35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_669 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_669  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  253  4e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.209076  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0689  hypothetical protein  93.98 
 
 		 133 aa  224  3e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.281329  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0763  hypothetical protein  89.47 
 
 		 133 aa  211  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0276649  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0130  hypothetical protein  41.82 
 
 		 138 aa  87.8  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0261  hypothetical protein  38.79 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0266  hypothetical protein  37.93 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0899  putative transmembrane protein  38.4 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2331  hypothetical protein  39.13 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0417022  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2439  hypothetical protein  35.83 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0091  hypothetical protein  36.07 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1353  hypothetical protein  34.68 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0247445 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1193  hypothetical protein  37.9 
 
 		 135 aa  67  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2028  hypothetical protein  33.06 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0969  hypothetical protein  34.43 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.7704  normal  0.563021 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0462  hypothetical protein  32.2 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4836  membrane-like protein  34.11 
 
 		 135 aa  62  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1594  hypothetical protein  35.38 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02774  hypothetical protein  31.25 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3784  hypothetical protein  34.62 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.637465  normal  0.0246266 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2028  membrane protein-like protein  35.88 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.711582  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0351  hypothetical protein  32.28 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1122  hypothetical protein  32.79 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0934652 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1340  hypothetical protein  30.47 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.203581  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3588  hypothetical protein  30.95 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2326  hypothetical protein  30.6 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.306612  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1447  hypothetical protein  30.23 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2251  hypothetical protein  34.21 
 
 		 135 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3561  hypothetical protein  33.66 
 
 		 134 aa  50.4  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4918  hypothetical protein  26.83 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.484884 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1552  hypothetical protein  36.36 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.890317  normal  0.840659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3355  hypothetical protein  27.2 
 
 		 159 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0742  hypothetical protein  27.87 
 
 		 136 aa  43.5  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0731  hypothetical protein  29.41 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.356559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0388  hypothetical protein  38 
 
 		 134 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.965904  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2042  hypothetical protein  38 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>