More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_963 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_963  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  100 
 
 		 290 aa  595  1e-169  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0350052  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1179  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  96.21 
 
 		 741 aa  579  1e-164  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.208335  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0984  ABC transporter related  91.03 
 
 		 741 aa  549  1e-155  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0506  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  66.78 
 
 		 765 aa  402  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0494  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  67.47 
 
 		 765 aa  403  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2432  ABC transporter related  63.79 
 
 		 748 aa  392  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143972  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0631  ABC transporter related  60.55 
 
 		 741 aa  385  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00287092  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1191  ABC transporter related  61.94 
 
 		 755 aa  380  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2014  ABC transporter related  59.52 
 
 		 577 aa  367  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000880254  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0202  ABC transporter related  57.59 
 
 		 742 aa  359  3e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000528171  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0855  ABC transporter related  57.77 
 
 		 755 aa  353  2e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000335378  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1681  ABC transporter related  55.48 
 
 		 585 aa  344  1e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.843196  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0363  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  56.4 
 
 		 577 aa  342  2.9999999999999997e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.456127  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2734  ABC transporter related  56.75 
 
 		 575 aa  342  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0162284  normal  0.11621 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0366  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  56.06 
 
 		 577 aa  342  5.999999999999999e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0837  ABC transporter related  56.21 
 
 		 575 aa  338  5e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2359  ABC transporter related  57 
 
 		 586 aa  338  8e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000215003  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0099  ABC transporter related  56.6 
 
 		 575 aa  334  1e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1266  ABC transporter related  53.74 
 
 		 720 aa  332  3e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000152073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1343  ABC transporter related  57.71 
 
 		 577 aa  330  2e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21680  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  51.22 
 
 		 579 aa  322  5e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0149  ABC transporter related  53.36 
 
 		 584 aa  316  4e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29338  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1524  multidrug ABC transporter ATPase/permease  47.42 
 
 		 623 aa  314  9e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.833166  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0378  ABC transporter related  51.92 
 
 		 577 aa  313  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1338  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  54.2 
 
 		 579 aa  312  3.9999999999999997e-84  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0578  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  52.45 
 
 		 578 aa  311  6.999999999999999e-84  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3639  ABC transporter related  51.55 
 
 		 582 aa  307  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3128  ABC transporter related protein  49.83 
 
 		 576 aa  306  2.0000000000000002e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000595027  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2050  ABC transporter related protein  49.11 
 
 		 581 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.382467  normal  0.714233 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2312  ABC transporter transmembrane region  52.88 
 
 		 577 aa  304  1.0000000000000001e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0984577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3356  ABC transporter related  50.17 
 
 		 577 aa  303  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0971  ABC transporter related  47.75 
 
 		 577 aa  299  3e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.474508 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8741  carbohydrate ABC transporter  47.89 
 
 		 577 aa  295  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0736  ABC transporter related  47.04 
 
 		 578 aa  295  6e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0857  ABC transporter related  47.4 
 
 		 577 aa  295  8e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.641031  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4564  ABC transporter related protein  50.17 
 
 		 577 aa  293  2e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12840  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  50.53 
 
 		 719 aa  293  3e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3756  ABC transporter related  46.85 
 
 		 581 aa  292  4e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0241948  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  47.74 
 
 		 587 aa  292  5e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  47.97 
 
 		 578 aa  291  9e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0418  ABC transporter related  52.14 
 
 		 583 aa  290  2e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0134  ABC transporter related  47.4 
 
 		 574 aa  288  6e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0470  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  51.06 
 
 		 604 aa  288  1e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.730861  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6413  ABC transporter related  49.13 
 
 		 577 aa  287  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.637608  normal  0.411769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5936  ABC transporter related  49.11 
 
 		 577 aa  285  5.999999999999999e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960188  normal  0.0915983 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3252  ABC transporter related  45.64 
 
 		 577 aa  283  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0807  ABC transporter related  48.25 
 
 		 577 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0583  ABC transporter related  49.31 
 
 		 583 aa  280  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1711  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  51.11 
 
 		 654 aa  275  4e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1070  ABC transporter related protein  46.32 
 
 		 582 aa  275  5e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2251  ABC transporter related  47.72 
 
 		 586 aa  275  6e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2076  ABC transporter related  47.59 
 
 		 578 aa  273  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204886  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11299  drug ABC transporter ATP-binding protein  47.2 
 
 		 582 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1431  ABC transporter related protein  47.41 
 
 		 583 aa  271  8.000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2474  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  46.26 
 
 		 584 aa  271  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.258083  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3821  ABC transporter related  44.95 
 
 		 584 aa  270  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129974  normal  0.0141768 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2400  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  47.33 
 
 		 584 aa  269  5e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0347  ABC transporter related  46.81 
 
 		 577 aa  268  8e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.818781  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2275  ABC transporter ATP-binding/permease  44.84 
 
 		 584 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2235  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  44.84 
 
 		 584 aa  267  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000997582  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3400  ABC transporter related  45.55 
 
 		 573 aa  266  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2443  ABC transporter permease/ATP-binding protein  44.84 
 
 		 584 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.176104  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2459  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  44.84 
 
 		 584 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2538  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  45.2 
 
 		 584 aa  266  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.809201  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1380  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  47.08 
 
 		 583 aa  267  2e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.595034  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09400  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  46.76 
 
 		 578 aa  266  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.780202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1817  ABC transporter related  46.49 
 
 		 589 aa  266  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000348827 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2933  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  46.62 
 
 		 584 aa  265  5e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220217 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0396  ABC transporter related protein  46.64 
 
 		 574 aa  265  8.999999999999999e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000464799  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2192  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  44.48 
 
 		 584 aa  263  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0786  ABC transporter related  45.77 
 
 		 577 aa  262  4e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757117  hitchhiker  0.00608544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6289  ABC transporter related protein  49.31 
 
 		 584 aa  261  8.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3940  ABC transporter related  46.1 
 
 		 595 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4014  ABC transporter related  46.1 
 
 		 595 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3954  ABC transporter related  46.1 
 
 		 595 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.320073  decreased coverage  0.00177663 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2249  ABC transporter related  44.01 
 
 		 584 aa  256  4e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000569913  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4440  ABC transporter-related protein  46.81 
 
 		 594 aa  254  9e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.153405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21640  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  43.94 
 
 		 585 aa  254  2.0000000000000002e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1691  ABC transporter related  46.02 
 
 		 580 aa  252  4.0000000000000004e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0843  ABC transporter related  47.18 
 
 		 577 aa  252  6e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.880512  normal  0.181945 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0265  ABC transporter ATP-binding protein  46.02 
 
 		 593 aa  250  2e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2351  ABC transporter related protein  45.42 
 
 		 581 aa  249  4e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.589414  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0842  ABC transporter related  43.88 
 
 		 594 aa  249  4e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2689  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  44.67 
 
 		 579 aa  249  5e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000864453  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  44.48 
 
 		 577 aa  248  6e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1501  ABC transporter, transmembrane region  44.01 
 
 		 578 aa  248  1e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.014393  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1221  ABC transporter related protein  45.94 
 
 		 576 aa  246  2e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1947  multidrug ABC transporter ATPase/permease  43.11 
 
 		 652 aa  246  3e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0369658  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2245  ABC transporter related  44.17 
 
 		 582 aa  246  4e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.767894  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1258  hypothetical protein  43.46 
 
 		 578 aa  244  9e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0421  ABC transporter related  45.33 
 
 		 600 aa  244  9.999999999999999e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0884  ABC transporter related  45.04 
 
 		 633 aa  244  9.999999999999999e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.827393  normal  0.037395 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0737  ABC transporter related  41.38 
 
 		 581 aa  242  6e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0823  ABC transporter related  44.72 
 
 		 589 aa  242  7e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000224084  hitchhiker  0.000000643029 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0346  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  42.51 
 
 		 579 aa  239  4e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00335685  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1884  ABC transporter related protein  44.88 
 
 		 578 aa  239  5e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3147  ABC transporter related protein  45.94 
 
 		 581 aa  238  9e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000208385  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1781  ABC transporter-related protein  44.37 
 
 		 584 aa  238  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0405926  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1237  ABC transporter related  44.52 
 
 		 583 aa  236  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2619  ABC transporter related  41.9 
 
 		 578 aa  237  2e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000800932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>