57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_34 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0036  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  192  2e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_34  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  192  2e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0033  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  192  2e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1238  hypothetical protein  64.1 
 
 
86 aa  108  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.322027  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1720  hypothetical protein  61.54 
 
 
89 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09800  hypothetical protein  62.82 
 
 
84 aa  106  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2002  hypothetical protein  61.54 
 
 
89 aa  106  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1762  hypothetical protein  60.26 
 
 
96 aa  104  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4982  hypothetical protein  60.49 
 
 
88 aa  104  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0704941  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0891  hypothetical protein  57.14 
 
 
91 aa  103  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140966  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1699  hypothetical protein  56.04 
 
 
90 aa  103  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.919138  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1474  hypothetical protein  59.26 
 
 
88 aa  103  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0083649  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2319  protein of unknown function DUF370  58.97 
 
 
91 aa  102  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000309391  hitchhiker  0.00432553 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1792  hypothetical protein  60.53 
 
 
92 aa  102  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.783807  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3895  hypothetical protein  60.26 
 
 
91 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000521303  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4125  protein of unknown function DUF370  59.26 
 
 
91 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3427  hypothetical protein  58.02 
 
 
88 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1316  hypothetical protein  59.21 
 
 
93 aa  101  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1328  hypothetical protein  58.44 
 
 
89 aa  101  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00142046  normal  0.379596 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0191  hypothetical protein  58.23 
 
 
89 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.989709  normal  0.0888187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0196  hypothetical protein  58.23 
 
 
89 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1598  hypothetical protein  58.44 
 
 
95 aa  99.8  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000218541  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0839  protein of unknown function DUF370  58.44 
 
 
87 aa  99  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1027  hypothetical protein  54.88 
 
 
104 aa  97.1  7e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.925684 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1034  hypothetical protein  58.11 
 
 
102 aa  96.3  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2835  hypothetical protein  53.25 
 
 
83 aa  93.6  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0784  protein of unknown function DUF370  52 
 
 
85 aa  90.5  8e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000463016  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1947  hypothetical protein  49.35 
 
 
87 aa  90.5  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1057  hypothetical protein  50.65 
 
 
87 aa  90.1  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321011  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3886  hypothetical protein  52.56 
 
 
87 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000690373 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3723  hypothetical protein  52.56 
 
 
87 aa  90.1  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3613  hypothetical protein  52.56 
 
 
87 aa  90.1  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3631  hypothetical protein  52.56 
 
 
87 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4010  hypothetical protein  52.56 
 
 
87 aa  90.1  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3915  hypothetical protein  52.56 
 
 
87 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1272  hypothetical protein  52.56 
 
 
87 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0794457  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3695  hypothetical protein  52.56 
 
 
87 aa  90.1  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2524  hypothetical protein  52.56 
 
 
87 aa  90.1  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3971  hypothetical protein  52.56 
 
 
87 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00678821  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3920  hypothetical protein  52.56 
 
 
87 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.497874  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1444  protein of unknown function DUF370  54.67 
 
 
85 aa  90.1  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.653976  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1678  hypothetical protein  53.42 
 
 
93 aa  88.6  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0986  hypothetical protein  54.79 
 
 
92 aa  88.2  4e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00163682  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1144  hypothetical protein  54.79 
 
 
92 aa  88.2  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31075  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0100  hypothetical protein  50.68 
 
 
94 aa  87  7e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.146672  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3631  hypothetical protein  50.6 
 
 
94 aa  86.3  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.890852  normal  0.0973296 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1405  hypothetical protein  44.87 
 
 
84 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2901  hypothetical protein  48 
 
 
85 aa  84  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1139  hypothetical protein  44 
 
 
88 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.975063 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0099  hypothetical protein  50.68 
 
 
95 aa  83.2  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0891716  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2720  hypothetical protein  46.58 
 
 
84 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0117967  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2085  hypothetical protein  44 
 
 
86 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  decreased coverage  0.00778946 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2880  hypothetical protein  44 
 
 
91 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000567496  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0295  hypothetical protein  43.24 
 
 
88 aa  77  0.00000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1911  hypothetical protein  41.18 
 
 
97 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000344379  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2947  protein of unknown function DUF370  44.44 
 
 
79 aa  72  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0044  protein Dvul_2085  34.25 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0851957 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>