 
 
394 aa  298  1e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>