11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_293 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0332  phage portal protein, SPP1  92.29 
 
 		 454 aa  868    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000139812  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_293  phage domain protein  100 
 
 		 454 aa  923    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000155702  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0354  phage domain-containing protein  97.78 
 
 		 303 aa  545  1e-154  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000288808  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1769  hypothetical protein  46.97 
 
 		 435 aa  346  4e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2385  phage protein  23.13 
 
 		 505 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1461  hypothetical protein  22.2 
 
 		 413 aa  53.9  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0655  hypothetical protein  25.16 
 
 		 457 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1600  hypothetical protein  24.2 
 
 		 459 aa  51.2  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000221209  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2508  hypothetical protein  22.49 
 
 		 470 aa  47.4  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0374  phage portal protein, SPP1  20.64 
 
 		 440 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2128  phage portal protein, SPP1  20.49 
 
 		 440 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>