More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0620 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0620  preprotein translocase subunit SecA  100 
 
 		 668 aa  1350    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1343  preprotein translocase subunit SecA  53.97 
 
 		 663 aa  628  1e-179  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0924  preprotein translocase subunit SecA  47.1 
 
 		 666 aa  558  1e-157  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.127356  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2398  preprotein translocase subunit SecA  50.49 
 
 		 678 aa  542  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.460315 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2357  preprotein translocase subunit SecA  51.03 
 
 		 685 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.543431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  44.64 
 
 		 864 aa  481  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  46.69 
 
 		 838 aa  478  1e-133  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2429  preprotein translocase subunit SecA  42.93 
 
 		 840 aa  476  1e-133  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2139  preprotein translocase subunit SecA  43.08 
 
 		 845 aa  477  1e-133  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2175  preprotein translocase subunit SecA  47.98 
 
 		 658 aa  474  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.407443  normal  0.276741 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  44.71 
 
 		 859 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  42.45 
 
 		 830 aa  469  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1410  preprotein translocase, SecA subunit  44.16 
 
 		 787 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.269916  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2553  preprotein translocase, SecA subunit  45.37 
 
 		 796 aa  468  9.999999999999999e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2218  protein translocase subunit secA  40.87 
 
 		 886 aa  465  9.999999999999999e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000196185  hitchhiker  0.00000000170911 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0365  protein translocase subunit secA  42.81 
 
 		 787 aa  468  9.999999999999999e-131  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  43.63 
 
 		 909 aa  463  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0755  preprotein translocase subunit SecA  42.15 
 
 		 896 aa  462  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000161471  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  44.97 
 
 		 834 aa  465  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  41.56 
 
 		 903 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  44.48 
 
 		 858 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0256  preprotein translocase, SecA subunit  43.12 
 
 		 858 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000954938  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16440  preprotein translocase, SecA subunit  44.87 
 
 		 845 aa  461  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000273245  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  41.75 
 
 		 917 aa  456  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  42.49 
 
 		 837 aa  459  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2156  preprotein translocase subunit SecA  45.88 
 
 		 833 aa  457  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3014  preprotein translocase subunit SecA  43.73 
 
 		 910 aa  456  1e-127  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1202  preprotein translocase, SecA subunit  44.56 
 
 		 840 aa  456  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.592039  normal  0.254631 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  45.42 
 
 		 844 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  45.13 
 
 		 836 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0951  preprotein translocase subunit SecA  41.97 
 
 		 899 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000263053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1149  preprotein translocase subunit SecA  39.3 
 
 		 862 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.498004  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  41.47 
 
 		 912 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  42.42 
 
 		 894 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  40.96 
 
 		 872 aa  450  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  43.62 
 
 		 842 aa  449  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3540  preprotein translocase subunit SecA  42.47 
 
 		 931 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2540  preprotein translocase subunit SecA  42.47 
 
 		 931 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  40.8 
 
 		 904 aa  450  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0921  preprotein translocase subunit SecA  38.84 
 
 		 862 aa  450  1e-125  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.895177  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3535  preprotein translocase subunit SecA  42.47 
 
 		 931 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.90437  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1320  preprotein translocase subunit SecA  42.47 
 
 		 931 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  40.93 
 
 		 908 aa  452  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  41.69 
 
 		 837 aa  451  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3515  preprotein translocase subunit SecA  42.47 
 
 		 931 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275917  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0401  preprotein translocase, SecA subunit  41.62 
 
 		 914 aa  451  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0753123 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3242  preprotein translocase subunit SecA  42.47 
 
 		 931 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.358257  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0225  preprotein translocase, SecA subunit  41.62 
 
 		 914 aa  451  1e-125  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0462  preprotein translocase subunit SecA  42.47 
 
 		 931 aa  451  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125035  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2050  preprotein translocase subunit SecA  41.27 
 
 		 897 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0121176  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2490  preprotein translocase subunit SecA  41.06 
 
 		 899 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0779  preprotein translocase, SecA subunit  42.47 
 
 		 925 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.54499  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0131  protein translocase subunit secA  41.7 
 
 		 923 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.449185 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  39.29 
 
 		 910 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0235  preprotein translocase subunit SecA  41.45 
 
 		 896 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.373654  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  40.79 
 
 		 896 aa  448  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1127  preprotein translocase subunit SecA  42.32 
 
 		 930 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201414  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3078  preprotein translocase subunit SecA  41.13 
 
 		 873 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000716555  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  42.25 
 
 		 848 aa  449  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3118  preprotein translocase subunit SecA  41.69 
 
 		 930 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.224374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3726  preprotein translocase subunit SecA  41.03 
 
 		 836 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1331  preprotein translocase subunit SecA  41.88 
 
 		 799 aa  447  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.313572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  40.95 
 
 		 921 aa  442  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0361  preprotein translocase subunit SecA  41.33 
 
 		 910 aa  443  1e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.746169  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0497  preprotein translocase subunit SecA  41.46 
 
 		 931 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433884  normal  0.665829 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1385  preprotein translocase subunit SecA  40.76 
 
 		 910 aa  442  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03250  preprotein translocase subunit SecA  40.24 
 
 		 902 aa  443  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0232  preprotein translocase, SecA subunit  40.28 
 
 		 804 aa  443  1e-123  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3511  preprotein translocase subunit SecA  40.12 
 
 		 909 aa  442  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00666871  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0239  preprotein translocase subunit SecA  39.77 
 
 		 913 aa  443  1e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.684893  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  40.76 
 
 		 909 aa  444  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0472  preprotein translocase subunit SecA  41.46 
 
 		 931 aa  445  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.611662  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2080  preprotein translocase subunit SecA  41.63 
 
 		 903 aa  442  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.240841  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0569  preprotein translocase subunit SecA  41.16 
 
 		 932 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1958  preprotein translocase subunit SecA  39.71 
 
 		 916 aa  444  1e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0539  preprotein translocase subunit SecA  41.16 
 
 		 932 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117164  normal  0.600522 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2664  preprotein translocase subunit SecA  42.26 
 
 		 936 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5295  preprotein translocase subunit SecA  40.39 
 
 		 835 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0938  preprotein translocase subunit SecA  42.17 
 
 		 884 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1020  preprotein translocase subunit SecA  40.29 
 
 		 862 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1945  preprotein translocase subunit SecA  43.26 
 
 		 906 aa  439  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.267461  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5038  preprotein translocase subunit SecA  40.23 
 
 		 835 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4868  preprotein translocase subunit SecA  40.23 
 
 		 835 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4883  preprotein translocase subunit SecA  40.23 
 
 		 835 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.638638  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2970  preprotein translocase subunit SecA  41.39 
 
 		 924 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0966  preprotein translocase subunit SecA  40.13 
 
 		 862 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00335629  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3654  preprotein translocase subunit SecA  41.01 
 
 		 932 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321986  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1563  preprotein translocase subunit SecA  44.02 
 
 		 662 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5277  preprotein translocase subunit SecA  40.23 
 
 		 835 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000840877 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5421  preprotein translocase subunit SecA  40.23 
 
 		 835 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4982  preprotein translocase subunit SecA  40.06 
 
 		 835 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2518  preprotein translocase subunit SecA  41.63 
 
 		 903 aa  440  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  40.7 
 
 		 907 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0495  preprotein translocase subunit SecA  42.37 
 
 		 936 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132079  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0087  preprotein translocase subunit SecA  41.16 
 
 		 932 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  42.93 
 
 		 962 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5352  preprotein translocase subunit SecA  40.39 
 
 		 835 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  41.57 
 
 		 866 aa  440  9.999999999999999e-123  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  42.93 
 
 		 962 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0421  preprotein translocase subunit SecA  41.42 
 
 		 908 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00112281  unclonable  0.00000862629 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>