36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2136 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2136  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
157 aa  329  8e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000941211  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2908  hypothetical protein  62.16 
 
 
158 aa  207  6e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2080  protein of unknown function DUF849  44.3 
 
 
453 aa  140  9e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.550211 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0948  hypothetical protein  41.45 
 
 
156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0981  hypothetical protein  26.85 
 
 
449 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0265293  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6953  GCN5-related N-acetyltransferase  31.91 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.389804  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1662  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase, putative  25.85 
 
 
145 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2923  GCN5-related N-acetyltransferase  27.94 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.342216  hitchhiker  0.0000380368 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0615  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.65 
 
 
165 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.286495  normal  0.417084 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0263  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
173 aa  46.2  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.11668 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1662  polyprenyl synthetase  28.38 
 
 
165 aa  45.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00255661  unclonable  0.000000000000112216 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2124  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  22.52 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2087  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  22.52 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.279688  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1177  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.52 
 
 
158 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0246629 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1167  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.52 
 
 
158 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.508689 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1150  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.52 
 
 
158 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.372343  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1201  GCN5-related N-acetyltransferase  26.49 
 
 
142 aa  43.9  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00821471  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4039  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
169 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.880939  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0861  acetyltransferase  30.97 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00507665  normal  0.131026 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0861  GCN5-related N-acetyltransferase  37.84 
 
 
173 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0963  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.31 
 
 
157 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1292  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.47 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.240965  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2252  acetyltransferase  30.93 
 
 
189 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000131288  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0154  N-acetylglutamate synthase  38.27 
 
 
442 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2196  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
172 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0008  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  27.21 
 
 
160 aa  41.6  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0058  GCN5-related N-acetyltransferase  29.85 
 
 
330 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0184  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.78 
 
 
146 aa  41.6  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.648354  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1763  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.25 
 
 
138 aa  41.2  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13454  ribosomal protein alanine acetyltransferase rimI  29.2 
 
 
158 aa  40.8  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00191083  hitchhiker  0.000645998 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2063  GCN5-related N-acetyltransferase  28.93 
 
 
168 aa  40.8  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1450  GCN5-related N-acetyltransferase  27.74 
 
 
150 aa  40.4  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0245  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  23.36 
 
 
159 aa  40.4  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0070  hypothetical protein  28.18 
 
 
494 aa  40.4  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1640  GCN5-related N-acetyltransferase  29.6 
 
 
176 aa  40.4  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07320  acetyltransferase  31.76 
 
 
190 aa  40.4  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>