20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_653 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_653  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  354  3.9999999999999996e-97  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.219356  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0676  putative small multi-drug export  78.45 
 
 		 183 aa  244  4e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0171339  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0746  hypothetical protein  77.33 
 
 		 177 aa  231  6e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00887458  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1376  putative small multi-drug exporter  48.3 
 
 		 168 aa  111  5e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.624297  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0906  putative small multi-drug export  42.42 
 
 		 170 aa  111  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000238574  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1583  putative small multi-drug export protein  41.36 
 
 		 170 aa  107  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0107  hypothetical protein  42.76 
 
 		 156 aa  98.6  5e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0599  putative small multi-drug export  42.07 
 
 		 150 aa  97.1  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03160  putative small multi-drug export  40.54 
 
 		 158 aa  96.3  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000160582  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1830  hypothetical protein  40.14 
 
 		 153 aa  94  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0295761  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2254  putative small multi-drug export  39.39 
 
 		 162 aa  90.5  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.696594  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1522  putative small multi-drug export  41.55 
 
 		 160 aa  87  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.724309  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0129  small multidrug export protein (QacE)  42.66 
 
 		 151 aa  86.7  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1529  putative small multi-drug export  40.85 
 
 		 160 aa  83.6  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.758792  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1515  putative small multi-drug export  40.85 
 
 		 160 aa  83.6  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.047767  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0683  putative small multi-drug export  33.33 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0671  hypothetical protein  39.26 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0912535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_7237  predicted protein  37.06 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1255  putative small multi-drug export  36.96 
 
 		 159 aa  64.3  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.135593 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0359  putative small multi-drug export  31.94 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>