15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0366 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0366  S23 ribosomal protein  100 
 
 
143 aa  290  4e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00787101  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0795  S23 ribosomal protein  49.09 
 
 
134 aa  88.6  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.361615  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1133  S23 ribosomal protein  35.06 
 
 
125 aa  49.3  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.625795 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0352  hypothetical protein  40.79 
 
 
133 aa  46.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.50367  normal  0.137183 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1908  S23 ribosomal protein  53.85 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0472505 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1864  S23 ribosomal protein  40 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.508556  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0797  hypothetical protein  35.62 
 
 
115 aa  44.7  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171877 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2670  hypothetical protein  31.75 
 
 
131 aa  44.7  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0042  hypothetical protein  52.17 
 
 
122 aa  44.3  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.97869  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0903  hypothetical protein  52.17 
 
 
122 aa  44.3  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000118462  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1773  hypothetical protein  52.17 
 
 
122 aa  44.3  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0046265  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1809  hypothetical protein  52.17 
 
 
122 aa  44.3  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.324507  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2787  hypothetical protein  30.12 
 
 
118 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.000000122053  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2144  hypothetical protein  33.33 
 
 
121 aa  41.6  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0702  hypothetical protein  31.52 
 
 
130 aa  40.8  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000425706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>